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公开(公告)号:CN104498610A
公开(公告)日:2015-04-08
申请号:CN201410810292.5
申请日:2014-12-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MEF2C基因SNP位点的RFLP方法及试剂盒,该方法是以黄牛基因组DNA或包含MEF2C基因序列的DNA为模板,进行PCR扩增,然后利用限制性内切酶Hind Ш消化PCR扩增产物,再对酶切后片段进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定黄牛NEF2C基因单核苷酸多态性。由于MEF2C基因在肌肉发育过程中起着重要的调节作用,与黄牛生长和肉质性状密切相关,而且该SNP与黄牛多种重要经济性状相关,所以,本发明提供的检测方法可用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,而且该方法操作简单、快速,成本低,检测精确度高,在建立遗传资源优良的黄牛种群方面非常有优势。
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公开(公告)号:CN103290005B
公开(公告)日:2014-10-15
申请号:CN201310204432.X
申请日:2013-05-28
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因多态性包括:在奶山羊的ADFP基因序列表SEQ ID No.1第78位为A或C的碱基多态性。上述奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性为:以包含ADFP基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊ADFP基因后进行多态性的检测。RFLP多态性与产奶量关联分析证实:EcoRI多态位点与羊奶中的脂肪含量之间有显著相关,基因型为AA的个体产奶量显著高于基因型为AC和CC个体的。本发明可以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊奶中的脂肪含量具有重要的作用。
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公开(公告)号:CN103866032A
公开(公告)日:2014-06-18
申请号:CN201410130751.5
申请日:2014-03-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊STAT3基因单核苷酸多态性的方法及应用,以包含STAT3基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2或P3为引物,PCR扩增山羊STAT3基因;用限制性内切酶DdeI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊STAT3基因第45204位、第62058位或第62230位的单核苷酸多态性。3个位点能够作为提高西农萨能奶山羊体高的分子标记,1个位点作为提高海南黑山羊管围的分子标记,1个作为提高海南黑山羊体长指数的标记,这些有利于中国地方山羊生长性状的标记辅助选择(MAS),有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN103805692A
公开(公告)日:2014-05-21
申请号:CN201310504648.8
申请日:2013-10-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种快速检测秦川牛PNPLA3基因单核苷酸多态性(SNP)的RFLP方法,以包含PNPLA3基因的待测牛全基因组DNA为模板,以人为设计的引物对P1、P2、P3、P4、P5为引物,PCR扩增牛PNPLA3基因,发现27个SNP位点;从中挑选错义突变位点4个并分别设计引物对P2-BglI、P2-RsaI、P3-BmgT120I和P3-MspI。用这4对引物进行PCR扩增,并用上述四种限制性内切酶分别酶切该PCR扩增产物,再用琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物,电泳结果显示秦川牛基因PNPLA3基因第2062位、第2078位、第35800位和第35932位的单核苷酸多态性。由于PNPLA3基因涉及体重、日增重等生长性状,PNPLA3蛋白具有脂肪酶和酰基转移酶的活性而且在维持能量平衡方面也具有重要的作用,本发明所述检测方法可用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS)育种,有利于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN103789407A
公开(公告)日:2014-05-14
申请号:CN201310466317.X
申请日:2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种快速检测中国地方黄牛APOA2基因序列突变的PCR-RFLP的方法,以包含APOA2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增牛APOA2基因,发现3个突变位点;针对这3个突变位点,设计3对引物PR1、PR2和PR1,分别利用Bmgt120Ⅰ,HindⅢ和HaeⅢ三种限制性内切酶酶切PCR产物,然后用琼脂糖凝胶电泳鉴定黄牛APOA2基因3个突变位点的多态性。因此,本发明为中国地方黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS)育种提供了一种在DNA水平筛查和鉴定与黄牛生长性状密切相关基因多态性的方法,有利于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102839171B
公开(公告)日:2013-11-20
申请号:CN201210371982.6
申请日:2012-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12N15/11 , C12Q1/68 , A01K67/027
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊泌乳相关miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法及其应用,其基因单核苷酸多态性包括:在如SEQ ID No.1所示的奶山羊miR-196a基因序列中,其第340位为C或T的单核苷酸多态性。RFLP多态性与泌乳量关联分析证实:HinfI多态位点与泌乳量之间有显著相关,基因型为CT的第二胎和第三胎泌乳量显著高于基因型为CC和TT个体的,此外TT个体的体高显著高于基因型CC和CT个体的。本发明提供的检测方法可以用于西农萨能奶山羊泌乳性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。
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公开(公告)号:CN103290005A
公开(公告)日:2013-09-11
申请号:CN201310204432.X
申请日:2013-05-28
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因多态性包括:在奶山羊的ADFP基因序列表SEQ ID No.1第78位为A或C的碱基多态性。上述奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性为:以包含ADFP基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊ADFP基因后进行多态性的检测。RFLP多态性与产奶量关联分析证实:EcoRI多态位点与羊奶中的脂肪含量之间有显著相关,基因型为AA的个体产奶量显著高于基因型为AC和CC个体的。本发明可以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊奶中的脂肪含量具有重要的作用。
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公开(公告)号:CN103243155A
公开(公告)日:2013-08-14
申请号:CN201310003906.4
申请日:2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法,以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3)为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因;用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位、第-956位、第-501位的单核苷酸多态性,因为完全连锁,第-956位的多态性也代表了第-841,-763,-727和-546位的多态性、第-501位的多态性也代表了第-643位的单核苷酸多态性,这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102206706B
公开(公告)日:2013-02-13
申请号:CN201110062694.8
申请日:2011-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,以包含Dapper1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3、P4)为引物,PCR扩增黄牛Dapper1基因;用限制性内切酶MspI、HindII、NcoI、HhaI分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位、第8428位、第10513位、第10765位的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为Dapper1基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102094081B
公开(公告)日:2012-10-31
申请号:CN201010236903.1
申请日:2010-07-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SH2B1基因单核苷酸多态性的方法,以包含SH2B1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛SH2B1基因;用限制性内切酶BglI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SH2B1基因第2795位的单核苷酸多态性。由于SH2B1基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状,本发明提供的检测方法为SREBPlc基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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