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公开(公告)号：CN111996257A
公开(公告)日：2020-11-27
申请号：CN202010929700.4
申请日：2020-09-07
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于胃癌多基因检测的技术领域，公开了一种基于二代测序技术的胃癌检测panel，利用基因探针杂交法富集其中557个基因的重要外显子区域与部分内含子区域，并进行高深度测序，从而精准检测其中与胃癌有明确临床相关性的基因突变、拷贝数变异等事件，并将该多基因筛选列表做成探针，通过DNA测序针对性地检测高危基因，可以更高效地检测出对诊断、治疗有指导意义的基因突变，对肿瘤患者进行精准分型，同时也可能帮助某些肿瘤患者参加到临床试验中。
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公开(公告)号：CN111690741A
公开(公告)日：2020-09-22
申请号：CN201910188073.0
申请日：2019-03-13
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B25/20
Abstract: 本发明公开了一种乳腺癌多基因筛选探针，其是通过如下方法制备得到的：针对乳腺癌高发的高危突变基因，下载各个基因外显子编码序列，在3’端和5’端各增加100bp的侧翼序列；利用Oligowiz2.0软件处理基因序列，获得Output.owz文件；利用OligoWiz-2.1.0_OFFLINE.jar软件在windows系统下打开上述Output.owz文件，选择最小探针间距为40bp，最大探针数量为无限制，其余参数都使用默认值，导出探针列表；在探针5’端添加一条SEQ NO.1的引物序列，3’端添加一条SEQ NO.2的引物序列，然后合成探针。本发明乳腺癌多基因筛选探针，可以为乳腺癌患者的临床诊断提供有力的用药指导，方便精准制定治疗方案。
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公开(公告)号：CN110616252A
公开(公告)日：2019-12-27
申请号：CN201910964223.2
申请日：2019-10-11
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种基于突变-编码文库的高通量筛选方法，包括将含有人全长基因突变的载体和含有特异性条形码的载体通过LR反应构建重组载体，之后转导入宿主细胞中，经过抗性筛选处理，抗药性实验，提取基因组，PCR纯化和测序处理的步骤；本发明针对功能性突变的高通量筛选这一空白领域，原创性地建立了突变编码高通量文库技术，能够准确、高效地挖掘功能性突变，从而为突变数据的精准解读提供有力的平台保障，对临床的诊断和发现靶向治疗的靶点具有重要指导意义。
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公开(公告)号：CN109880905A
公开(公告)日：2019-06-14
申请号：CN201910220678.3
申请日：2019-03-22
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一组用于三阴性乳腺癌(简称TNBC)免疫组化分子分型的基因，包括：AR基因、CD8基因和FOXC1基因。本发明还公开了该组用于TNBC免疫组化分型的基因在制备TNBC分型检测试剂盒中的应用。本发明基于目前最大的TNBC多组学数据集，筛选出用于TNBC免疫组化分型的基因组合，建立了TNBC的免疫组化分型方法，并在TNBC组织样本中进行了实施和验证，结果与金标准——基于RNA测序的mRNA分子分型结果——有高度的一致性，该免疫组化分型对患者预后具有提示意义，各免疫组化亚型的TNBC具有的不同病理、分子特征，提示潜在的治疗策略。本发明弥补了通过表达谱测序进行TNBC分子分型技术复杂、价格昂贵、耗费时间、难以应用于临床等缺点，为TNBC亚型特异性治疗的临床应用提供了基础。
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公开(公告)号：CN103981273B
公开(公告)日：2017-01-18
申请号：CN201410239196.X
申请日：2014-05-30
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一组可用于乳腺癌风险评估的突变基因群及其检测试剂盒，所述突变基因群是包含以下七条基因的突变基因的集合，所述七条基因是：BRCA1基因、BRCA2基因、TP53基因、MLH1基因、MLH3基因、MSH3基因和CDH1基因，所述七条基因的突变基因中总携带25个突变位点，该突变位点如表3所示。本发明还公开了一种评估乳腺癌风险的突变基因群的检测试剂盒，所述检测试剂盒包括：检测本发明所述的突变基因群中的突变基因的探针或引物。本发明提供的评估乳腺癌风险的突变基因群的检测试剂盒具有检测效率高，检测速度快，检出率高等优点。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101775369B
公开(公告)日：2011-10-26
申请号：CN200910174455.4
申请日：2009-11-03
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明属微生物动物细胞系领域，具体涉及一种具有自发性肺高转移潜能的人乳腺癌细胞系MDA-MB-231/08-001H及其建立方法。本细胞系为人源性细胞，与其亲本细胞有92个差异表达基因；体外细胞生长、增殖能力和侵袭能力高于其亲本细胞；成瘤性和肺转移率超过亲本细胞，接种4周后scid小鼠原位瘤体积为4224.67±1038.95mm3，重量为2.09±0.51g，自发性肺转移率为100％，转移灶中位数为41个/肺。本发明细胞系及由此建立的动物模型能模拟从肿瘤细胞在植入位点的生长到在靶器官形成转移灶的全过程，与临床实际情况十分吻合，可以方便地用于乳腺癌肺转移机理及相关药物的研究。
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公开(公告)号：CN118486480A
公开(公告)日：2024-08-13
申请号：CN202311696169.0
申请日：2023-12-11
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明提供了一种中国乳腺易感基因预测模型(the Chinese BCDG Calculator)的建立方法及其应用。运用本发明的预测模型只需要将被预测人的各预测因子，包括：诊断年龄、病理学特征(包括组织学分级、肿瘤大小、淋巴结状态、远处转移、ER、PR、HER2状态和Ki‑67增殖指数)、对侧乳腺癌史、家族性乳腺癌或卵巢癌病史和其他的整家族史输入，即可预测其乳腺癌易感基因的胚系突变及“二次打击”状态，进而预测治疗反应及临床结局。对中国人群乳腺癌的初步遗传咨询和精准治疗选择均具有重要的临床意义。
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公开(公告)号：CN113046353B
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202110364792.0
申请日：2021-04-02
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12N15/10 , G01N33/569 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种特异感应三阴性乳腺癌的脱氧核酶探针及筛选方法。本发明通过“对冲抵消”的差异筛选策略，在目标分子未知的情况下，获得了特异感应TNBC细胞系MDA‑MB‑231胞外代谢物的脱氧核酶探针。该探针具有识别速度快、特异性好的特点，为后续开发三阴性乳腺癌快速诊断提供新思路。
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公开(公告)号：CN109880905B
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN201910220678.3
申请日：2019-03-22
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一组用于三阴性乳腺癌(简称TNBC)免疫组化分子分型的基因，包括：AR基因、CD8基因和FOXC1基因。本发明还公开了该组用于TNBC免疫组化分型的基因在制备TNBC分型检测试剂盒中的应用。本发明基于目前最大的TNBC多组学数据集，筛选出用于TNBC免疫组化分型的基因组合，建立了TNBC的免疫组化分型方法，并在TNBC组织样本中进行了实施和验证，结果与金标准——基于RNA测序的mRNA分子分型结果——有高度的一致性，该免疫组化分型对患者预后具有提示意义，各免疫组化亚型的TNBC具有的不同病理、分子特征，提示潜在的治疗策略。本发明弥补了通过表达谱测序进行TNBC分子分型技术复杂、价格昂贵、耗费时间、难以应用于临床等缺点，为TNBC亚型特异性治疗的临床应用提供了基础。
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公开(公告)号：CN114859050A
公开(公告)日：2022-08-05
申请号：CN202210602875.3
申请日：2022-05-30
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: G01N33/574 , A61K38/19 , A61K39/395 , A61P35/00
Abstract: 三阴性乳腺癌免疫治疗疗效预测标志物CCL19的检测方法。本发明提供了CCL19作为标志物在制备乳腺癌免疫治疗疗效和/或预后预测产品中的应用。还提供了包括CCL19蛋白检测试剂和任选地说明书的三阴性乳腺癌免疫治疗疗效和预后预测试剂盒。还提供了CCL19分子联合第二治疗剂在制备抗肿瘤药物中的应用。极大地填补了三阴性乳腺癌免疫治疗疗效预测液体活检的空缺，无创、快速、低成本地实现了精准预测免疫治疗疗效。
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