公开(公告)号：CN111793681A

公开(公告)日：2020-10-20

申请号：CN202010758304.X

申请日：2020-07-31

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 何军 ,  邱桥成

IPC: C12Q1/6881 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种HLA-B位点等位基因分型试剂盒及其检测方法，该试剂盒包括用于扩增覆盖HLA-B位点第2,3,4外显子区域的扩增引物，以及分别针对第2,3,4外显子区域的特异性测序引物。该检测方法通过扩增引物对DNA样本进行扩增，然后分别使用针对HLA-B位点第2,3,4外显子区域的测序引物对扩增产物中的第2,3,4外显子进行测序，将得到的测序结果与数据库比对得到HLA-B位点等位基因型。该方法可以使用扩增引物直接针对HLA-B位点进行扩增及使用测序引物第2,3,4外显子区域进行测序，获得B位点上各种等位基因型，避免了与其同源性极高的HLA-A,C位点基因序列的干扰，提高了分型结果的准确性。

公开(公告)号：CN112662771B

公开(公告)日：2024-04-02

申请号：CN202011601688.0

申请日：2020-12-30

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 沈宏杰 ,  王曼 ,  陈苏宁 ,  邱桥成 ,  丁子轩 ,  解珺丹 ,  马亮 ,  姚红 ,  江艾蕊

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种肿瘤融合基因的靶向捕获探针及其应用。利用本发明探针组合，结合高通量测序技术，能够检测转录水平BCR、ABL1、RUNX1、CBFB、PML、RARA和KMT2A相关的融合基因，检出率高、灵敏度高、检测周期短、检测成本低，其中，检测灵敏度达到百分之一以上。

公开(公告)号：CN109055504A

公开(公告)日：2018-12-21

申请号：CN201810938968.7

申请日：2018-08-17

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 何军 ,  李颖 ,  邱桥成 ,  鲍晓晶

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6881 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6881 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2565/125

Abstract: 本发明属于生物检测领域，具体涉及一种KIR2DS3 mRNA的荧光定量PCR检测方法及其检测试剂盒，引物及探针的设计方法包括以下步骤：（1）运用PCR‑SSOP方法对DNA样本进行KIR基因分型，筛选出KIR2DS3阳性DNA；（2）将阳性DNA样本进行PCR扩增、电泳；（3）提取KIR2DS3特异性DNA条带，经割胶、纯化后与T载体连接，经转化、挑选菌群后抽取质粒测序；（4）测序结果与KIR/IPD数据库进行比对，证实其为特征性基因序列；（5）根据特征性KIR2DS3基因序列，运用引物设计软件，设计出引物及探针。使用设计出的引物及探针进行基因检测。该方法提高了PCR检测的特异性和准确率。

公开(公告)号：CN108949962A

公开(公告)日：2018-12-07

申请号：CN201810938966.8

申请日：2018-08-17

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 何军 ,  李颖 ,  邱桥成 ,  王甜

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2563/107

Abstract: 本发明属于生物检测领域，具体涉及一种KIR2DS5 mRNA的荧光定量PCR检测方法及其检测试剂盒，引物和探针的设计方法包括以下步骤：（1）运用PCR‑SSOP方法对DNA样本进行KIR基因分型，筛选出KIR2DS5阳性DNA；（2）将阳性DNA样本进行PCR扩增、电泳；（3）提取KIR2DS5特异性DNA条带，经割胶、纯化后与T载体连接，经转化、挑选菌群后抽取质粒测序；（4）测序结果与KIR/IPD数据库进行比对，证实其为特征性基因序列；（5）根据特征性KIR2DS5基因序列，运用引物设计软件，设计出引物和探针。使用设计出的引物和探针进行基因检测。该方法提高了PCR检测的特异性和准确率。

公开(公告)号：CN101892317B

公开(公告)日：2012-08-22

申请号：CN201010239605.8

申请日：2010-07-29

Applicant: 苏州大学 ,  苏州大学附属第一医院

Inventor： 邱桥成

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种人类白细胞抗原基因的分型方法，包括以下步骤：(1)按照常规技术提取待测基因组DNA，使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段：HLA-A的2，3，4外显子，HLA-B的2，3，4外显子和HLA-DRB1位点2外显子；(2)使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增，扩增各外显子，然后对扩增出的各外显子进行测序，并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较，从而确定基因分型结果；由于本发明HLA基因测序试剂盒以及测试条件的优化组合，有效地扩增HLA-A，B位点的2，3，4外显子和HLA-DRB1位点2外显子，并对相应外显子进行测序，因此在进一步进行分型时，能够避免当某几个等位基因核苷酸位于扩增区域之外时无法进行有效分型的问题，提高了对HLA基因分型的分辨率和精确性。

公开(公告)号：CN114410846B

公开(公告)日：2024-01-16

申请号：CN202210198789.0

申请日：2022-03-02

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 丁子轩 ,  陈苏宁 ,  沈宏杰 ,  解珺丹 ,  姚红 ,  马亮 ,  邱桥成 ,  江艾蕊 ,  王曼

IPC: C12Q1/70 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11 ,  C12R1/93

Abstract: 本发明属于病毒基因组学和药物基因组学领域，具体涉及一种检测巨细胞病毒UL54和UL97基因耐药突变的巢式PCR引物和方法。首先公开了一种用于巢式PCR方法检测巨细胞病毒的引物组，包括长引物组、短引物组和通用测序引物组；所述长引物组的核苷酸序列选自以下任意一组：SEQ ID NO:1‑2或SEQ ID NO:3‑4；所述短引物组的核苷酸序列选自以下任意一组：SEQ ID NO:5‑6、SEQ ID NO:7‑8、SEQ ID NO:9‑10、SEQ ID NO:11‑12、SEQ ID NO:13‑14、SEQ ID NO:15‑16、SEQ ID NO:17‑18、SEQ ID NO:19‑20、SEQ ID NO:21‑22、SEQ ID NO:23‑24、SEQ ID NO:25‑26、SEQ ID NO:27‑28、SEQ ID NO:29‑30、SEQ ID NO:31‑32或SEQ ID NO:33‑34；所述通用测序引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:36所示。本发明公开了一种快速、准确的测定UL54、UL97全部编码序列的方法，该方法可用于分析耐药突

公开(公告)号：CN114410846A

公开(公告)日：2022-04-29

申请号：CN202210198789.0

申请日：2022-03-02

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 丁子轩 ,  陈苏宁 ,  沈宏杰 ,  解珺丹 ,  姚红 ,  马亮 ,  邱桥成 ,  江艾蕊 ,  王曼

IPC: C12Q1/70 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11 ,  C12R1/93

Abstract: 本发明属于病毒基因组学和药物基因组学领域，具体涉及一种检测巨细胞病毒UL54和UL97基因耐药突变的巢式PCR引物和方法。首先公开了一种用于巢式PCR方法检测巨细胞病毒的引物组，包括长引物组、短引物组和通用测序引物组；所述长引物组的核苷酸序列选自以下任意一组：SEQ ID NO:1‑2或SEQ ID NO:3‑4；所述短引物组的核苷酸序列选自以下任意一组：SEQ ID NO:5‑6、SEQ ID NO:7‑8、SEQ ID NO:9‑10、SEQ ID NO:11‑12、SEQ ID NO:13‑14、SEQ ID NO:15‑16、SEQ ID NO:17‑18、SEQ ID NO:19‑20、SEQ ID NO:21‑22、SEQ ID NO:23‑24、SEQ ID NO:25‑26、SEQ ID NO:27‑28、SEQ ID NO:29‑30、SEQ ID NO:31‑32或SEQ ID NO:33‑34；所述通用测序引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:36所示。本发明公开了一种快速、准确的测定UL54、UL97全部编码序列的方法，该方法可用于分析耐药突变的类型，为临床治疗提供指导。

公开(公告)号：CN107557451A

公开(公告)日：2018-01-09

申请号：CN201710879446.X

申请日：2017-09-26

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 何军 ,  胡星 ,  张环环 ,  邱桥成 ,  鲍晓晶

IPC: C12Q1/6811 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/686

Abstract: 本发明提供了荧光定量PCR检测KIR2DS1-mRNA的试剂盒所用扩增引物的制备方法，包括以下步骤：（1）DNA抽提；（2）将步骤（1）中提取的DNA标本运用PCR-SSO方法进行KIR基因分型筛选出KIR2DS1阳性DNA标本；（3）将筛选出的DNA标本进行PCR扩增，电泳分析，分离纯化；（4）将步骤（3）得到的KIR2DS1基因与T载体进行连接，转化，挑选菌群后，抽取质粒，测序；（5）采用软件对所得产物进行引物及荧光探针设计。本方法可以直接找到KIR2DS1的特征性序列，进而设计引物探针，成功避免了与其同源性极高的KIR2DL1基因序列对引物及探针设计的干扰。

公开(公告)号：CN101892317A

公开(公告)日：2010-11-24

申请号：CN201010239605.8

申请日：2010-07-29

Applicant: 苏州大学 ,  苏州大学附属第一医院

Inventor： 邱桥成

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种人类白细胞抗原基因的分型方法，包括以下步骤：(1)按照常规技术提取待测基因组DNA，使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段：HLA-A的2，3，4外显子，HLA-B的2，3，4外显子和HLA-DRB1位点2外显子；(2)使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增，扩增各外显子，然后对扩增出的各外显子进行测序，并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较，从而确定基因分型结果；由于本发明HLA基因测序试剂盒以及测试条件的优化组合，有效地扩增HLA-A，B位点的2，3，4外显子和HLA-DRB1位点2外显子，并对相应外显子进行测序，因此在进一步进行分型时，能够避免当某几个等位基因核苷酸位于扩增区域之外时无法进行有效分型的问题，提高了对HLA基因分型的分辨率和精确性。

公开(公告)号：CN110241200B

公开(公告)日：2024-01-12

申请号：CN201910525430.8

申请日：2019-06-18

Applicant: 苏州大学附属第一医院

Inventor： 沈宏杰 ,  陈苏宁 ,  邱桥成 ,  丁子轩 ,  解珺丹 ,  马亮

IPC: C12Q1/6883

Abstract: 本发明提供了一种FLT3‑ITD突变高灵敏度检测方法及试剂盒，该试剂盒包括上游引物和下游引物，所述上游引物核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述下游引物核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，该引物所扩增的核苷酸序列覆盖整个14和15号外显子，从而提高了FLT3‑ITD突变检出率。利用该试剂盒得到的PCR产物，采用毛细管电泳检测突变检测灵敏度达0.01%，使用一步法扩增体系毛细管电泳技术检测FLT3‑ITD突变达到国外检测灵敏度水平，因此，本发明所述FLT3‑ITD突变检测方法是一种以DNA为样本来源的快速、方便、准确、低成本的检测方法，其在FLT3‑ITD突变检测中具有广泛的应用前景。