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公开(公告)号：CN119979748A
公开(公告)日：2025-05-13
申请号：CN202411802881.9
申请日：2024-12-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种Pto‑C3H35基因单倍型在评价杨树木质素含量中的应用，属于分子标记技术领域。本发明所述Pto‑C3H35基因单倍型根据SNP1、InDel1、InDel2、InDel3和SNP2的核苷酸确定。本发明提供了测定所述基因单倍型的引物组、试剂盒，以及测定所述基因单倍型的方法，通过测定上述五个位点的基因型组合能够准确地判断杨树的木质素含量，在杨树生长早期准确、高效筛选低木质素含量的优株，应用于工业用材杨树人工林新品种选育，有效缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN117133354B
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202311097273.8
申请日：2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/20 , C12Q1/6895 , G16B20/30 , G16B50/10
Abstract: 本发明提供了一种高效鉴定林木关键育种基因模块的方法，涉及分子遗传学技术领域。本发明所述方法，可精准、高效地鉴定林木重要性状的关键育种基因模块，系统评价育种模块内各个基因型组合对表型变异的遗传效应，以此确定最优的关键育种基因模块的基因型组合，广泛应用于林木重要性状苗期精准选育以及林木分子遗传改良进程。
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公开(公告)号：CN117133354A
公开(公告)日：2023-11-28
申请号：CN202311097273.8
申请日：2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/20 , C12Q1/6895 , G16B20/30 , G16B50/10
Abstract: 本发明提供了一种高效鉴定林木关键育种基因模块的方法，涉及分子遗传学技术领域。本发明所述方法，可精准、高效地鉴定林木重要性状的关键育种基因模块，系统评价育种模块内各个基因型组合对表型变异的遗传效应，以此确定最优的关键育种基因模块的基因型组合，广泛应用于林木重要性状苗期精准选育以及林木分子遗传改良进程。
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公开(公告)号：CN116790471A
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202311040035.3
申请日：2023-08-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明属于一种植物组织培养基及模拟逆境环境的培养基，具体涉及培养基领域。本发明提供了一种基于无琼脂MS培养基和珍珠岩的组培培养基制备方法，以期提高植物组织培养的效率和便捷性。本发明所述无琼脂MS培养基是在传统MS培养基的基础上去除琼脂后制成的。与传统的琼脂MS培养基相比，无琼脂MS培养基具有操作简单、不易污染、易于调节pH值等优点。本发明还利用不同的环境胁迫调节剂制备得到不同的模拟逆境环境的植物培养基，可完成植物生长环境、病理情况和其他因素的全面分析。
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公开(公告)号：CN114427116B
公开(公告)日：2023-08-15
申请号：CN202111635093.1
申请日：2021-12-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B20/30
Abstract: 本发明提供了一种在全基因组水平上预测植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方法，属于生物信息技术领域。本发明的方法基于植物转录因子的DAP‑seq测序数据，在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置，并以此为基础，预测转录因子下游调控的靶基因。本发明联合测序数据和生物信息学工具，大大增加了预测的精确度和通量，进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因，提高预测效率。并且本发明的方法普遍适用于植物学领域。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111863127B
公开(公告)日：2023-06-16
申请号：CN202010690681.4
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法，属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后；确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP；确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因；当同时满足确定条件时，表明待测转录因子调控了候选靶基因表达，可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系，构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
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公开(公告)号：CN115807117A
公开(公告)日：2023-03-17
申请号：CN202210999392.1
申请日：2022-08-19
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，所述分子标记位于SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的第395位，具有G/T多态性。所述分子标记的基因型为GG的毛白杨个体，春季萌芽时间较晚，所述分子标记的基因型为TT的毛白杨个体，春季萌芽时间较早；所述分子标记的基因型为GT的毛白杨个体，春季萌芽时间适中。本发明提供的精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，显著提高育种效率，缩短杨树的育种周期。
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公开(公告)号：CN114300040A
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202111635166.7
申请日：2021-12-29
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及分子遗传学技术领域，特别是涉及一种精准鉴定植物蛋白互作的方法。本发明联合利用共表达调控网络分析与酵母双杂交技术，既可以高通量获得与候选基因在相同组织中，具有显著相关性表达水平的候选靶基因，又可以利用酵母双杂交技术验证候选基因和候选靶基因之间存在的互作关系，克服了高通量测序技术造成的假阳性问题，以及反复利用酵母双杂技术验证互作过程耗时和繁琐的问题，通量高、准确性强，对鉴定植物蛋白互作机制提供了一种快速、高效与可靠的技术手段。
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公开(公告)号：CN109338011B
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN201811563126.4
申请日：2018-12-20
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种高通量筛选植物基因组等位不平衡表达的杂合变异位点的方法，属于遗传学研究领域，包括以下步骤：1)外源调控因素处理植物材料获得处理样品；2)提取处理样品和对照样品的总RNA，构建链特异性测序文库并进行高通量测序；3)过滤所述原始测序数据获得clean reads；4)将所述clean reads分别与参考基因组进行比对获得比对结果；5)删除比对结果中多余复制读段，将出现INDEL位点周围的序列进行重新比对获得最终比对结果数据；6)将所述最终比对结果数据进行等位位点变异筛选获得等位不平衡表达的杂合变异位点。所述方法解决了在等位水平上解析基因组对外界环境响应的分析难题。
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公开(公告)号：CN108517368B
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN201710266801.6
申请日：2017-04-21
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了利用上位性解析毛白杨LncRNA Pto‑CRTG及其靶基因Pto‑CAD5互作关系的方法及系统。利用根据本发明实施例的方法和系统，能够利用上位性解析毛白杨LncRNA及其靶基因的互作关系。在lncRNA Pto‑CRTG和其Cis靶基因Pto‑CAD5中发现的功能性SNP位点为这两个基因在林木分子标记育种中的应用提供了重要的参考价值。
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