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公开(公告)号：CN108509766A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710621910.5
申请日：2017-07-27
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了确定lncRNA是否来源于假基因的方法，其包括以下步骤：分别获得待测lncRNA的基础生物信息和所述待测lncRNA所属物种的所有假基因的基础生物信息；基于所述待测lncRNA与各假基因在染色体上的物理位置关系，进行第一来源确定处理，其中，当不存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时，判定所述待测lncRNA不是假基因来源；当存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时，选择与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因作为所述待测lncRNA的候选假基因，并按照如下步骤进行第二来源确定处理：计算待测lncRNA与候选假基因的序列重合度I；以及基于序列重合度I，确定待测lncRNA是否来源于所述候选假基因。利用该方法可在全基因组水平批量检测假基因来源的lncRNA。
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公开(公告)号：CN102511397B
公开(公告)日：2013-12-04
申请号：CN201110441967.X
申请日：2011-12-26
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种杨树愈伤组织的诱导方法及诱导培养基，属于杨树的组织培养领域。本发明所筛选、优化的杨树愈伤组织诱导培养基为添加0.5-1.5mg/L萘乙酸、0.5-1.5mg/L 6-糠氨基嘌呤、20-40g/L蔗糖和4.5-6.5g/L琼脂的H培养基。本发明以单核靠边期的杨树花药为外植体，将其接种到所筛选的愈伤组织诱导培养基上进行愈伤组织诱导培养，获得生长速度快、器官分化率高的杨树愈伤组织。本发明愈伤组织诱导培养基可以有效提高愈伤组织的诱导率，所获得的愈伤组织质量高，可以在短期内形成大量优良的杨树试管苗，不仅可以快速繁殖杨树，同时也可以应用于杨树植物改良，种质保存等方面。
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公开(公告)号：CN102550406A
公开(公告)日：2012-07-11
申请号：CN201110440943.2
申请日：2011-12-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明公开了一种诱导杨树愈伤组织分化的培养基和诱导杨树愈伤组织分化的方法，本发明所优化的愈伤组织分化培养基是：添加0.6-1.0mg/L BAP、0.1-0.5mg/LNAA、0-02mg/L GA3、20-40g/L蔗糖和4.5-6.5g/L琼脂的MS固体培养基。使用本发明的愈伤组织分化培养基可提高杨树愈伤组织的分化率和杨树的遗传转化率，可以在短期内形成大量优良的杨树试管苗，可进行规模化、工厂化生产，解决了杨树生产中所存在的问题。
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公开(公告)号：CN103243097A
公开(公告)日：2013-08-14
申请号：CN201310071708.1
申请日：2013-03-06
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了从毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)中分离的花器官特异表达启动子及其应用，属于启动子的分离和应用。所述启动子的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示。本发明还公开了含有所述花器官特异表达启动子的重组植物表达载体以及重组宿主细胞。功能验证试验发现，本发明启动子驱动的GUS基因仅在烟草萼片和花瓣中特异表达，在烟草的根、茎、叶、雄蕊和心皮等其它组织部位里没有GUS表达活性，说明本发明从毛果杨分离的启动子为花器官特异表达启动子。本发明进一步公开了所述花器官特异表达启动子在改良植物性状、培育植物新品种以及研究植物花器官的发育及调控机制等方面的应用。
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公开(公告)号：CN108509770A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710359550.6
申请日：2017-05-19
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明公开了一种确定林木基因组中假基因的方法，其包括以下步骤：获得待测林木的基础生物信息，所述基础生物信息包括蛋白质序列、基因组序列和功能基因的染色体位置；利用Pseudopipe法对所述待测林木进行假基因鉴定处理，以便获得原始假基因数据；对所述原始假基因数据进行重复项删除处理，以便获得候选假基因数据；以及根据功能基因和假基因在染色体上的物理位置信息，对所述候选假基因数据进行去除假阳性处理，以便确定所述待测林木基因组中的假基因。利用该方法能够有效地确定林木基因组中的假基因，并且该方法操作简单，易于掌握，需时短，无需额外的配套条件，成本低，且所得结果准确性好，可靠度高，适于推广。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN102550405B
公开(公告)日：2013-12-04
申请号：CN201110440337.0
申请日：2011-12-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明公开了一种杨树单倍体的培育方法，属于杨树单倍体的选育领域。所述培育方法包括：1)将消毒处理后的杨树花药接种在愈伤组织诱导培养基上进行愈伤组织诱导培养，获得杨树愈伤组织；2)将愈伤组织接种于不定芽分化培养基上进行不定芽的分化培养，获得杨树不定芽；3)将不定芽接种于生根培养基上进行生根培养，获得试管小苗；4)经过倍性鉴定，获得杨树单倍体植株。本发明杨树单倍体的培育方法解决了杨树单倍体培育中所存在的问题，愈伤组织诱导率高，愈伤组织器官分化率高，繁殖率高，诱导繁殖操作步骤简单，可以在短期内形成大量优良的杨树试管苗，可进行规模化、工厂化生产，为杨树的育种、品质改良、遗传研究等提供了物质基础。
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公开(公告)号：CN106755378A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611143309.1
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6809 , C12Q2535/00
Abstract: 本发明提供了一种检测miRNA来源的方法，包括以下步骤：1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息；2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息；3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合，将与待检测miRNA前体序列具有重合度的假基因确定候选假基因；4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置计算两类序列的重合度I；5)当所述重合度I符合1≧I>0.3条件时，确定待检测miRNA是由所述候选假基因所产生。本发明不仅填补了miRNA和假基因两者关系的研究空白，还可以批量发掘基因组中具有潜在生物功能的假基因，为基因调节网络的构建提供候选假基因。
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公开(公告)号：CN103243097B
公开(公告)日：2014-11-05
申请号：CN201310071708.1
申请日：2013-03-06
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了从毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)中分离的花器官特异表达启动子及其应用，属于启动子的分离和应用。所述启动子的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示。本发明还公开了含有所述花器官特异表达启动子的重组植物表达载体以及重组宿主细胞。功能验证试验发现，本发明启动子驱动的GUS基因仅在烟草萼片和花瓣中特异表达，在烟草的根、茎、叶、雄蕊和心皮等其它组织部位里没有GUS表达活性，说明本发明从毛果杨分离的启动子为花器官特异表达启动子。本发明进一步公开了所述花器官特异表达启动子在改良植物性状、培育植物新品种以及研究植物花器官的发育及调控机制等方面的应用。
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公开(公告)号：CN102550405A
公开(公告)日：2012-07-11
申请号：CN201110440337.0
申请日：2011-12-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明公开了一种杨树单倍体的培育方法，属于杨树单倍体的选育领域。所述培育方法包括：1)将消毒处理后的杨树花药接种在愈伤组织诱导培养基上进行愈伤组织诱导培养，获得杨树愈伤组织；2)将愈伤组织接种于不定芽分化培养基上进行不定芽的分化培养，获得杨树不定芽；3)将不定芽接种于生根培养基上进行生根培养，获得试管小苗；4)经过倍性鉴定，获得杨树单倍体植株。本发明杨树单倍体的培育方法解决了杨树单倍体培育中所存在的问题，愈伤组织诱导率高，愈伤组织器官分化率高，繁殖率高，诱导繁殖操作步骤简单，可以在短期内形成大量优良的杨树试管苗，可进行规模化、工厂化生产，为杨树的育种、品质改良、遗传研究等提供了物质基础。
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公开(公告)号：CN106755378B
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN201611143309.1
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6809
Abstract: 本发明提供了一种检测miRNA来源的方法，包括以下步骤：1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息；2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息；3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合，将与待检测miRNA前体序列具有重合度的假基因确定候选假基因；4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置计算两类序列的重合度I；5)当所述重合度I符合1≧I>0.3条件时，确定待检测miRNA是由所述候选假基因所产生。本发明不仅填补了miRNA和假基因两者关系的研究空白，还可以批量发掘基因组中具有潜在生物功能的假基因，为基因调节网络的构建提供候选假基因。
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