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公开(公告)号：CN109287303A
公开(公告)日：2019-02-01
申请号：CN201811454987.9
申请日：2018-11-30
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01G2/10
Abstract: 本发明提供了一种毛白杨的扦插管理方法，涉及植物扦插繁育技术领域。本发明所述方法包括以下步骤：1)用在水中浸泡0.6～1.5h的插穗，速蘸生根剂后扦插；2)扦插后第0～4d，设置温度20～26℃，空气湿度为75～84％；3)扦插后第5～15d，设置温度25～31℃，空气湿度为80～90％；4)扦插后第16～30d，设置温度27～33℃，空气湿度为85～96％。本发明所述方法精准控制毛白杨扦插后各个阶段的温度和空气湿度，从而显著提高扦插生根率(30％)，且生根苗生长30d时，根系明显较对照发达、小苗健壮，移栽成活率显著提高。
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公开(公告)号：CN108504652A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710252442.9
申请日：2017-04-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明提出了一种提取林木组织或器官RNA的方法、林木特异性条形码(barcode)序列设计和鉴定林木组织特异性miRNA的方法。提取林木组织或器官RNA的方法包括：将待处理样品与交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)进行第一接触，并在液氮条件下进行研磨处理，将研磨处理后产物与Trizol、β-巯基乙醇和聚乙烯吡咯烷酮(PVP)进行第二接触。利用该方法，避免了因植物组织中富含多糖、酚类、色素等物质而导致RNA提取效率和成功率不高的缺陷，利用上述方法，植物组织RNA的提取效率和成功率显著提高，同时发明人发现，相比于现有技术，节约了约80％的样品用量，极大方便了微量样品的测序；此外，林木特异性barcode序列的使用提高了测序碱基的平衡度，测序产出至少提高5％，且测序质量也会不同程度的提高。
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公开(公告)号：CN108467898A
公开(公告)日：2018-08-31
申请号：CN201710099761.0
申请日：2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto-MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto-RPF3-1基因的第1828位基因型为GG和Pto-EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN108229065A
公开(公告)日：2018-06-29
申请号：CN201810119071.1
申请日：2018-02-06
Applicant: 北京林业大学
CPC classification number: G06F17/5009 , G06K9/6219
Abstract: 本发明提供了基于木本植物叶片表型特征的净光合速率预测模型的构建方法和预测方法，属于生物信息学领域。本发明采用将平均联动聚类和PAM聚类法结合，对不同地理位置的木本植物划分为不同的子品种，消除不同子品种的差异以便对净光合速率进行更合理的预测，同时本发明在每个子品种中分别利用梯度提升算法基于叶片样本的表型数据构建净光合速率预测模型，在建立模型的过程中，本发明首次提出梯度提升算法迭代停止准则，为不同子品种的木本植物叶片表型数据提供了算法迭代的残差临界值，建立了基于迭代停止准则的改进梯度提升算法的小叶杨净光合速率预测模型，在已知叶片表型数据的情况下，对不同小叶杨子品种的净光合速率均有理想的预测结果。
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公开(公告)号：CN107085673A
公开(公告)日：2017-08-22
申请号：CN201710120750.6
申请日：2017-03-02
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/16
Abstract: 本发明提供了一种植物响应逆境胁迫的lncRNAs序列模块功能注释方法，包括筛选植物响应逆境胁迫的lncRNAs及其靶基因；并对靶基因表达模式进行分析；按照靶基因表达模式进行植物响应逆境胁迫的lncRNAs分组；对响应逆境胁迫的lncRNAs特异序列模块富集分析；给出响应逆境胁迫的lncRNAs特异序列模块功能注释。本发明的lncRNAs序列模块功能注释方法结合生物信息学与差异表达分析对植物响应逆境胁迫的lncRNAs序列模块进行注释，不但极大地提高了实验的效率、精准性以及灵活性，并显著地降低了实验成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106919809A
公开(公告)日：2017-07-04
申请号：CN201710120768.6
申请日：2017-03-02
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/20
CPC classification number: G06F19/20
Abstract: 本发明提供了一种植物响应逆境胁迫的lncRNAs二级结构功能注释方法，包括筛选植物响应逆境胁迫的lncRNAs与筛选对植物响应逆境胁迫的lncRNAs的候选靶基因；对植物响应逆境胁迫的lncRNAs的靶基因的功能注释；以及对响应逆境胁迫的lncRNAs二级结构富集分析与功能预测。本发明二级结构功能注释的方法，结合生物信息学与差异表达分析对植物逆境胁迫响应lncRNAs的二级结构进行注释，不但极大地提高了实验的效率、精准性以及灵活性并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN106755436A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611241126.3
申请日：2016-12-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12Q2600/156 , C12Q2565/125 , C12Q2525/131 , C12Q2525/191 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明涉及一种林木基因组DNA甲基化遗传连锁图谱的构建方法，属于分子遗传技术领域。本发明的构建方法包括以下步骤：1)提取木质部组织的基因组DNA；2)采用第一组EcoRI和HpaII酶和第二组EcoRI和MspI酶分别对所述基因组DNA进行双酶切，在两组双酶切产物上分别连接接头，得到两组酶切连接后的产物；3)利用所述酶切连接扩增产物依次进行预扩增和选择性扩增，通过毛细管电泳分离所述选择性扩增的产物，获得群体基因组甲基化标记位点；4)从所述群体基因组甲基化标记位点中筛选符合孟德尔遗传分离的群体甲基化多态性位点，构建甲基化遗传连锁图谱。本发明提供的构建方法高效、稳定、易操作，有利于加快林木群体表观遗传学研究进展。
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公开(公告)号：CN106755408A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611200502.4
申请日：2016-12-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种植物等位基因不平衡表达检测方法，包括以下步骤：1)比较候选基因序列，筛选标记等位基因的SNPs位点；2)根据筛选到的SNPs位点设计qPCR特异引物和简并引物；3)用qPCR特异引物和简并引物分别对待测样本的cDNA进行PCR扩增，获得扩增产物；4)若扩增产物的熔解曲线为单峰，根据PCR扩增的Ct值计算待测样本等位基因表达特异性；所述qPCR特异引物包括正向引物和反向引物，对引物3'末端与SNP位点3'末端互补的核苷酸进行LNA修饰。所述方法增加了检测结果的精确性和可靠性，并且简化了实验配套条件，显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN106755378A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611143309.1
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6809 , C12Q2535/00
Abstract: 本发明提供了一种检测miRNA来源的方法，包括以下步骤：1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息；2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息；3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合，将与待检测miRNA前体序列具有重合度的假基因确定候选假基因；4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置计算两类序列的重合度I；5)当所述重合度I符合1≧I>0.3条件时，确定待检测miRNA是由所述候选假基因所产生。本发明不仅填补了miRNA和假基因两者关系的研究空白，还可以批量发掘基因组中具有潜在生物功能的假基因，为基因调节网络的构建提供候选假基因。
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公开(公告)号：CN106521002A
公开(公告)日：2017-03-22
申请号：CN201611198895.X
申请日：2016-12-22
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用及试剂盒，属于分子遗传技术领域。本发明提供了一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用，所述SNP位点为毛白杨PetC基因第2068位、第2347位和第2457位碱基。利用本发明的应用能够实现光合能力强和生长快的杨树的快速筛选，大大加速育种进程。
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