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公开(公告)号：CN116515999A
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202211372524.4
申请日：2022-11-03
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6844 , A61K49/00
Abstract: 本发明公开了一种基于DNA条形码技术的体内T细胞分化谱系追踪方法，包括如下步骤：a)随机SW文库的构建；b)文库的转染；c)示踪肿瘤免疫治疗T细胞的分化情况。通过T细胞追踪分化研究，能够揭示T细胞的浸润、衰竭、归巢特征，从而能够选择某一特定适合免疫治疗的T细胞，为改善过继性细胞免疫治疗奠定实验基础。
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公开(公告)号：CN112626213A
公开(公告)日：2021-04-09
申请号：CN202011584722.8
申请日：2020-12-28
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明属于肝癌多基因检测的技术领域，公开了一种基于二代测序技术的肝癌检测panel，利用基因探针杂交法富集其中557个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，并进行高深度测序，从而精准检测其中与肝癌有明确临床相关性的基因突变、拷贝数变异等事件，并将该多基因筛选列表做成探针，通过DNA测序针对性地检测高危基因，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因突变，对临床的诊断和发现靶向治疗的靶点具有重要指导意义。
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公开(公告)号：CN111996257A
公开(公告)日：2020-11-27
申请号：CN202010929700.4
申请日：2020-09-07
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于胃癌多基因检测的技术领域，公开了一种基于二代测序技术的胃癌检测panel，利用基因探针杂交法富集其中557个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，并进行高深度测序，从而精准检测其中与胃癌有明确临床相关性的基因突变、拷贝数变异等事件，并将该多基因筛选列表做成探针，通过DNA测序针对性地检测高危基因，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因突变，对肿瘤患者进行精准分型，同时也可能帮助某些肿瘤患者参加到临床试验中。
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公开(公告)号：CN111690741A
公开(公告)日：2020-09-22
申请号：CN201910188073.0
申请日：2019-03-13
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B25/20
Abstract: 本发明公开了一种乳腺癌多基因筛选探针，其是通过如下方法制备得到的：针对乳腺癌高发的高危突变基因，下载各个基因外显子编码序列，在3’端和5’端各增加100bp的侧翼序列；利用Oligowiz2.0软件处理基因序列，获得Output.owz文件；利用OligoWiz-2.1.0_OFFLINE.jar软件在windows系统下打开上述Output.owz文件，选择最小探针间距为40bp，最大探针数量为无限制，其余参数都使用默认值，导出探针列表；在探针5’端添加一条SEQ NO.1的引物序列，3’端添加一条SEQ NO.2的引物序列，然后合成探针。本发明乳腺癌多基因筛选探针，可以为乳腺癌患者的临床诊断提供有力的用药指导，方便精准制定治疗方案。
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公开(公告)号：CN110616252A
公开(公告)日：2019-12-27
申请号：CN201910964223.2
申请日：2019-10-11
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种基于突变-编码文库的高通量筛选方法，包括将含有人全长基因突变的载体和含有特异性条形码的载体通过LR反应构建重组载体，之后转导入宿主细胞中，经过抗性筛选处理，抗药性实验，提取基因组，PCR纯化和测序处理的步骤；本发明针对功能性突变的高通量筛选这一空白领域，原创性地建立了突变编码高通量文库技术，能够准确、高效地挖掘功能性突变，从而为突变数据的精准解读提供有力的平台保障，对临床的诊断和发现靶向治疗的靶点具有重要指导意义。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118262794A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202410027114.9
申请日：2024-01-08
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种基于神经网络的系统性量化突变对表达谱影响的方法，该方法是利用神经网络的方法解析癌症中体细胞突变和拷贝变异数与基因表达图谱的量化关系，可以通过方法构建的模型通过对突变扰动分析预测其表达谱，也可以量化突变的功能效应，这对临床的病理鉴定和个性化治疗具有重要的借鉴价值，为临床的精准治疗提供新的解决思路。
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公开(公告)号：CN118098362A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410026706.9
申请日：2024-01-08
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种量化计算肿瘤异质性受内外源因素影响的方法，基于主题模型的分析框架来解析的表达谱数据的异质性表型，找到与细胞异质性状态相关的特征分布，并对特征的生物学功能意义进行注释，再通过构建特征与细胞内在因素与外在因素的回归模型，获取每个特征下内外源因素的影响程度，进而量化特定状态特征下不同来源的关键驱动因子的影响。通过该方法对临床的病理鉴定和个性化治疗具有重要的借鉴价值，为临床的精准治疗提供新的解决思路。
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公开(公告)号：CN112831563A
公开(公告)日：2021-05-25
申请号：CN202110172719.3
申请日：2021-02-08
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , G01N33/574
Abstract: 本发明属于结直肠癌检测技术领域，公开了一种遗传性结直肠癌的检测panel及检测试剂盒，检测panel中包括林奇综合征、家族性腺瘤性息肉病、MUTYH‑相关息肉病、少年息肉病综合征、多发性错构瘤综合征、黑斑息肉综合征、锯齿状息肉病综合征、聚合酶校对功能相关息肉病、佛美尼综合症、常染色体隐性息肉病、遗传性乳腺癌、卵巢癌总而后者、家族性非典型多痣黑色素瘤综合征、遗传性弥漫性胃癌综合征、高/中度外显基因等相关基因。同时，试剂盒中包括检测panel中的检测试剂及其他成分。通过判断本发明提供的panel中各个基因的存在情况以及存在量，可进一步得知受试者的患病风险，从而达到早期监测早期防治的目的。
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公开(公告)号：CN111979329A
公开(公告)日：2020-11-24
申请号：CN202010928833.X
申请日：2020-09-07
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Inventor： 胡夕春 , 郭伟剑 , 陶中华 , 张剑 , 常建华 , 张群岭 , 张晓伟 , 罗志国 , 胡志皇 , 曹军宁 , 王佳蕾 , 吴向华 , 邵志敏 , 黄薇 , 胡欣 , 施锦绣 , 裴雨晨 , 王云锦
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874
Abstract: 本发明属于泛癌多基因检测技术领域，公开了一种基于二代测序技术的泛癌检测panel，利用基因探针杂交法富集141个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，旨在达到精准检测，更重要的是本发明的检测对象为患者DNA，将ctDNA与基因panel结合作为检查对象，可以实现针对性检测，也可以降低患者基因检测的成本和实验员的操作难度。同时，将该多基因筛选列表做成探针，通过杂交捕获测序针对性地检测高危基因，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因突变，同时也可能帮助某些肿瘤患者参加临床试验，对临床的诊断和发现靶向治疗的靶点具有重要指导意义。
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公开(公告)号：CN111172288A
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN202010177377.X
申请日：2020-03-13
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/50
Abstract: 本发明克服目前临床应用中仅对单个或几个激酶基因突变点做预测，不能满足实际临床检测诊断需求的问题，提供一种大肠癌多基因筛选探针，以及大肠癌基因筛选的方法及试剂盒，以达到高效检测基因突变，对大肠癌患者精准分型，并降低患者基因检测成本的目的。
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