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公开(公告)号：CN103789406B
公开(公告)日：2016-08-17
申请号：CN201310465936.7
申请日：2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛Pax3基因单核苷酸多态性的PCR?RFLP方法。首先，根据DNA池测序结果，检测到的基因多态性包括：在黄牛的Pax3基因序列转录起始位点?580位T或G的单核苷酸多态性；在Taq DNA聚合酶、Buffer（缓冲环境）、Mg＋＋、dNTPs存在的情况下，PCR扩增黄牛Pax3基因，分别用HinfI和HaeIII限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳分型。本发明提供的检测方法为Pax3基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择，从而快速高效、精确地培育中国优质、特色的肉牛新品系。
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公开(公告)号：CN103789407A
公开(公告)日：2014-05-14
申请号：CN201310466317.X
申请日：2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种快速检测中国地方黄牛APOA2基因序列突变的PCR-RFLP的方法，以包含APOA2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增牛APOA2基因，发现3个突变位点；针对这3个突变位点，设计3对引物PR1、PR2和PR1，分别利用Bmgt120Ⅰ，HindⅢ和HaeⅢ三种限制性内切酶酶切PCR产物，然后用琼脂糖凝胶电泳鉴定黄牛APOA2基因3个突变位点的多态性。因此，本发明为中国地方黄牛生长性状的标记辅助选择（MAS）育种提供了一种在DNA水平筛查和鉴定与黄牛生长性状密切相关基因多态性的方法，有利于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN103789406A
公开(公告)日：2014-05-14
申请号：CN201310465936.7
申请日：2013-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/686 , C12Q2535/138
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛Pax3基因单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法。首先，根据DNA池测序结果，检测到的基因多态性包括：在黄牛的Pax3基因序列转录起始位点-580位T或G的单核苷酸多态性；在Taq？DNA聚合酶、Buffer（缓冲环境）、Mg＋＋、dNTPs存在的情况下，PCR扩增黄牛Pax3基因，分别用HinfI和HaeIII限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳分型。本发明提供的检测方法为Pax3基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择，从而快速高效、精确地培育中国优质、特色的肉牛新品系。
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公开(公告)号：CN101921857B
公开(公告)日：2012-05-30
申请号：CN201010255967.6
申请日：2010-08-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测中国地方黄牛Pax7基因的单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法。首先，以包含Pax7基因的黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P(包括P1(F1，R1)和P2(F2，R2))为引物，在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下，PCR扩增黄牛Pax7基因；用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Pax7基因编码区第3531位G或A的单核苷酸多态性与第56626位G或A的单核苷酸多态性。Pax7基因与家畜的早期骨骼肌发育有关，该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记，为黄牛的标记辅助选育(MAS)提供基础资料，进而可推广至黄牛分子育种领域。
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公开(公告)号：CN101921853B
公开(公告)日：2012-05-30
申请号：CN201010255628.8
申请日：2010-08-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊Lhx3基因单核苷酸多态性(SNP)的PCR-RFLP方法，其基因多态性为：在山羊Lhx3基因第5557位T或C的碱基多态性。上述山羊Lhx3基因的单核苷酸多态性的检测方法为：以包含Lhx3基因的待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增山羊Lhx3基因；用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊第5557位的单核苷酸多态性。该方法操作简单，快速，成本低，而且检测的精确度高，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105543352B
公开(公告)日：2020-02-07
申请号：CN201511030627.2
申请日：2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以秦川牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照，最后利用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单，快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN101921854A
公开(公告)日：2010-12-22
申请号：CN201010255639.6
申请日：2010-08-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种黄牛chemerin基因单核苷酸多态性的检测方法，其基因多态性包括：在黄牛chemerin基因第868位为A或G的碱基多态性；在黄牛chemerin基因第1021位为G或A的碱基多态性。上述黄牛chemerin基因的单核苷酸多态性为：以包含chemerin基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对(包括P和newP)为引物，PCR扩增黄牛chemerin基因；用限制性内切酶PvuII消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛chemerin基因第868位和第1021位的单核苷酸多态性；该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记，中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN101921854B
公开(公告)日：2012-07-04
申请号：CN201010255639.6
申请日：2010-08-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种黄牛chemerin基因单核苷酸多态性的检测方法，其基因多态性包括：在黄牛chemerin基因第868位为A或G的碱基多态性；在黄牛chemerin基因第1021位为G或A的碱基多态性。上述黄牛chemerin基因的单核苷酸多态性为：以包含chemerin基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对(包括P和newP)为引物，PCR扩增黄牛chemerin基因；用限制性内切酶PvuII消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛chemerin基因第868位和第1021位的单核苷酸多态性；该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记，中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN105349674B
公开(公告)日：2019-05-17
申请号：CN201510867756.0
申请日：2015-11-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/686 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用：所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951‑118267170的拷贝数变异，该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。
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公开(公告)号：CN105543352A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201511030627.2
申请日：2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以秦川牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照，最后利用2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单，快速，便于推广应用。
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