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公开(公告)号：CN116536406A
公开(公告)日：2023-08-04
申请号：CN202310061337.2
申请日：2023-01-16
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种在全基因组水平鉴定植物开放性染色质位点的方法（原位DNase‑seq）。该方法包括如下步骤：（1）交联固定植物材料；（2）提取并纯化植物材料的细胞核；（3）加入DNaseI，DNA polymerase I及biotin‑dATP和biotin‑dNTP，酶切并原位标记开放性染色质位点；（4）回收DNA；（5）片段化DNA；（6）用anti‑streptavidin‑beads结合biotin标记的DNA片段；（7）建库和Illumina测序，经过生物信息学分析，在全基因组水平鉴定开放性染色质位点。本发明的整个方法流程简单，耗时较短，DNA片段化可视化效果强，理论上该方法适应于多种植物。
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公开(公告)号：CN119464360A
公开(公告)日：2025-02-18
申请号：CN202411675499.6
申请日：2024-11-21
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了水稻低钾响应转录因子KTR2的应用。一种低钾响应转录因子编码基因KTR2，序列如SEQ ID NO.1所示。该基因可在控制水稻耐受干旱胁迫等方面应用。本发明通过大量实验发现了水稻中的低钾响应转录因子KTR2的生物学功能，过表达该基因后，会增强水稻对干旱胁迫的耐受；而敲除该基因后，导致水稻对干旱胁迫的敏感。
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公开(公告)号：CN119431530A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411068704.2
申请日：2024-08-06
Applicant: 南京农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/84 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了水稻乙烯响应转录因子OsKTR2的基因工程应用。一种水稻乙烯响应转录因子OsKTR2，其CDS序列为SEQ ID NO.1。本发明中，首次发现由OsKTR2基因构建的重组表达载体，通过农杆菌介导的水稻转基因技术转染到野生型水稻日本晴(Oryza sativa.ssp.cv.Japonica)中，增加水稻的有效分蘖数、总分蘖数以及结实率，从而提高水稻的产量。除此之外，OsKTR2的表达受低钾胁迫诱导上调，进而促进水稻对钾的吸收。
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公开(公告)号：CN119242703A
公开(公告)日：2025-01-03
申请号：CN202411675498.1
申请日：2024-11-21
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N15/82 , C07K14/415 , C12N15/29 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了水稻OsHAK22基因在调节水稻干旱胁迫的耐受性中的应用。一种高亲和钾离子转运蛋白编码基因OsHAK22，序列如SEQ ID NO.1所示。该基因可在控制水稻耐受干旱胁迫等方面应用。本发明通过大量实验发现了水稻中的高亲和钾离子转运蛋白编码基因OsHAK22的生物学功能，过表达该基因后，会增强水稻苗期和孕穗期对干旱胁迫的耐受；而敲除该基因后，导致水稻苗期和孕穗期对干旱胁迫的敏感。
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公开(公告)号：CN116590392A
公开(公告)日：2023-08-15
申请号：CN202310371743.9
申请日：2023-04-10
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种在全基因组水平鉴定植物R‑loop位点的方法，包括如下主要步骤：利用核糖核酸酶H特异性地识别并消化R‑loop结构中DNA‑RNA杂合链，同时在DNA聚合酶I作用下，以DNA‑RNA杂合链中的DNA链为模板按照碱基配对方式及时修补被RNaseH切割的RNA位点，在修补过程中插入具有生物素标记的dATP和dCTP核苷酸碱基，最后，新合成的互补DNA链含有生物素标记的dATP和dCTP核苷酸碱基；利用链霉抗生物素蛋白的磁珠捕获并富集含有生物素标记的DNA片段，结合单链DNA文库试剂盒构建单链DNA测序文库，通过测序平台配对测序，获得测序原始数据，结合生物信息学分析，从而在全基因水平鉴定R‑loop位点。本发明的整个方法流程简单，所需DNA用量范围广(100ng‑8μg)，可视化效果强，理论上该方法适应于多种植物。
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