确定缺失/重复类型的方法、设备、介质和程序产品

    公开(公告)号:CN117935921B

    公开(公告)日:2024-06-11

    申请号:CN202410330737.3

    申请日:2024-03-21

    Abstract: 本发明涉及一种确定缺失/重复类型的方法、设备、介质和程序产品。该方法包括:获取待测样本的目标片段内的测序序列数据,测序序列数据指示目标片段的测序序列;基于关于目标片段的测序序列与人类参考基因组序列的比对结果数据,确定目标片段内比对上的序列的读长区段;获取目标片段内的参考缺失/重复类型的序列的区段,参考缺失/重复类型的序列至少包括目标片段内的已知缺失/重复类型的序列;确定读长区段与参考缺失/重复类型的序列的区段的相似度数据;以及基于所计算的相似度数据,确定待测样本的目标片段内的目标缺失/重复类型。本发明针对扩增偏好的基因检测数据,可以准确确定缺失/重复的类型。

    确定缺失/重复类型的方法、设备、介质和程序产品

    公开(公告)号:CN117935921A

    公开(公告)日:2024-04-26

    申请号:CN202410330737.3

    申请日:2024-03-21

    Abstract: 本发明涉及一种确定缺失/重复类型的方法、设备、介质和程序产品。该方法包括:获取待测样本的目标片段内的测序序列数据,测序序列数据指示目标片段的测序序列;基于关于目标片段的测序序列与人类参考基因组序列的比对结果数据,确定目标片段内比对上的序列的读长区段;获取目标片段内的参考缺失/重复类型的序列的区段,参考缺失/重复类型的序列至少包括目标片段内的已知缺失/重复类型的序列;确定读长区段与参考缺失/重复类型的序列的区段的相似度数据;以及基于所计算的相似度数据,确定待测样本的目标片段内的目标缺失/重复类型。本发明针对扩增偏好的基因检测数据,可以准确确定缺失/重复的类型。

    用于预测待测基因的拷贝数的方法、计算设备和存储介质

    公开(公告)号:CN114420204B

    公开(公告)日:2022-06-17

    申请号:CN202210314661.6

    申请日:2022-03-29

    Abstract: 本发明涉及一种用于预测待测基因的拷贝数的方法、计算设备和存储介质。该方法包括:获取待测样本的测序序列数据,测序序列数据为经由第三代测序技术而获得的关于待测基因的三代测序序列;基于所获取的测序序列数据,确定关于待测基因的单体型数目和测序深度;以及基于所确定的单体型数目和测序深度,确定关于待测样本的待测基因的拷贝数的预测结果。本发明能够在低成本下,针对重复区域或高度同源基因准确确定基因拷贝数。

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