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公开(公告)号：CN101908037B
公开(公告)日：2013-04-03
申请号：CN201010241643.7
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/0053 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。在标准化之后，处理标准化曲线以确定曲线在沿着该曲线的一些或所有点处的曲率，例如以产生表示曲率对周期数的数据集或图。出现最大曲率的周期数对应于Ct值。该Ct值然后被返回并且可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN101908037A
公开(公告)日：2010-12-08
申请号：CN201010241643.7
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/0053 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。在标准化之后，处理标准化曲线以确定曲线在沿着该曲线的一些或所有点处的曲率，例如以产生表示曲率对周期数的数据集或图。出现最大曲率的周期数对应于Ct值。该Ct值然后被返回并且可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN101872386A
公开(公告)日：2010-10-27
申请号：CN201010176765.2
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
Inventor： R·T·库尔尼克
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及利用双S形LEVENBERG-MARQUARDT和稳健线性回归的温度阶跃校正。本发明提供用于通过针对在PCR过程期间可能出现的温度变化对PCR数据进行校正来改进PCR扩增曲线中的Ct确定的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到在温度变化之后的区域中曲线的一部分的近似，其中出现温度变化的周期称为“CAC”。为在温度变化之前的区域中曲线的一部分确定稳健线性近似。利用线性近似和LM方法来确定周期CAC或CAC+1的荧光强度的值，并且从表示在出现温度变化之前曲线的一部分的数据集的一部分中减去这些值的差值，以产生已校正变化的数据集。该已校正变化的数据集可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN101872386B
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201010176765.2
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
Inventor： R·T·库尔尼克
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及利用双S形LEVENBERG-MARQUARDT和稳健线性回归的温度阶跃校正。本发明提供用于通过针对在PCR过程期间可能出现的温度变化对PCR数据进行校正来改进PCR扩增曲线中的Ct确定的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到在温度变化之后的区域中曲线的一部分的近似，其中出现温度变化的周期称为“CAC”。为在温度变化之前的区域中曲线的一部分确定稳健线性近似。利用线性近似和LM方法来确定周期CAC或CAC+1的荧光强度的值，并且从表示在出现温度变化之前曲线的一部分的数据集的一部分中减去这些值的差值，以产生已校正变化的数据集。该已校正变化的数据集可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN102782674B
公开(公告)日：2015-07-22
申请号：CN201080038063.6
申请日：2010-08-25
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
IPC: G06F17/18
CPC classification number: G06F17/10 , C12Q1/6851 , G06F19/24 , C12Q2537/165
Abstract: 提供了用于处理PCR曲线且用于识别抛物线状PCR曲线的存在的系统和方法。PCR曲线的分段线性逼近的使用使得在抛物线状PCR曲线的情况下能够确定更实际的肘值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN1987880B
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN200610169377.5
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定了参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。如果选择用于计算扩增曲线的周期阈值的任意荧光水平(AFI)方法，则标准化对于确定周期阈值来说是有利的。在标准化之后，通过应用求根算法以确定表示标准化曲线的函数的根来处理该标准化曲线，所述根对应于周期阈值。该周期阈值然后被返回并可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN102782674A
公开(公告)日：2012-11-14
申请号：CN201080038063.6
申请日：2010-08-25
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
IPC: G06F17/18
CPC classification number: G06F17/10 , C12Q1/6851 , G06F19/24 , C12Q2537/165
Abstract: 提供了用于处理PCR曲线且用于识别抛物线状PCR曲线的存在的系统和方法。PCR曲线的分段线性逼近的使用使得在抛物线状PCR曲线的情况下能够确定更实际的肘值。
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公开(公告)号：CN101004766A
公开(公告)日：2007-07-25
申请号：CN200610169383.0
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
Inventor： R·T·库尔尼克
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供用于通过针对在PCR过程期间可能出现的温度变化对PCR数据进行校正来改进PCR扩增曲线中的Ct确定的系统和方法。具有通过Levenberg－Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到在温度变化之后的区域中曲线的一部分的近似，其中出现温度变化的周期称为“CAC”。为在温度变化之前的区域中曲线的一部分确定稳健线性近似。利用线性近似和LM方法来确定周期CAC或CAC+1的荧光强度的值，并且从表示在出现温度变化之前曲线的一部分的数据集的一部分中减去这些值的差值，以产生已校正变化的数据集。该已校正变化的数据集可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN101004765A
公开(公告)日：2007-07-25
申请号：CN200610169374.1
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg－Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。在标准化之后，处理标准化曲线以确定曲线在沿着该曲线的一些或所有点处的曲率，例如以产生表示曲率对周期数的数据集或图。出现最大曲率的周期数对应于Ct值。该Ct值然后被返回并且可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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公开(公告)号：CN1987880A
公开(公告)日：2007-06-27
申请号：CN200610169377.5
申请日：2006-12-19
Applicant: 霍夫曼-拉罗奇有限公司
CPC classification number: G06F17/17 , C12Q1/6851 , G06F17/10 , G06K9/00503 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明涉及用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg－Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定了参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。如果选择用于计算扩增曲线的周期阈值的任意荧光水平(AFI)方法，则标准化对于确定周期阈值来说是有利的。在标准化之后，通过应用求根算法以确定表示标准化曲线的函数的根来处理该标准化曲线，所述根对应于周期阈值。该周期阈值然后被返回并可以被显示或另外被用于进一步的处理。
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