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公开(公告)号:CN118262794A
公开(公告)日:2024-06-28
申请号:CN202410027114.9
申请日:2024-01-08
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种基于神经网络的系统性量化突变对表达谱影响的方法,该方法是利用神经网络的方法解析癌症中体细胞突变和拷贝变异数与基因表达图谱的量化关系,可以通过方法构建的模型通过对突变扰动分析预测其表达谱,也可以量化突变的功能效应,这对临床的病理鉴定和个性化治疗具有重要的借鉴价值,为临床的精准治疗提供新的解决思路。
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公开(公告)号:CN118098362A
公开(公告)日:2024-05-28
申请号:CN202410026706.9
申请日:2024-01-08
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种量化计算肿瘤异质性受内外源因素影响的方法,基于主题模型的分析框架来解析的表达谱数据的异质性表型,找到与细胞异质性状态相关的特征分布,并对特征的生物学功能意义进行注释,再通过构建特征与细胞内在因素与外在因素的回归模型,获取每个特征下内外源因素的影响程度,进而量化特定状态特征下不同来源的关键驱动因子的影响。通过该方法对临床的病理鉴定和个性化治疗具有重要的借鉴价值,为临床的精准治疗提供新的解决思路。
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公开(公告)号:CN118486480A
公开(公告)日:2024-08-13
申请号:CN202311696169.0
申请日:2023-12-11
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明提供了一种中国乳腺易感基因预测模型(the Chinese BCDG Calculator)的建立方法及其应用。运用本发明的预测模型只需要将被预测人的各预测因子,包括:诊断年龄、病理学特征(包括组织学分级、肿瘤大小、淋巴结状态、远处转移、ER、PR、HER2状态和Ki‑67增殖指数)、对侧乳腺癌史、家族性乳腺癌或卵巢癌病史和其他的整家族史输入,即可预测其乳腺癌易感基因的胚系突变及“二次打击”状态,进而预测治疗反应及临床结局。对中国人群乳腺癌的初步遗传咨询和精准治疗选择均具有重要的临床意义。
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