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公开(公告)号:CN108504652A
公开(公告)日:2018-09-07
申请号:CN201710252442.9
申请日:2017-04-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明提出了一种提取林木组织或器官RNA的方法、林木特异性条形码(barcode)序列设计和鉴定林木组织特异性miRNA的方法。提取林木组织或器官RNA的方法包括:将待处理样品与交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)进行第一接触,并在液氮条件下进行研磨处理,将研磨处理后产物与Trizol、β-巯基乙醇和聚乙烯吡咯烷酮(PVP)进行第二接触。利用该方法,避免了因植物组织中富含多糖、酚类、色素等物质而导致RNA提取效率和成功率不高的缺陷,利用上述方法,植物组织RNA的提取效率和成功率显著提高,同时发明人发现,相比于现有技术,节约了约80%的样品用量,极大方便了微量样品的测序;此外,林木特异性barcode序列的使用提高了测序碱基的平衡度,测序产出至少提高5%,且测序质量也会不同程度的提高。