一种单管检测人脊髓性肌萎缩症的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN110885878B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN201911168775.9

    申请日:2019-11-25

    Abstract: 本发明公开了一种单管人脊髓性肌萎缩症相关基因拷贝数与点突变检测、携带者分型的引物组及试剂盒。该引物组其核苷酸序列如SEQ ID NO.1~38所示。引物组设计合理,特异性高;减少了扩增偏倚性低,保证定量准确;引入识别序列,实现对SMN1和SMN2第7号外显子转换情况辨识;引入了UDG酶、切割扩增产物,避免污染。单管同时实现人肌萎缩症SMN1/2基因拷贝数检测和SMN1/2中国人群SNP位点检测、NAIP和GTF2H2基因拷贝数检测、患者(I~IV型)与携带者(“1+0”和“2+0”)分型等临床用途。本方法和试剂盒检测快速、结果准确、成本适宜,适用仪器临床占有率高,适宜在临床中应用。

    一种宏基因组二代测序的建库样本的制备方法

    公开(公告)号:CN111471676A

    公开(公告)日:2020-07-31

    申请号:CN202010176692.0

    申请日:2020-03-13

    Abstract: 本发明公开了一种宏基因组二代测序的建库样本的制备方法,包括以下步骤:采集样本,并制备样本溶液;裂解样本溶液中的宿主细胞,并消化样本溶液释放出的DNA,通过酶法和机械法进行破壁,得到样本1;对样本溶液进行DNA酶消化,得到样本2;将样本1和样本2合并,提取总核酸;总核酸分为两部分:一部分去除rRNA,反转录为cDNA,与另一部分混合。利用本发明提出的针对二代测序的宏基因组建库样本的方法进行宏基因组测序,测序的检测能同时检测DNA和RNA病毒,以能保证不遗漏RNA病毒;检测可对样本中总核酸进行检测,检测的灵敏度高,对于样本中所有微生物均能检。

    一种获取胎儿游离DNA浓度的方法

    公开(公告)号:CN107133491B

    公开(公告)日:2020-05-29

    申请号:CN201710140534.8

    申请日:2017-03-08

    Abstract: 本发明公开一种获取胎儿游离DNA浓度的方法,对母体外周血中的cfDNA片段长度的数据,采用拥有K个正态分布的高斯混合模型,对母体和胎儿的cfDNA进行量化,自动准确的获取五个波峰和对应的分布范围,得到胎儿cfDNA的浓度,为产前无创检测(NIPT)提供更加合适和可靠的胎儿浓度,具有普适性和准确性。本方法通过动态确定母体和胎儿cfDNA片段长度的分布区域,对男胎和女胎都有效,并且对于不同胎儿以及胎龄的样本,能够自动获取并识别母体和胎儿cfDNA的分布,保证了胎儿浓度的准确度。

    一种早期准确检测先兆子痫的预测模型

    公开(公告)号:CN110305954A

    公开(公告)日:2019-10-08

    申请号:CN201910655877.7

    申请日:2019-07-19

    Abstract: 本发明公开了一种早期准确检测先兆子痫的预测模型。本发明研究发现,外周血游离DNA在基因转录起始位点区域的分布情况能够反应孕妇与胎儿的生理状态,基于基因转录起始位点区域的血清游离DNA丰度在先兆子痫患者与健康孕妇中存在显著差异,对游离DNA丰度进行均一化校正后,使用机器学习算法,通过不同差异基因的优选组合,能够有效预测先兆子痫的发病。因此构建了基于外周血游离DNA预测的先兆子痫的筛查预测模型,以及优化的靶标基因组合,可在先兆子痫临床症状出现之前预测先兆子痫发病,是一种相对无创、经济方便的早期先兆子痫预测的方法,在开发先兆子痫的预测筛查产品方面具有很好的应用前景。

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