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公开(公告)号:CN101250584B
公开(公告)日:2012-06-13
申请号:CN200810019862.3
申请日:2008-03-19
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种识别显著差异表达基因集合的方法,它包括以下步骤:(1)设置和输入数据;(2)将基因归属至各个基因集合;(3)检查每一个基因集合中基因的个数是否大于设置中定义的个数,如果结果为否,则抛弃此基因集合;(4)计算每一个基因集合的表达变化指数;(5)将整张芯片上所有基因作为背景基因,计算背景基因集合的表达变化指数;(6)从背景基因中随机抽样,检验各基因集合E值的显著性;(7)根据设定的E值和p值的阈值,输出符合阈值要求的基因集合作为识别结果。本发明方法对大基因集合识别效果优良,保证了在较少检测次数的情况下有较高的准确率,大大提高了基因表达值在实际应用中的价值。
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公开(公告)号:CN118899031A
公开(公告)日:2024-11-05
申请号:CN202411020987.3
申请日:2024-07-29
Applicant: 南京大学
Abstract: 本申请提供了一种细胞特异性转录暂停位点的分析方法、系统及存储介质,通过综合数据库以及综合数据整理分析后,可以深入了解各种细胞类型和生理条件下暂停现象的多样性及其功能意义。本申请可以全面了解不同细胞类型和生理条件下转录暂停的多样性和分布特征;可以深入分析转录暂停与基因表达调控的关系及其潜在功能意义;可以探究转录暂停在细胞过程中的作用,如分化、发育等;为相关疾病的诊断和治疗提供新的生物标志物和靶点。
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公开(公告)号:CN117777302A
公开(公告)日:2024-03-29
申请号:CN202211141205.2
申请日:2022-09-20
Applicant: 南京大学
IPC: C07K19/00 , C12N15/85 , A01K67/0275
Abstract: 本发明提供了含有经过修饰的融合蛋白的过表达小鼠模型、其构建方法及应用,修饰是指在融合蛋白上插入至少一个亲和标签,以通过抗体将外泌体筛选出来;融合蛋白是将跨膜蛋白与荧光标签融合后得到的,用以示踪插入跨膜蛋白的外泌体的动向。共表达的荧光标签mCherry可示踪该系统的表达组织及表达量,共表达系统在loxP/loxP原件调控的终止表达元件的调控下表达。构建的小鼠模型与组织特异性cre小鼠杂交后可以去除终止元件,启动该修饰蛋白在该组织特异性的表达,以示踪外泌体动向。与现有技术相对比,本发明具有以下优点:本发明所构建的CD63过表达小鼠模型,可以很好的解决体内特定组织外泌体体内示踪以及筛选的问题。
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公开(公告)号:CN101565747A
公开(公告)日:2009-10-28
申请号:CN200910032863.6
申请日:2009-06-04
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种提取多种基因集合特征表达模式的方法,包括以下步骤:输入芯片数据;判断基因表达谱芯片所含基因所属的基因集合;判断每一个基因集合中基因的个数是否在基因集合容量大小设置的范围之内,如果判断结果为否,则抛弃此基因集合;否则,执行下一步;计算基因集合的单态显著性和多态显著性;对原始p值进行校正;判断基因集合的单态显著性和多态显著性是否符合阈值要求,如果判断结果为否,则抛弃;如果判断结果为是,则输出识别结果。本发明方法能够有效识别多种特征表达模式,甄别无效的干扰噪音,大大提高了基因表达谱在实际应用中的价值。
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公开(公告)号:CN101298630A
公开(公告)日:2008-11-05
申请号:CN200810123981.3
申请日:2008-06-11
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种Solexa技术鉴定结肠癌病人血清中微小核糖核酸的方法,属于生物医药技术领域,具体涉及一种研究血清中微小核糖核酸表达的Solexa技术以及Solexa技术在结肠癌诊断中的应用。该方法包括应用Solexa测序方法测定结肠癌受试者的血清微小核糖核酸表达谱。Solexa测序的方法具有检出谱系广、灵敏度高、取材方便、样本易存放等优点,该方法可广泛用于疾病普查等相关工作,改进单一的标记物所难以克服的个体差异所带来的低特异性和低灵敏度,显著提高疾病的临床检出率,成为早期诊断疾病的有效手段。
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公开(公告)号:CN101177681A
公开(公告)日:2008-05-14
申请号:CN200710134495.7
申请日:2007-10-30
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域。具体涉及虎斑颈槽蛇肌肉解偶联蛋白(uncoupling protein-snake B,UCP-SB)分子克隆。本发明应用简并引物和3′,5′-RACE首次从虎斑颈槽蛇肌肉中克隆了UCP-SB基因。UCP与多种疾病相关。如,糖尿病、心血管疾病以及肿瘤。因此,以UCP作为靶点,可以制备治疗这些疾病的药物。
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公开(公告)号:CN1194009C
公开(公告)日:2005-03-23
申请号:CN00112527.3
申请日:2000-09-12
Applicant: 南京大学
IPC: C07K14/435 , C07K14/815 , A61P7/04
Abstract: 一种人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白:1.该类新型抗凝蛋白是将具有活化血小板亲和性及抗凝活性的人胎盘抗凝蛋白和具有抗纤维蛋白形成及有纤维蛋白导向性的多肽分子相融合;2.该类人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白同时具有抗纤维蛋白形成和抗活化血小板的生物活性,对血栓具有高亲和性和选择性;3.该类新型抗凝蛋白可以通过蛋白质工程设计,基因工程方法生产制备;4.人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白的应用是能够作为抗血栓形成的抗凝药物。作为该类新型抗凝蛋白之一的Gly-Pro-Arg-Pro-人胎盘抗凝蛋白-水蛭素C端结构域新型抗凝蛋白分子具有同时血小板亲和性和凝血酶抑制剂的生物活性,能够作为高效、安全的抗凝血药物。
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公开(公告)号:CN1286262A
公开(公告)日:2001-03-07
申请号:CN00112527.3
申请日:2000-09-12
Applicant: 南京大学
IPC: C07K14/435 , C07K14/815 , A61P7/04
Abstract: 一种人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白:1.该类新型抗凝蛋白是将具有活化血小板亲和性及抗凝活性的人胎盘抗凝蛋白和具有抗纤维蛋白形成及有纤维蛋白导向性的多肽分子相融合;2.该类人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白同时具有抗纤维蛋白形成和抗活化血小板的生物活性,对血栓具有高亲和性和选择性;3.该类新型抗凝蛋白可以通过蛋白质工程设计,基因工程方法生产制备;4.人胎盘抗凝蛋白介导的新型抗凝蛋白的应用是能够作为抗血栓形成的抗凝药物。作为该类新型抗凝蛋白之一的Gly-Pro-Arg-Pro-人胎盘抗凝蛋白-水蛭素C端结构域新型抗凝蛋白分子具有同时血小板亲和性和凝血酶抑制剂的生物活性,能够作为高效、安全的抗凝血药物。
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