公开(公告)号：CN116994245A

公开(公告)日：2023-11-03

申请号：CN202310961931.7

申请日：2023-08-02

Applicant: 厦门大学

Inventor： 杨朝勇 ,  王晓宇 ,  伍炤润 ,  钟智星

IPC: G06V20/69 ,  G06V10/82 ,  G06V10/762 ,  G06V10/24 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/0499 ,  G06N3/08 ,  G06T17/00

Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的空间转录组分析方法、装置及可读介质，通过构建实例分割神经网络并训练，得到细胞核分割模型，实例分割神经网络包括层次变换编码器和全连接解码器，细胞核图像输入细胞核分割模型，得到细胞核分割结果，并确定细胞的位置信息；获取由空间转录组学生成的核糖核酸分子的坐标，根据细胞核分割结果和核糖核酸分子的坐标将每个核糖核酸分子分配给与其距离最短的细胞，并形成单细胞表达矩阵；根据单细胞表达矩阵对细胞进行细胞类型注释，得到细胞类型，根据细胞类型和细胞的位置信息识别得到解剖区域；采用点云技术进行三维可视化，重建组织或器官表面轮廓，该方法能够快速且准确的进行细胞分割。