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公开(公告)号:CN104109719A
公开(公告)日:2014-10-22
申请号:CN201410347613.2
申请日:2014-07-21
Applicant: 贵州茅台酒股份有限公司
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及大曲质量鉴别技术领域,尤其是一种基于箱线图鉴别大曲质量的方法,通过微生物出现频率与相对含量方法对变量进行筛选,并结合箱线图构建大曲质量等级鉴别;可直接对未知分类样品进行等级鉴别,且该模型具有方法思想简单、操作简便、可行性高、判别准确率高的特点。
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公开(公告)号:CN104053789A
公开(公告)日:2014-09-17
申请号:CN201280067404.1
申请日:2012-05-14
Applicant: 深圳华大基因医学有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , G06F19/18 , G06F19/22 , G16H50/20 , G16H50/30 , C12Q2535/122 , C12Q2537/165 , C12Q1/6809
Abstract: 提供了确定胎儿基因组中预定区域碱基信息的方法、系统和计算机可读介质。其中,确定胎儿基因组中预定区域碱基信息的方法,包括下列步骤:针对胎儿基因组DNA样本,构建测序文库;对测序文库进行测序,以便获得胎儿的测序结果,该胎儿的测序结果由多个测序数据构成;基于胎儿的测序结果,结合胎儿遗传相关个体的遗传信息,根据隐马尔可夫模型,确定预定区域的碱基信息。
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公开(公告)号:CN104039982A
公开(公告)日:2014-09-10
申请号:CN201280064063.2
申请日:2012-08-01
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
CPC classification number: G06F19/16 , C12Q1/6809 , C12Q1/689 , G06F19/18 , G06F19/22 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供了一种用于分析环境样品中的微生物群落组成的方法和装置。该方法包括测序、初级组装、分栈、基于栈的高级组装和鉴定等步骤。
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公开(公告)号:CN104004848A
公开(公告)日:2014-08-27
申请号:CN201410254825.6
申请日:2014-06-10
Applicant: 湖南农业大学 , 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明公开了一种早期旱胁迫高羊茅DREB2基因的筛选试剂盒及方法。本发明以PEG6000旱胁迫处理(0h、6h、12h、18h和24h)的高羊茅为实验材料,利用Illumina/Solexa测序平台的RNA-seq技术进行混合转录组测序分析,以已登记的DREB2基因序列为探针进行本地Blast(Local Blast),筛选早期旱胁迫诱导高羊茅DREB2基因。本发明方法可以快速、全面的筛选旱胁迫诱导的高羊茅DREB2候选基因,对抗旱机制研究和植株抗性分子育种具有重要指导意义。
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公开(公告)号:CN101782940B
公开(公告)日:2014-06-11
申请号:CN200910207618.4
申请日:2009-10-16
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
Inventor: R·T·克尼克
CPC classification number: C12Q1/6813 , G06F17/18 , C12Q2527/107 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明名称为通过无公式方法确定熔融温度。进行熔融曲线数据集的一阶导数的数值确定。对于一阶导数值确定基线,并且从一阶导数值减去基线以产生修正的一阶导数值。确定修正的一阶导数值的第一最大值,并且所述第一最大值表示DNA样本的熔融温度Tm。例如高斯混合模型(GMM)函数等具有使用列文伯格-马夸尔特(LM)回归过程所确定的参数的模型函数也可用于查找对一阶导数曲线的近似。数值确定的一阶导数值的最大值用作模型函数的参数的初始条件。所确定参数提供一个或多个分步熔融温度值,它们可被返回,例如被显示或者以其它方式使用,供进一步处理。
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公开(公告)号:CN103797129A
公开(公告)日:2014-05-14
申请号:CN201280028976.9
申请日:2012-04-12
Applicant: 维里纳塔健康公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: G06F19/22 , C12Q1/6809 , C12Q1/6827 , C12Q1/6876 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , G06F19/18 , G06F19/24 , G06F19/26 , C12Q2535/122 , C12Q2537/16 , C12Q2537/165
Abstract: 公开一种从多态性例如小碱基变化或者插入-缺失可靠估计基因组分数(例如,胎儿分数)的方法。来自多基因组源的已测序数据用于确定对于一个或多个多态性等位基因计数。对于一个或多个多态性,接合性是分配的,而基因组分数从接合性和等位基因计数确定。某些实施例使用SNP作为相关多态性。所公开的方法能够应用作为目标在于已知多态性的故意的、预先设计的重测序研究的组成部分,或者能够用在从母体血浆产生的重叠序列中巧合发现的变化的回顾性分析中(或者其他任何存在多人DNA的混合物的设定)。
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公开(公告)号:CN103270176A
公开(公告)日:2013-08-28
申请号:CN201280002881.X
申请日:2012-01-30
Applicant: 索元生物医药(杭州)有限公司
Inventor: 罗文
CPC classification number: C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , G06F19/18 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及发现药物基因组生物标志物的方法,所述药物基因组生物标志物与针对治疗剂的各种个体反应(有效性、副作用、及其他终点)相关。本发明提供使用存档临床样本进行全基因组关联研究的方式,以识别新型药物基因组生物标志物。新发现的生物标志物能够被纳入伴随诊断测试中,其有助于预测药物反应,和仅对将受益于治疗的人群用药,或排除那些可能对所述治疗产生副作用的人群。
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公开(公告)号:CN103201744A
公开(公告)日:2013-07-10
申请号:CN201180049765.9
申请日:2011-10-12
Applicant: 考利达基因组股份有限公司
CPC classification number: G16B20/00 , C12Q1/6809 , C12Q1/6827 , G16B25/00 , G16B30/00 , G16B40/00 , C12Q2537/16 , C12Q2537/165
Abstract: 本文公开了确定位于样品中靶序列的检测位置处的基因组区域的拷贝数的方法。对样品中靶序列的基因组区域进行测序并且获得序列覆盖范围的测量数据。校正序列覆盖偏差并且可针对基线样品进行标准化。进行隐马尔可夫模型(HMM)分段、评分以及输出,并且在一些实施方案中,还可进行基于群体的无读取与低置信区域的鉴定。然后估算多个区域的总拷贝数值与区域特异的拷贝数值。
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公开(公告)号:CN1987880B
公开(公告)日:2012-06-27
申请号:CN200610169377.5
申请日:2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定了参数,就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。如果选择用于计算扩增曲线的周期阈值的任意荧光水平(AFI)方法,则标准化对于确定周期阈值来说是有利的。在标准化之后,通过应用求根算法以确定表示标准化曲线的函数的根来处理该标准化曲线,所述根对应于周期阈值。该周期阈值然后被返回并可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号:CN102304572A
公开(公告)日:2012-01-04
申请号:CN201110240425.6
申请日:2007-06-26
Applicant: INJE大学校产学协力团
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q1/6827 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及用于确定细胞色素P450 2D6(CYP2D6)基因的基因型的单倍型标签单核苷酸多态性(htSNP)和使用所述htSNP的基因芯片,更具体而言,涉及用于确定人类CYP2D6基因的单倍型的htSNP的选择方法、使用所述htSNP确定所述基因的基因型的方法和用于所述方法的基因芯片。
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