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公开(公告)号：CN111863127A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010690681.4
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法，属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后；确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP；确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因；当同时满足确定条件时，表明待测转录因子调控了候选靶基因表达，可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系，构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
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公开(公告)号：CN109545278B
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201811549079.8
申请日：2018-12-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/00 , G16B30/00 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法，涉及分子遗传学技术领域，包括获得lncRNA与基因的群体SNP基因型数据；获得基因在所研究组织的群体表达量数据；获得目标性状群体表型数据；将群体SNP基因型数据与目标性状群体表型数据关联分析；将群体SNP基因型数据与群体表达量数据关联分析；计算群体SNP基因型数据与所述目标性状群体表型数据的相关性系数r；当同时满足3个限定条件时，表明lncRNA与基因有相互作用，共同影响植物目标性状的表型变异。采用该方法准确检测毛白杨lncRNA LNC‑0052611与基因Pto‑COMT25之间存在互作关系，且该互作关系影响了毛白杨胸径的表型变异。
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公开(公告)号：CN106997429B
公开(公告)日：2019-12-03
申请号：CN201611198893.0
申请日：2017-02-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B15/30
Abstract: 本发明涉及一种林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法，属于分子遗传技术领域。本发明提供的林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法包括以下步骤：1)获得林木lncRNA序列；2)利用blast预测方法得到初步筛选后的lncRNA的靶基因；3)利用RNAplex预测方法得到二次筛选后的lncRNA的靶基因；4)对所述步骤3)中的lncRNA及二次筛选后的lncRNA的靶基因的组织特异性表达模式进行检测，计算两者的表达相关性，确定lncRNA及其靶基因之间的相互作用关系。本发明预测方法能够高效、稳定地检测lncRNA及其靶基因的作用区段，并且能够显著提高林木lncRNA靶基因预测的准确性。
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公开(公告)号：CN109526677A
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201811454975.6
申请日：2018-11-30
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种扦插苗的壮根基质及扦插方法，涉及扦插育苗技术领域。本发明所述壮根基质包括以下重量份的原料：中壤质土1.5～3份，蛭石0.6～1.5份，珍珠岩0.6～1.5份，草炭1.5～2.8份，花多多15号0.05～0.2份。本发明在扦插时，先用细砂土进行萌苗生根，再将生根萌苗移栽至壮根基质上生长直至炼苗移栽大田，利用本发明的方法，不仅可以控制萌苗生根率达90.71～95.88％，还可以将移栽成活率提升到89.82～94.70％。
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公开(公告)号：CN109402285A
公开(公告)日：2019-03-01
申请号：CN201811332420.4
申请日：2018-11-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种基于全基因组DNA甲基化位点基因型的分型方法，涉及植物分子育种技术领域，包括提取相同组织样品的基因组DNA；建立重亚硫酸盐处理的DNA文库，再进行测序，根据测序结果鉴定每个样品的DNA甲基化位点，计算甲基化支持率，根据甲基化位点的DNA甲基化支持率进行基因型分型。本发明提供的方法能够实现DNA甲基化位点等位基因型分型，而且本发明提供的分型方法是在相同时间点采取群体内不同个体的同一组织，可以排除环境效应以及生长状态对DNA甲基化状态的影响。本发明提供的方法利用高通量测序技术方法，对DNA甲基化位点的基因型进行精准分型。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109197598A
公开(公告)日：2019-01-15
申请号：CN201811453977.3
申请日：2018-11-30
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明提供了一种毛白杨组培方法，涉及植物组织培养技术领域。本发明所述方法包括以下步骤：以毛白杨组织为外植体，将所述外植体接种于诱导增殖培养基上进行诱导增殖培养，得增殖芽；将所述增殖芽接种于诱导生根培养基上进行诱导生根培养，得毛白杨组培苗。本发明所述方法不包括传统意义的初代培养，而是直接将外植体材料在消毒后按照材料老化程度直接接种于添加激素的S1或S2进行培养，诱导不定芽产生增殖芽，从而进行生根培养，方案简单，组培效率高，外植体分化芽诱导率达90％，生根诱导率达88.5％。
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公开(公告)号：CN106997429A
公开(公告)日：2017-08-01
申请号：CN201611198893.0
申请日：2017-02-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明涉及一种林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法，属于分子遗传技术领域。本发明提供的林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法包括以下步骤：1)获得林木lncRNA序列；2)利用blast预测方法得到初步筛选后的lncRNA的靶基因；3)利用RNAplex预测方法得到二次筛选后的lncRNA的靶基因；4)对所述步骤3)中的lncRNA及二次筛选后的lncRNA的靶基因的组织特异性表达模式进行检测，计算两者的表达相关性，确定lncRNA及其靶基因之间的相互作用关系。本发明预测方法能够高效、稳定地检测lncRNA及其靶基因的作用区段，并且能够显著提高林木lncRNA靶基因预测的准确性。
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公开(公告)号：CN111863127B
公开(公告)日：2023-06-16
申请号：CN202010690681.4
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法，属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后；确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP；确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因；当同时满足确定条件时，表明待测转录因子调控了候选靶基因表达，可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系，构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
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公开(公告)号：CN109554502A
公开(公告)日：2019-04-02
申请号：CN201910005389.1
申请日：2019-01-03
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , G16B20/00
Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化位点对数量性状加性和显性遗传效应的方法及其应用，属于植物分子育种领域；所述方法包括以下步骤：1)采集种质资源群体样品，进行表型性状检测，并对所述样品进行基因组DNA的提取；2)利用所述样品基因组DNA构建重亚硫酸盐测序文库，测序；3)从所述DNA甲基化测序数据中鉴定DNA甲基化位点，并基因型分型；4)采用Tassel 5.0软件包中的混合线性模型将获得的DNA甲基化位点的基因型分型数据与样品表型性状数据进行关联性分析，筛选显著关联的DNA甲基化位点，并对其加性和显性遗传效应进行分析。所述方法能够为基因标记辅助育种提供了新的技术指导，具有重要的理论与育种价值。
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公开(公告)号：CN109487001A
公开(公告)日：2019-03-19
申请号：CN201910005388.7
申请日：2019-01-03
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短的方法、引物组、试剂盒及其应用，属于植物分子育种技术领域，包括以下步骤：1)测定杨树样品基因组DNA中编码lncRNA LNC-033373的基因内的第189位碱基，编码lncRNA LNC-228084基因内的第346位碱基，Pto-PO46基因内的第171位碱基和Pto-COMT24基因内的第613位碱基；2)根据4个位点基因型的组合判断杨树样品纤维的长短；当所述基因型组合为CT-AG-GT-AA时，杨树样品木材的纤维长度最长，当所述基因型组合为CT-AA-GT-AC时，杨树样品木材的纤维长度最短。所述方法能够应用于杨树育种，缩短育种周期。
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