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公开(公告)号:CN115458054A
公开(公告)日:2022-12-09
申请号:CN202211290674.0
申请日:2022-10-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明涉及基于SIGMA+预测突变致病性分析方法、系统及设备。包括:获取待预测基因的突变;将待预测基因的突变映射到待预测基因的蛋白结构上,得到映射了突变的蛋白结构;将映射了突变的蛋白结构输入SIGMA模型,得到待预测基因的结构特征得分;再将待预测基因的突变输入预测器,得到待预测基因的变异效应得分;将待预测基因的结构特征得分和变异效应得分输入分类器,得到突变为致病突变或良性突变的分类结果。本发明方法旨在基于待预测基因的突变和映射了突变的蛋白结构信息将SIGMA与其他预测器相结合,发掘其对突变致病性的高预测能力和潜在应用价值。
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公开(公告)号:CN112626190B
公开(公告)日:2022-05-24
申请号:CN202011101803.8
申请日:2020-10-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11 , C12N15/12
Abstract: 本发明公开了一种检测样本中基因突变位点的试剂在制备诊断MRKH综合征I型试剂盒中的应用,所述基因突变位点为TBX6基因上的突变位点c.423G>A。专利权人通过对442名MRKH受试患者进行外显子组测序,首次在TBX6基因上发现了该突变位点c.423G>A;经验证,该突变位点c.423G>A会导致TBX6基因转录过程中mRNA上四号外显子起始端71bp碱基缺失,引起剪接异常,使基因表达产物因丧失功能而引发MRKH。因此通过采集受检者外周血,获取DNA,通过Sanger测序检测TBX6基因上是否存在该突变位点c.423G>A,即可辅助MRKH综合征的快速诊断。
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公开(公告)号:CN110628897B
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN201911012812.7
申请日:2019-10-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与KFS相关的VANGL1基因的SNP突变位点,并提供一种检测VANGL1易感SNP位点基因型的试剂。进一步,本发明公开了一种KFS辅助诊断的试剂盒。本发明筛选了KFS相关的易感基因的SNP位点并提供其在KFS诊断中的应用,阐述SNP对于KFS进展的影响,揭示其在诊断、治疗中价值。因此,本发明可开发出利用SNP基因型对KFS的诊断进行检测的试剂盒和生物制剂,不仅能够快速有效的做到早期诊断,其精确度大大提高,而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据。
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公开(公告)号:CN110628898B
公开(公告)日:2022-02-22
申请号:CN201911013740.8
申请日:2019-10-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与KFS相关的BAZ1B易感SNP突变位点,并提供一种检测BAZ1B易感SNP位点基因型的试剂。进一步,本发明公开了一种KFS辅助诊断的试剂盒。本发明筛选了KFS相关的易感基因的SNP位点并提供其在KFS诊断中的应用,阐述SNP对于KFS进展的影响,揭示其在诊断、治疗中价值。因此,本发明可开发出利用SNP基因型对KFS的诊断进行检测的试剂盒和生物制剂,不仅能够快速有效的做到早期诊断,其精确度大大提高,而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据。
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公开(公告)号:CN110272994B
公开(公告)日:2021-01-26
申请号:CN201910636357.1
申请日:2019-07-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种CVM相关的基因突变。本发明通过二代测序技术首次发现了CVM患者基因组DNA上存在MYH3基因c.841G>A突变。根据上述研究成果,本发明开发了一种诊断CVM的产品,该产品通过检测受试者基因组DNA上MYH3基因c.841位点的基因型即可判断受试者是否患有CVM,该产品可应用于临床。
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公开(公告)号:CN111910004A
公开(公告)日:2020-11-10
申请号:CN202010817342.8
申请日:2020-08-14
Applicant: 中国科学院大学温州研究院(温州生物材料与工程研究所) , 中国医学科学院肿瘤医院 , 中国医学科学院北京协和医院 , 黑龙江省肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16H50/20 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用,本发明公开了诊断乳腺癌具有较高敏感性和特异性的cfDNA标志物以及基于该标志物制备的诊断乳腺癌的产品;本发明同时公开了筛选癌症标志物的方法。
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公开(公告)号:CN110628897A
公开(公告)日:2019-12-31
申请号:CN201911012812.7
申请日:2019-10-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与KFS相关的VANGL1基因的SNP突变位点,并提供一种检测VANGL1易感SNP位点基因型的试剂。进一步,本发明公开了一种KFS辅助诊断的试剂盒。本发明筛选了KFS相关的易感基因的SNP位点并提供其在KFS诊断中的应用,阐述SNP对于KFS进展的影响,揭示其在诊断、治疗中价值。因此,本发明可开发出利用SNP基因型对KFS的诊断进行检测的试剂盒和生物制剂,不仅能够快速有效的做到早期诊断,其精确度大大提高,而且为基因治疗、药物治疗等临床应用提供了治疗靶点和重要依据。
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公开(公告)号:CN108920901B
公开(公告)日:2019-10-01
申请号:CN201810891475.2
申请日:2018-08-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: G16B25/00
Abstract: 本发明涉及一种测序数据分析系统,所述分析系统包括文件重命名模块、质量控制模块、序列比对模块、突变检测模块、突变注释模块、打分评级模块、过滤模块、突变评论备注模块;所述系统针对单样本或者家系样本,能够从测序原始下机的fastq格式数据检测和注释突变,并对突变进行打分,经过质量控制后,最终得到包含样本所有的突变及其注释信息和打分信息,以及包含样本所有罕见突变及其注释信息和打分信息的文件,便于更快速、准确、全面地挖掘测序数据中的信息。
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公开(公告)号:CN110184347A
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201910637157.8
申请日:2019-07-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 先天性脊柱畸形的诊断标记。本发明公开了用以诊断CVM的生物标记,所述生物标记是MYH3基因突变。本发明经过二代测序发现,CVM患者基因组中MYH3基因c.1400位点由A变成了C,且经过功能验证证明上述突变是CVM的致病突变,因此上述基因突变可以成为诊断CVM的生物标记。
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公开(公告)号:CN108752452A
公开(公告)日:2018-11-06
申请号:CN201810598828.X
申请日:2018-06-12
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京市神经外科研究所
CPC classification number: C07K14/47 , A61K38/00 , A61P9/00 , A61P9/10 , G01N33/6893 , G01N2800/2871
Abstract: 本发明公开了SARS及其突变体的应用,本发明首次在BAVM患者中发现了SARS新突变c.971T>C,且通过实验证明该突变为致病突变,当存在该突变时可以诊断该患者为BAVM;本发明同时发现了敲低SARS,可以引起BAVM,而增加SARS的表达水平可以缓解BAVM的症状,提示SARS可以应用于BAVM的诊疗。
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