公开(公告)号：CN105886617A

公开(公告)日：2016-08-24

申请号：CN201610250952.8

申请日：2016-04-16

Applicant: 广州市达瑞生物技术股份有限公司

Inventor： 李明 ,  吴英松 ,  杨学习 ,  杨旭 ,  范冬梅

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序技术的地中海贫血基因检测方法，主要包括以下步骤：基于Gap?PCR法设计跨越断点和突变位点的PCR扩增引物特异性扩增α&β?地贫相关基因片段，对PCR产物进行文库构建，将文库产物进行高通量测序，将测序数据以人类基因组hg19作为参考序列，根据序列比对得分Q10分析目标区域chr16：215000?236000每个基因位点的测序深度值，根据不同位点的测序深度值分布，确定α?地贫缺失型别；同时通过目标区域chr16：215000?236000和chr11：5246400?5248600进行序列比对，根据具体位点的碱基类型确定α&β?地贫突变型别。采用本发明所述方法可实现对α?地中海贫血的6种突变基因型及β?地中海贫血26种突变基因型的同时检测。

公开(公告)号：CN108642160A

公开(公告)日：2018-10-12

申请号：CN201810473083.4

申请日：2018-05-16

Applicant: 广州市达瑞生物技术股份有限公司 ,  南方医科大学

Inventor： 吴英松 ,  李明 ,  范冬梅 ,  林圣 ,  杨旭 ,  侯荣基

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883

Abstract: 本发明公开了一种检测胎儿地中海贫血致病基因的方法，包括如下步骤：(1)筛选SNP位点，SNP位点用于设计扩增基因组地贫基因的引物池和捕获孕妇血浆中游离DNA地贫基因的探针；(2)提取孕妇血浆中游离DNA和父-母-已出生同胞三人的全血基因组DNA并构建相应的DNA文库，进行模板制备和富集；(3)对步骤(2)游离DNA和全血基因组DNA文库测序；(4)构建地贫基因上SNP位点的单倍体基因型，结合游离DNA和全血基因组DNA文库测序信息，分析父源遗传情况和母源遗传情况，以确定胎儿SNP位点相应的基因型。本发明通过目标区域捕获结合高通量测序技术，实现对地贫无创产前检测；所需的样本量少；该方法在对父源突变检测的基础上，可以实现对胎儿母源基因突变的检测。

公开(公告)号：CN108642160B

公开(公告)日：2022-03-11

申请号：CN201810473083.4

申请日：2018-05-16

Applicant: 广州市达瑞生物技术股份有限公司 ,  南方医科大学

Inventor： 吴英松 ,  李明 ,  范冬梅 ,  林圣 ,  杨旭 ,  侯荣基

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6883

Abstract: 本发明公开了一种检测胎儿地中海贫血致病基因的方法，包括如下步骤：(1)筛选SNP位点，SNP位点用于设计扩增基因组地贫基因的引物池和捕获孕妇血浆中游离DNA地贫基因的探针；(2)提取孕妇血浆中游离DNA和父‑母‑已出生同胞三人的全血基因组DNA并构建相应的DNA文库，进行模板制备和富集；(3)对步骤(2)游离DNA和全血基因组DNA文库测序；(4)构建地贫基因上SNP位点的单倍体基因型，结合游离DNA和全血基因组DNA文库测序信息，分析父源遗传情况和母源遗传情况，以确定胎儿SNP位点相应的基因型。本发明通过目标区域捕获结合高通量测序技术，实现对地贫无创产前检测；所需的样本量少；该方法在对父源突变检测的基础上，可以实现对胎儿母源基因突变的检测。