一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用

    公开(公告)号:CN105543352B

    公开(公告)日:2020-02-07

    申请号:CN201511030627.2

    申请日:2015-12-31

    Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照,最后利用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。

    一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN107557439B

    公开(公告)日:2020-04-21

    申请号:CN201710986321.7

    申请日:2017-10-20

    Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板,利用一对特异引物IGF1R‑CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异引物BTF3‑CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照,然后利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数,本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础,通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析,有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。

    一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN107557439A

    公开(公告)日:2018-01-09

    申请号:CN201710986321.7

    申请日:2017-10-20

    Abstract: 本发明公开了一种检测晋南牛IGF1R基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以晋南牛的耳组织全基因组DNA为模板,利用一对特异引物IGF1R-CNV扩增牛IGF1R基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异引物BTF3-CNV扩增牛BTF3基因片段作为对照,然后利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数,本发明提供的方法为建立晋南牛IGF1R基因拷贝数与生长性状之间的关联奠定了基础,通过对拷贝数变异与生长性状进行的关联分析,有利于加快晋南牛分子标记辅助选择育种工作。该方法简单、快速、便于推广应用。

    一种检测黄牛Pax3基因单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法与应用

    公开(公告)号:CN103789406B

    公开(公告)日:2016-08-17

    申请号:CN201310465936.7

    申请日:2013-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛Pax3基因单核苷酸多态性的PCR?RFLP方法。首先,根据DNA池测序结果,检测到的基因多态性包括:在黄牛的Pax3基因序列转录起始位点?580位T或G的单核苷酸多态性;在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg++、dNTPs存在的情况下,PCR扩增黄牛Pax3基因,分别用HinfI和HaeIII限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳分型。本发明提供的检测方法为Pax3基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择,从而快速高效、精确地培育中国优质、特色的肉牛新品系。

    一种快速检测黄牛APOA2基因多态性的方法及应用

    公开(公告)号:CN103789407A

    公开(公告)日:2014-05-14

    申请号:CN201310466317.X

    申请日:2013-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测中国地方黄牛APOA2基因序列突变的PCR-RFLP的方法,以包含APOA2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增牛APOA2基因,发现3个突变位点;针对这3个突变位点,设计3对引物PR1、PR2和PR1,分别利用Bmgt120Ⅰ,HindⅢ和HaeⅢ三种限制性内切酶酶切PCR产物,然后用琼脂糖凝胶电泳鉴定黄牛APOA2基因3个突变位点的多态性。因此,本发明为中国地方黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS)育种提供了一种在DNA水平筛查和鉴定与黄牛生长性状密切相关基因多态性的方法,有利于快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测黄牛Angptl6基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN102206705A

    公开(公告)日:2011-10-05

    申请号:CN201110062693.3

    申请日:2011-03-18

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Angptl6基因单核苷酸多态性的方法,以包含Angptl6基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(包含P1和P2)为引物,用PCR法扩增黄牛Angptl6基因,然后用限制性内切酶ScaI消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Angptl6基因(GenBank Accession number:NW_003104015)第2359位的单核苷酸多态性。由于Angptl6基因功能对生长发育性状具有重要生物学功能,本发明提供的检测方法为Angptl6基因的SNP与生长性状关联的建立奠定了基础。本发明还发现,Angptl6基因单核苷酸多态性对体长指数有显著影响,故本发明提供的检测方法可用于中国黄牛肉用和生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用

    公开(公告)号:CN105543352A

    公开(公告)日:2016-05-04

    申请号:CN201511030627.2

    申请日:2015-12-31

    Abstract: 本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以秦川牛基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照,最后利用2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。

    一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用

    公开(公告)号:CN103320510A

    公开(公告)日:2013-09-25

    申请号:CN201310206816.5

    申请日:2013-05-29

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛HGF基因单核苷酸多态性的检测方法及应用,以包含黄牛HGF基因的全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增获得黄牛HGF基因,PCR产物经限制性内切酶HincII消化后,进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛HGF基因组第72801位的单核苷酸多态性。由于HGF基因功能涉及肌肉及机体各个组织器官的正常生长发育,本发明所阐述的方法能够快速的检测黄牛HGF基因的单核苷酸多态性,为HGF基因的SNP与生长性状关系的建立奠定基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)育种提供基础资料,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

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