一种基于深度迁移学习的循环肿瘤细胞的快速注释方法

    公开(公告)号:CN114974433B

    公开(公告)日:2024-07-23

    申请号:CN202210582319.4

    申请日:2022-05-26

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明提供了一种基于深度迁移学习的循环肿瘤细胞的快速注释方法,将源域肿瘤细胞集的表达矩阵和目标域肿瘤细胞集的表达矩阵输入神经网络模型的特征提取器进行特征提取;将源域肿瘤细胞集特征和目标域肿瘤细胞集特征进行无监督聚类,采用循环一致匹配关联源域肿瘤细胞集和目标域肿瘤细胞集的共识分类,并通过计算领域共识分数,得到目标肿瘤细胞集分类数,为目标域肿瘤细胞集分配伪标签;输入神经网络模型的分类器,采用目标函数来更新神经网络模型的参数;循环执行至停止条件,输出目标域肿瘤细胞集的原型标签以及训练完成的神经网络模型,本发明提供的方法能够精确地给目标样本分配准确的标签,并为源域和目标域构建一个共同的表示空间。

    唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-15蛋白的核酸适配体及其应用

    公开(公告)号:CN113122543B

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202110358738.5

    申请日:2021-04-01

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素‑15(Sialic acid‑bindingimmunoglobulin‑like lectin‑15,Siglec‑15)蛋白的核酸适配体,所述的核酸适配体包括如SEQ IDNO:1至SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列。本发明的核酸适配体能够提供Siglec‑15蛋白的快速、精准检测,同时适配体能够阻断其与T细胞表面受体相互作用,一定程度上恢复T细胞增殖活性,从而使得肿瘤微环境的免疫正常化,且不会引起严重的自身免疫反应。Siglec‑15核酸适配体可作为药物用于肿瘤微环境高表达Siglec‑15的癌症,成为肿瘤免疫治疗的潜在核酸药物,可能对抗PD‑L1治疗无效的患者有效,进而补充现有肿瘤诊断和免疫治疗体系。

    一种糖基化外泌体PD-L1的检测方法

    公开(公告)号:CN114717299B

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202111320426.1

    申请日:2021-11-09

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种糖基化外泌体PD‑L1的检测方法,包括如下步骤:1)分离外泌体;2)连接第一偶合物与第一DNA,所述的第一偶合物能够与外泌体的糖基结合;3)加入第一偶合物与第一DNA的偶联物;4)加入PD‑L1适配体;5)稀释反应溶液;6)加入连接臂DNA;7)在连接臂的作用下DNA连接酶将第一DNA与PD‑L1适配体连接;8)对与连接臂互补的第一DNA与PD‑L1适配体连接部分进行扩增,检测扩增信号。本发明方法特异性检测糖基化的外泌体PD‑L1,无需分离释放糖蛋白,检测灵敏度高,检测限为1.09pg/mL,适用于多种生物体系。

    一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法

    公开(公告)号:CN115881222A

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN202211036695.X

    申请日:2022-08-26

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法,包括:得到整数序列集;构建概率数据库,构建概率索引数据库;进入迭代过程,扩增结点中的序列,更新扩增后结点的匹配位置,更新迭代结点集;计算迭代结点集中所有结点的指导值;从迭代结点集中,选出主导结点集,根据主导结点集进行分枝修剪;清空候选结点集,按指导值从大到小从迭代结点集中选取指定个数个候选结点,添加入候选结点集;从迭代结点集中随机选选取指定个数个候选结点,添加入候选结点集中;对扩增完成的整数序列进行检验,若为序列集编码后的整数序列集的公共超序列,则按编码规则进行译码,得到一串字符串。它能有效提高原位DNA微阵列合成系统的效率。

    一种单克隆抗体的筛选方法

    公开(公告)号:CN115109149A

    公开(公告)日:2022-09-27

    申请号:CN202210703885.6

    申请日:2022-06-21

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种单克隆抗体的筛选方法。该方法包括:采用各个不同的第一核酸分子标识符和各个不同的第二核酸分子标识符并基于交叉定位标识法,对微孔芯片中的各个微孔进行编码,从而得到所述微孔芯片中的各个微孔的位置编码信息;基于所述微孔芯片中的各个微孔的位置编码信息对单克隆抗体进行筛选。该筛选方法可以降低操作难度和筛选成本,还可以大大提高实验通量。

    一种糖基化外泌体PD-L1的检测方法

    公开(公告)号:CN114717299A

    公开(公告)日:2022-07-08

    申请号:CN202111320426.1

    申请日:2021-11-09

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种糖基化外泌体PD‑L1的检测方法,包括如下步骤:1)分离外泌体;2)连接第一偶合物与第一DNA,所述的第一偶合物能够与外泌体的糖基结合;3)加入第一偶合物与第一DNA的偶联物;4)加入PD‑L1适配体;5)稀释反应溶液;6)加入连接臂DNA;7)在连接臂的作用下DNA连接酶将第一DNA与PD‑L1适配体连接;8)对与连接臂互补的第一DNA与PD‑L1适配体连接部分进行扩增,检测扩增信号。本发明方法特异性检测糖基化的外泌体PD‑L1,无需分离释放糖蛋白,检测灵敏度高,检测限为1.09pg/mL,适用于多种生物体系。

    一种微流控芯片和微流控芯片的使用方法

    公开(公告)号:CN112871226A

    公开(公告)日:2021-06-01

    申请号:CN202011416130.5

    申请日:2020-12-04

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种微流控芯片和微流控芯片的使用方法。所述微流控芯片包括微流道,以及至少一个内嵌于微流道中的双层微粒捕获腔室;各双层微粒捕获腔室包括第一微粒捕获腔室和位于其下方的第二微粒捕获腔室,且第一微粒捕获腔室的底部与第二微粒捕获腔室的顶部相互连通;第一微粒捕获腔室底部截面直径大于第二微粒捕获腔室顶部开口截面直径;且第二微粒捕获腔室顶部开口截面直径小于底部截面直径。所述使用方法,包括在使用微流控芯片捕获微粒后,向该芯片中通入分散有用于微粒裂解的固体颗粒的油相,以包封和裂解所述微粒。使用本发明的芯片和方法,可有效防止捕获的微粒因后续操作导致的溶液扰动而再次溢出,并能够防止捕获腔室之间信息的交叉污染。

    一种程序性死亡受体-配体1的核酸适体及其应用

    公开(公告)号:CN110004149B

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN201910308366.8

    申请日:2019-04-17

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种程序性死亡受体‑配体1(PD‑L1)的核酸适体及其应用,涉及一种核酸。提供能够高特异性识别、高亲和力结合PD‑L1的核酸适体。所述核酸适体可通过基于琼脂糖微珠分离‑流式细胞术分析的蛋白SELEX方法筛选制备。所述核酸适体具有富含G碱基、具有茎环结构、易合成和标记、成本低、稳定性好、非免疫原性等特点,并且利用该核酸适体实现了PD‑L1蛋白、表达PD‑L1蛋白的肿瘤细胞系及肿瘤细胞系分泌的表达PD‑L1蛋白外泌体的特异性识别,验证了其在生化分析检测领域中的应用,并有望作为检测PD‑L1表达水平的分子识别工具,而应用于临床医学肿瘤免疫研究领域PD‑1/PD‑L1抑制剂疗效的精准预测和动态监测。

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