用于确定目标片段单体型的方法、设备、介质和程序产品

    公开(公告)号:CN120072058A

    公开(公告)日:2025-05-30

    申请号:CN202510541354.5

    申请日:2025-04-27

    Abstract: 本发明涉及一种用于确定目标片段单体型的方法、设备、介质和程序产品。该方法包括:获取来自待测样本的关于目标片段的输入测序序列集合,所述输入测序序列集合包含关于目标片段的多条测序序列;将所述测序序列与参考基因组序列进行比对,确定目标片段内与每一条测序序列对应的杂合单核苷酸多态性信息;基于每一个杂合单核苷酸多态性位点对单体型定相的贡献度,对所述输入测序序列集合进行多次递归划分,从而确定所述目标片段的单体型。本发明显著提高了对多拷贝基因进行单体型定相的效率与准确度。

    变异描述信息的处理方法、装置及电子设备

    公开(公告)号:CN117746989B

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410185961.8

    申请日:2024-02-20

    Abstract: 本申请提供了一种变异描述信息的处理方法、装置及电子设备,方法包括:在变异描述信息中的变异HGVS描述涉及关联转录本的编码核苷酸变化或氨基酸变化时,根据VCF文件、参考基因组序列文件和基因功能注释文件,获取变异关联转录本的CDS序列和变异CDS序列、变异蛋白编码长度,对变异描述信息中的氨基酸水平的变异描述信息进行校验与修正;根据基因功能注释文件、转录本序列与参考基因组序列的比对文件,确定基因组组装问题关联转录本位置信息;基于该信息,对变异描述信息中的DNA水平变异描述信息和氨基酸水平变异描述信息进行校验与修正。本申请能够对变异描述信息进行自动化校验与修正,提升信息准确性与规范性。

    变异描述信息的处理方法、装置及电子设备

    公开(公告)号:CN117746989A

    公开(公告)日:2024-03-22

    申请号:CN202410185961.8

    申请日:2024-02-20

    Abstract: 本申请提供了一种变异描述信息的处理方法、装置及电子设备,方法包括:在变异描述信息中的变异HGVS描述涉及关联转录本的编码核苷酸变化或氨基酸变化时,根据VCF文件、参考基因组序列文件和基因功能注释文件,获取变异关联转录本的CDS序列和变异CDS序列、变异蛋白编码长度,对变异描述信息中的氨基酸水平的变异描述信息进行校验与修正;根据基因功能注释文件、转录本序列与参考基因组序列的比对文件,确定基因组组装问题关联转录本位置信息;基于该信息,对变异描述信息中的DNA水平变异描述信息和氨基酸水平变异描述信息进行校验与修正。本申请能够对变异描述信息进行自动化校验与修正,提升信息准确性与规范性。

    基于数字微流控技术的靶向捕获测序文库全流程构建方法

    公开(公告)号:CN117488412A

    公开(公告)日:2024-02-02

    申请号:CN202311840113.8

    申请日:2023-12-28

    Abstract: 本发明提供了一种基于数字微流控技术的靶向捕获测序文库全流程构建方法。该方法包括:控制电极单元具有第一通断电状态,将位于电极单元的第一区域的DNA片段驱动至电极单元的第二区域;在DNA片段驱动至第二区域时,控制电极单元具有第二通断电状态,将第一试剂驱动至第二区域并与在DNA片段混合之后,将位于第一区域的第二试剂驱动至第二区域并与DNA片段混合,得到预文库;在得到预文库之后,控制电极单元具有第三通断电状态,将第三试剂驱动至第二区域,并使得第三试剂和预文库混合得到杂交产物;在得到杂交产物之后,控制电极单元具有第四通断电状态,将位于第四试剂驱动至第二区域,并使得第四试剂与杂交产物混合得到测序文库。

Patent Agency Ranking