-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101979540A
公开(公告)日：2011-02-23
申请号：CN201010518335.4
申请日：2010-10-26
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种microRNA探针序列的设计方法，包括以下步骤：从基因组序列中收集所有能形成茎环结构的茎种序列；计算各茎种序列及其附近100nt～150nt区域序列所形成的RNA二级结构；根据microRNA前体茎环结构特征对产生的RNA二级结构进行筛选，提取含microRNA的茎环结构；计算含microRNA茎环结构的自由能分布；使用microRNA茎环结构的自由能特征谱确定microRNA前体；使用标准转换关系将microRNA前体二级结构归属为成熟体等效长度；用设定的等效总长度在microRNA前体二级结构中截取microRNA成熟体序列并输出结果。
-
公开(公告)号：CN103093119A
公开(公告)日：2013-05-08
申请号：CN201310028142.4
申请日：2013-01-24
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种利用网络结构信息识别显著生物通路的方法，包括以下步骤：输入基因芯片数据；将基因芯片中测量的所有基因归属到已知的生物通路集合中；使用网络结构信息计算每条生物通路的差异性；构造随机对照数据，计算随机情况下每条生物通路差异性的分布，并且计算p值；对原始p值进行校正；判断每条生物通路的显著性是否符合阈值要求，如果判断结果为否，则抛弃；如果判断结果为是，则输出识别结果。本发明方法能够有效识别当生物条件发生变化时被显著影响的生物通路，同时也能从多种角度发现导致这些生物通路发生变化的关键基因和调控路径。
-
公开(公告)号：CN101979540B
公开(公告)日：2013-03-06
申请号：CN201010518335.4
申请日：2010-10-26
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种microRNA探针序列的设计方法，包括以下步骤：从基因组序列中收集所有能形成茎环结构的茎种序列；计算各茎种序列及其附近100nt～150nt区域序列所形成的RNA二级结构；根据microRNA前体茎环结构特征对产生的RNA二级结构进行筛选，提取含microRNA的茎环结构；计算含microRNA茎环结构的自由能分布；使用microRNA茎环结构的自由能特征谱确定microRNA前体；使用标准转换关系将microRNA前体二级结构归属为成熟体等效长度；用设定的等效总长度在microRNA前体二级结构中截取microRNA成熟体序列并输出结果。
-
公开(公告)号：CN101565747A
公开(公告)日：2009-10-28
申请号：CN200910032863.6
申请日：2009-06-04
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种提取多种基因集合特征表达模式的方法，包括以下步骤：输入芯片数据；判断基因表达谱芯片所含基因所属的基因集合；判断每一个基因集合中基因的个数是否在基因集合容量大小设置的范围之内，如果判断结果为否，则抛弃此基因集合；否则，执行下一步；计算基因集合的单态显著性和多态显著性；对原始p值进行校正；判断基因集合的单态显著性和多态显著性是否符合阈值要求，如果判断结果为否，则抛弃；如果判断结果为是，则输出识别结果。本发明方法能够有效识别多种特征表达模式，甄别无效的干扰噪音，大大提高了基因表达谱在实际应用中的价值。
-
公开(公告)号：CN101565747B
公开(公告)日：2012-11-28
申请号：CN200910032863.6
申请日：2009-06-04
Applicant: 南京大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种提取多种基因集合特征表达模式的方法，包括以下步骤：输入芯片数据；判断基因表达谱芯片所含基因所属的基因集合；判断每一个基因集合中基因的个数是否在基因集合容量大小设置的范围之内，如果判断结果为否，则抛弃此基因集合；否则，执行下一步；计算基因集合的单态显著性和多态显著性；对原始p值进行校正；判断基因集合的单态显著性和多态显著性是否符合阈值要求，如果判断结果为否，则抛弃；如果判断结果为是，则输出识别结果。本发明方法能够有效识别多种特征表达模式，甄别无效的干扰噪音，大大提高了基因表达谱在实际应用中的价值。
-
-
-
-
Search Results
5
records
(took 0.017 seconds)
