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公开(公告)号：CN119736245A
公开(公告)日：2025-04-01
申请号：CN202411935507.6
申请日：2024-12-26
Applicant: 厦门大学
IPC: C12N5/09 , G01N33/569 , G01N21/64
Abstract: 本发明公开了一种微流控芯片中肿瘤组织培养及细胞外囊泡分型分析方法，包括如下步骤：步骤一，提供两条适体探针，包括结合PD‑L1蛋白的适体PD‑L1‑L(修饰第二荧光基团)、结合EpCAM蛋白的适体EpCAM‑L以及一条连接臂(包含荧光淬灭基团和第一荧光基团)，步骤二，在芯片中培养肿瘤组织，并通过芯片上修饰的抗体捕获肿瘤组织分泌的细胞外囊泡；步骤三，肿瘤组织和两条适体探针孵育后再和连接臂孵育，肿瘤细胞产生第一荧光恢复，第二荧光淬灭的双开关模式，从而鉴定肿瘤细胞来源的细胞外囊泡；免疫细胞PD‑L1‑L的第二荧光保持，连接臂的第一荧光淬灭。从而进行肿瘤组织细胞外囊泡分型分析。
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公开(公告)号：CN119432990A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411881341.4
申请日：2024-12-19
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种组织切片的空间转录组原位测序方法，涉及基因测序领域，包括：1)原位捕获mRNA；2)逆转录得cDNA；3)去组织保留cDNA；4)cDNA探针杂交；5)原位扩增；6)荧光探针解码测序；7)清洗探针，多轮测序。本发明原位捕获RNA并逆转录为cDNA，实现核酸印迹转移，去除背景干扰，解决RNA降解问题，允许多轮杂交增检测通量。核酸序列共价结合玻片，防信号点移位脱落。用DNA编码挂锁探针识别基因，扩增放大信号，测序解码揭示基因表达。清洗探针后，换探针杂交扩增，提高通量，减少空间拥挤和荧光信号拥挤。
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公开(公告)号：CN119020477A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202411341166.X
申请日：2024-09-25
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12M1/36 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明属于数字微流控技术领域，具体公开了一种基于数字微流控芯片的自动化高通量单细胞转录组建库方法。本发明基于微纳升反应体积的数字微流控芯片进行高通量单细胞转录组测序文库构建，数字微流控芯片中极小的纳升级的反应体积可以极大提升有效反应浓度，提高转录组检测能力，解决单细胞样本低丰度的检测限制，同时还可以有效降低试剂的消耗量，进一步降低测序成本；实现了基于数字微流控技术的高通量单细胞转录组测序，具有自动化程度高、低成本的优势，解决了现有微流控技术通量较低的难题。
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公开(公告)号：CN118345146A
公开(公告)日：2024-07-16
申请号：CN202410516271.6
申请日：2024-04-26
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6804 , G01N15/1404 , C12Q1/6806
Abstract: 一种基于数字微流控技术的全自动细胞DNA与蛋白质相互作用分析方法，包括以下步骤：1)DMF芯片的制备；2)细胞捕获；3)抗体孵育；4)pA‑Tn5标记；5)片段富集和文库构建。本发明通过程序化操纵液滴的分配、移动和混合，可在单个DMF芯片上集成并自动化整个工作流程；通过构建超疏水界面，减少多步磁分离过程中的核酸吸附，有效提高细胞利用率和降低分析的起始细胞数量，从而提高检测灵敏度；通过构建封闭的亚微升反应空间，可以提高参与反应的DNA片段的有效浓度，隔绝外源性污染物，并将试剂消耗量降低了12倍。
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公开(公告)号：CN117887805A
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202410053121.6
申请日：2024-01-15
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6804
Abstract: 本发明公开了一种组织细胞外囊泡的原位捕获和成像方法，包括如下步骤：步骤一，在载体上修饰抗体，所述抗体能够和组织中的囊泡结合；步骤二，组织进行切片，并在步骤一的载体上进行孵育，使囊泡被载体上修饰的抗体捕获；步骤三，添加核酸适配体，所述的核酸适配体具有一识别区以及一延长链，所述识别区能够识别捕获到的囊泡的膜蛋白；步骤四，利用核酸适配体延长链作为模板，进行RCA反应；步骤五，加入荧光探针，使其与步骤四的RCA产物结合，从而产生荧光信号，从而实现对组织细胞外囊泡的成像。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116994245A
公开(公告)日：2023-11-03
申请号：CN202310961931.7
申请日：2023-08-02
Applicant: 厦门大学
IPC: G06V20/69 , G06V10/82 , G06V10/762 , G06V10/24 , G06N3/0455 , G06N3/0499 , G06N3/08 , G06T17/00
Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的空间转录组分析方法、装置及可读介质，通过构建实例分割神经网络并训练，得到细胞核分割模型，实例分割神经网络包括层次变换编码器和全连接解码器，细胞核图像输入细胞核分割模型，得到细胞核分割结果，并确定细胞的位置信息；获取由空间转录组学生成的核糖核酸分子的坐标，根据细胞核分割结果和核糖核酸分子的坐标将每个核糖核酸分子分配给与其距离最短的细胞，并形成单细胞表达矩阵；根据单细胞表达矩阵对细胞进行细胞类型注释，得到细胞类型，根据细胞类型和细胞的位置信息识别得到解剖区域；采用点云技术进行三维可视化，重建组织或器官表面轮廓，该方法能够快速且准确的进行细胞分割。
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公开(公告)号：CN115386621A
公开(公告)日：2022-11-25
申请号：CN202210705640.7
申请日：2022-06-21
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种测序技术中的文库制备方法，通过对固相微球上的cDNA链进行等温延伸，将微球上的cDNA单链变成双链，然后再以双链为模板进行PCR扩增。由于第二条合成的cDNA链并没有与微球共价连接，只是与第一条cDNA互补，因此，在PCR时95℃的高温变性时，第二条链就会进入溶液相，进行“液‑液”相扩增。由于扩增之前，对微球上的cDNA进行了二链合成，所以经过高温变性，微球的cDNA会同时脱落，进入溶液相进行“液‑液”相扩增，这样就解决了之前扩增时以固相微球上的单链cDNA模板进行扩增导致的扩增偏差问题。本发明可增加文库中cDNA种类的丰富度，增加基因的检出数。
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公开(公告)号：CN115141788A
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202210761852.7
申请日：2022-06-30
Abstract: 本发明公开了一种对靶细胞进行定向保护的方法，其包括如下步骤：使用至少两种的包含DNA序列的识别分子、核酸连接序列、HCR活性组件，所述识别分子包含可触发杂交链式反应的关联足趾DNA序列，所述HCR活性组件可与关联足趾DNA序列发生杂交链式反应，所述HCR活性组件包含DNA发卡链，至少一种所述DNA发卡链末端包含有一个以上偶联有含羧基聚合物；所述步骤包含所述识别分子对所述靶细胞进行靶向识别结合，所述至少两种识别分子在结合至所述靶细胞表面后通过所述核酸连接序列杂交连接，并触发所述识别分子与所述HCR活性组件进行杂交链式反应，在所述靶细胞外围形成壳层。本发明能够细胞表面形成保护层，加强了细胞的保护作用。
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公开(公告)号：CN113252616B
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202110127881.3
申请日：2021-01-29
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了一种外泌体的糖基化研究方法，包括如下步骤：1)将分泌外泌体的细胞与非天然单糖共培养，细胞泌出含有非天然单糖的外泌体；2)将功能性探针标记到非天然糖上,所述的功能性探针具有第一标记；3)检测第一标记，获取外泌体信息。本发明方法操作简单，无需复杂的样品前处理；且无需裂解外泌体。
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公开(公告)号：CN113070107B
公开(公告)日：2022-03-29
申请号：CN202110203290.X
申请日：2021-02-23
Applicant: 厦门大学
IPC: B01L3/00
Abstract: 本发明公开了一种用于精准组装单微粒的微流控芯片及单微粒组装方法。所述微流控芯片结构包括通道层和封闭层。其中通道层结构包含两条并行独立的通道，分别含有捕获通道、环形旁路、组装腔室。其操作步骤包括：(1)进行单微粒的捕获(2)通过反向通溶液，转移单微粒到组装腔体(3)经过多次的捕获和转移，实现多细胞的组装。该芯片基于流体力学原理可以实现高效的单细胞捕获，通过流体流向的控制，操纵单微粒的组装，经过多次重复捕获和组装，即可实现精准的单微粒组装。该发明可应用于单细胞RNA测序、单细胞共培养、细胞分泌蛋白检测、单细胞相互作用分析等研究应用领域。
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