黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性位点的快速检测方法与应用

    公开(公告)号:CN103243155B

    公开(公告)日:2016-08-17

    申请号:CN201310003906.4

    申请日:2013-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法,以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3)为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因;用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第?974位、第?956位、第?501位的单核苷酸多态性,因为完全连锁,第?956位的多态性也代表了第?841,?763,?727和?546位的多态性、第?501位的多态性也代表了第?643位的单核苷酸多态性,这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    奶山羊泌乳量相关microRNA-431基因单核苷酸多态性及其检测和应用

    公开(公告)号:CN102839170B

    公开(公告)日:2013-10-02

    申请号:CN201210371817.0

    申请日:2012-09-29

    Abstract: 本发明公开了奶山羊泌乳量相关microRNA-431基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因单核苷酸多态性包括:在如SEQ ID No.1所示的奶山羊microRNA-431基因序列中,其第184位为T或C的单核苷酸多态性。RFLP多态性与泌乳量关联分析证实:MluI多态位点与产奶量之间有显著相关,基因型为TT的第三胎产奶量和体长显著高于基因型为TC和CC个体的。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记,以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊的产奶量具有重要的作用。

    秦川牛FoxO1基因单核苷酸多态性分子标记的检测方法与应用

    公开(公告)号:CN103233001A

    公开(公告)日:2013-08-07

    申请号:CN201210210461.2

    申请日:2012-06-25

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛FoxO1基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因单核苷酸多态性包括:以包含FoxO1基因的待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增秦川牛FoxO1基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定秦川牛FoxO1基因第178132位的碱基多态性。由于FoxO1基因对动物肌肉脂肪性状、生长发育性状具有重要作用。所以,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与秦川牛生长性状密切相关的分子遗传标记,以用于秦川牛的辅助选择和分子育种,加快秦川牛良种繁育速度。

    一种验证CIDEC基因5端调控区单核苷酸多态性位点遗传效应的方法与应用

    公开(公告)号:CN103243156A

    公开(公告)日:2013-08-14

    申请号:CN201310003907.9

    申请日:2013-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法,以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型;用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后,再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上,构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体,将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中,使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性,以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用

    公开(公告)号:CN103290005B

    公开(公告)日:2014-10-15

    申请号:CN201310204432.X

    申请日:2013-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因多态性包括:在奶山羊的ADFP基因序列表SEQ ID No.1第78位为A或C的碱基多态性。上述奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性为:以包含ADFP基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊ADFP基因后进行多态性的检测。RFLP多态性与产奶量关联分析证实:EcoRI多态位点与羊奶中的脂肪含量之间有显著相关,基因型为AA的个体产奶量显著高于基因型为AC和CC个体的。本发明可以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊奶中的脂肪含量具有重要的作用。

    奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用

    公开(公告)号:CN103290005A

    公开(公告)日:2013-09-11

    申请号:CN201310204432.X

    申请日:2013-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因多态性包括:在奶山羊的ADFP基因序列表SEQ ID No.1第78位为A或C的碱基多态性。上述奶山羊ADFP基因的单核苷酸多态性为:以包含ADFP基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊ADFP基因后进行多态性的检测。RFLP多态性与产奶量关联分析证实:EcoRI多态位点与羊奶中的脂肪含量之间有显著相关,基因型为AA的个体产奶量显著高于基因型为AC和CC个体的。本发明可以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊奶中的脂肪含量具有重要的作用。

    黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性位点的快速检测方法与应用

    公开(公告)号:CN103243155A

    公开(公告)日:2013-08-14

    申请号:CN201310003906.4

    申请日:2013-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法,以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3)为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因;用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位、第-956位、第-501位的单核苷酸多态性,因为完全连锁,第-956位的多态性也代表了第-841,-763,-727和-546位的多态性、第-501位的多态性也代表了第-643位的单核苷酸多态性,这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    秦川牛FoxO1基因单核苷酸多态性分子标记的检测方法与应用

    公开(公告)号:CN103233001B

    公开(公告)日:2016-11-02

    申请号:CN201210210461.2

    申请日:2012-06-25

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛FoxO1基因的单核苷酸多态性及其检测方法,其基因单核苷酸多态性包括:以包含FoxO1基因的待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增秦川牛FoxO1基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定秦川牛FoxO1基因第178132位的碱基多态性。由于FoxO1基因对动物肌肉脂肪性状、生长发育性状具有重要作用。所以,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与秦川牛生长性状密切相关的分子遗传标记,以用于秦川牛的辅助选择和分子育种,加快秦川牛良种繁育速度。

    一种验证CIDEC基因5端调控区单核苷酸多态性位点遗传效应的方法与应用

    公开(公告)号:CN103243156B

    公开(公告)日:2016-06-22

    申请号:CN201310003907.9

    申请日:2013-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法,以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型;用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后,再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上,构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体,将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中,使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性,以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    奶山羊泌乳量相关microRNA-431基因单核苷酸多态性及其检测和应用

    公开(公告)号:CN102839170A

    公开(公告)日:2012-12-26

    申请号:CN201210371817.0

    申请日:2012-09-29

    Abstract: 本发明公开了奶山羊泌乳量相关microRNA-431基因的单核苷酸多态性及其检测和应用,其基因单核苷酸多态性包括:在如SEQ ID No.1所示的奶山羊microRNA-431基因序列中,其第217位为T或C的单核苷酸多态性。RFLP多态性与泌乳量关联分析证实:MluI多态位点与产奶量之间有显著相关,基因型为TT的第三胎产奶量和体长显著高于基因型为TC和CC个体的。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记,以用于奶山羊的辅助选择和分子育种,对提高奶山羊的产奶量具有重要的作用。

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