一种基于高通量测序技术的地中海贫血基因检测方法

    公开(公告)号:CN105886617A

    公开(公告)日:2016-08-24

    申请号:CN201610250952.8

    申请日:2016-04-16

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2537/143 C12Q2531/113 C12Q2535/122

    Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序技术的地中海贫血基因检测方法,主要包括以下步骤:基于Gap?PCR法设计跨越断点和突变位点的PCR扩增引物特异性扩增α&β?地贫相关基因片段,对PCR产物进行文库构建,将文库产物进行高通量测序,将测序数据以人类基因组hg19作为参考序列,根据序列比对得分Q10分析目标区域chr16:215000?236000每个基因位点的测序深度值,根据不同位点的测序深度值分布,确定α?地贫缺失型别;同时通过目标区域chr16:215000?236000和chr11:5246400?5248600进行序列比对,根据具体位点的碱基类型确定α&β?地贫突变型别。采用本发明所述方法可实现对α?地中海贫血的6种突变基因型及β?地中海贫血26种突变基因型的同时检测。

    用于脆性X综合征致病基因检测的校准品及其应用

    公开(公告)号:CN108546755A

    公开(公告)日:2018-09-18

    申请号:CN201810440187.5

    申请日:2018-05-09

    Abstract: 本发明公开了一种用于脆性X综合征致病基因检测的校准品及其应用,所述校准品中含有至少6个CGG序列重复数不同的FMR1基因片段。采用本发明的脆性X综合征致病基因检测校准品,应用荧光PCR-毛细管电泳法对FMR1基因CGG重复数进行检测,利用校准品及检测的结果构建标准曲线,从而计算出同批次检测样本的CGG重复数,该方法显著提高了脆性X综合征致病基因检测的分辨度,使脆性X综合征的检测方法更为完善和准确。

    检测胎儿地中海贫血致病基因的方法和试剂盒

    公开(公告)号:CN108642160B

    公开(公告)日:2022-03-11

    申请号:CN201810473083.4

    申请日:2018-05-16

    Abstract: 本发明公开了一种检测胎儿地中海贫血致病基因的方法,包括如下步骤:(1)筛选SNP位点,SNP位点用于设计扩增基因组地贫基因的引物池和捕获孕妇血浆中游离DNA地贫基因的探针;(2)提取孕妇血浆中游离DNA和父‑母‑已出生同胞三人的全血基因组DNA并构建相应的DNA文库,进行模板制备和富集;(3)对步骤(2)游离DNA和全血基因组DNA文库测序;(4)构建地贫基因上SNP位点的单倍体基因型,结合游离DNA和全血基因组DNA文库测序信息,分析父源遗传情况和母源遗传情况,以确定胎儿SNP位点相应的基因型。本发明通过目标区域捕获结合高通量测序技术,实现对地贫无创产前检测;所需的样本量少;该方法在对父源突变检测的基础上,可以实现对胎儿母源基因突变的检测。

    一种检测脆性X综合征FMR1基因型的试剂盒

    公开(公告)号:CN112746102A

    公开(公告)日:2021-05-04

    申请号:CN202011641166.3

    申请日:2020-12-31

    Inventor: 李明 杨旭 王文玉

    Abstract: 本发明公开了一种检测脆性X综合征FMR1基因型的试剂盒,含有一组检测脆性X综合征FMR1基因型的引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1~3,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3引物的5’端有FAM荧光基团。本发明开发了一种快速、准确、通量大适用于临床检测脆性X综合征FMR1基因型的试剂盒,能够同时检测AGG插入信息和CGG重复数。该试剂盒的检测扩增范围可涵盖所有正常人、脆性X前突变携带者/患者、脆性X全突变携带者/患者;且具有检测时间短,通量大,操作简单,所需样本核酸量少的特点。

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