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公开(公告)号：CN111996257A
公开(公告)日：2020-11-27
申请号：CN202010929700.4
申请日：2020-09-07
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于胃癌多基因检测的技术领域，公开了一种基于二代测序技术的胃癌检测panel，利用基因探针杂交法富集其中557个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，并进行高深度测序，从而精准检测其中与胃癌有明确临床相关性的基因突变、拷贝数变异等事件，并将该多基因筛选列表做成探针，通过DNA测序针对性地检测高危基因，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因突变，对肿瘤患者进行精准分型，同时也可能帮助某些肿瘤患者参加到临床试验中。
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公开(公告)号：CN111793695A
公开(公告)日：2020-10-20
申请号：CN202010866899.0
申请日：2020-08-25
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , G16B30/10
Abstract: 本申请公开了肠癌分子分型系统。该系统包括：(1)测序文库构建模块，用于从样品RNA构建测序文库；(2)定量测序模块，用于对所述测序文库进行定量和测序；(3)归一化模块，用于对定量和测序结果进行归一化；和(4)CMS分型模块，用于对归一化结果进行分子分型。
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公开(公告)号：CN115188415B
公开(公告)日：2024-12-20
申请号：CN202210817322.X
申请日：2022-07-12
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明涉及一种基于免疫特征的肠癌分子分型方法和装置，方法包括以下步骤：获取结直肠癌的队列数据、基因表达谱和临床信息数据；获取免疫相关特性，基于该该免疫相关特征的富集分数从获取的结直肠癌的队列数据、基因表达谱和临床信息数据中，获取预后相关免疫特征；根据预后相关免疫特征进行亚型鉴定和验证；根据获取的亚型对患者信息数据进行分类，确定肠癌表型。与现有技术相比，本发明结直肠癌分子分型精准度高、可靠性高等优点。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114373548A
公开(公告)日：2022-04-19
申请号：CN202210105091.X
申请日：2022-01-28
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明涉及一种基于代谢基因建立的胰腺癌预后风险预测方法和装置，方法包括以下步骤：获取GJB5基因表达水平数据、MET基因表达水平数据、TMEM139基因表达水平数据和AFF3基因表达水平数据，从而计算胰腺癌患者的预后风险评分。与现有技术相比，本发明提出的4基因模型具有较强的鲁棒性，能够在不同平台的数据集中发挥稳定的预测效能，具有效能优良、检测基因数少等优点。
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公开(公告)号：CN117947166A
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202410127289.7
申请日：2024-01-30
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本文提供了用于肠癌预后的标志物组、产品、系统及其用途。具体地，本文提供了一种用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组，其包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂，所述标志物组具有以下14种基因标志物：IFIT3、CXCL13、STAT1、CXCL9、CA4、AQP8、SLC4A4、AREG、EREG、SPINK4、REG4、SFRP2、ZEB2和SFRP4。本文提供了低成本、高效率、高质量的肠癌预后评估手段。
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公开(公告)号：CN117670794A
公开(公告)日：2024-03-08
申请号：CN202311425323.0
申请日：2023-10-30
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: G06T7/00 , G06T7/12 , G06T7/13 , G06T7/33 , G06V10/762 , G06V10/764 , G16H30/40 , G06V20/69 , G06N3/0464
Abstract: 本发明涉及一种基于深度学习的TLS病理检测方法、装置及介质，其中方法包括以下步骤：获取病理学切片并进行IHC染色和全切片扫描，获得全视野数字切片图像；对全视野数字切片图像进行染色分析，划分TLS区域，并进行连续切片配准，得到自动标注TLS区域的H&E染色切片图像，作为标注图像数据；根据标注图像数据构建数据集，对基于EfficientNet深度学习网络的检测模型进行训练和测试，输出H&E染色切片上TLS区域位置；对检测模型输出的结果基于聚类进行边缘预测再处理，得到最终TLS区域位置。与现有技术相比，本发明具有检测精度高、无需人工标注等优点。
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公开(公告)号：CN115188415A
公开(公告)日：2022-10-14
申请号：CN202210817322.X
申请日：2022-07-12
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明涉及一种基于免疫特征的肠癌分子分型方法和装置，方法包括以下步骤：获取结直肠癌的队列数据、基因表达谱和临床信息数据；获取免疫相关特性，基于该该免疫相关特征的富集分数从获取的结直肠癌的队列数据、基因表达谱和临床信息数据中，获取预后相关免疫特征；根据预后相关免疫特征进行亚型鉴定和验证；根据获取的亚型对患者信息数据进行分类，确定肠癌表型。与现有技术相比，本发明结直肠癌分子分型精准度高、可靠性高等优点。
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公开(公告)号：CN114496097A
公开(公告)日：2022-05-13
申请号：CN202210104897.7
申请日：2022-01-28
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明涉及一种胃癌代谢基因预后预测方法和装置，方法包括以下步骤：获取待测样本基因组RNA，对多个基因的表达水平进行检测，所述多个基因包括DYNC1I1基因、GPER1基因、MFAP2基因、ARRB1基因、C3基因和GLI1基因；根据检测出的多个基因的表达水平，计算胃癌预后风险评分。与现有技术相比，本发明第一次通过代谢相关基因DYNC1I1，GPER1，MFAP2，ARRB1，C3，GLI1预测胃癌患者的临床预后状态，具有效能优良、检测基因数少、鲁棒性高等优点。
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