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公开(公告)号：CN114898808A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210823538.7
申请日：2022-07-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明“一种预测肺炎克雷伯菌对头孢吡肟敏感性的方法及系统”属于分子生物技术领域。所述方法的特征是：按下述公式I计算h(x)值：公式I：；其中，C1‑C5分别为TEM‑1基因、KPC‑1基因、CTX‑M‑65、rmtB基因、AAC(6’)‑Ib‑cr6基因分别在待预测的肺炎克雷伯菌菌株中的拷贝数。采用本发明的方法和系统进行肺炎克雷伯菌对头孢吡肟敏感性的预测的准确率约93%。
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公开(公告)号：CN114898800A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210823391.1
申请日：2022-07-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明“一种预测肺炎克雷伯菌对头孢曲松敏感性的方法及系统”属于分子生物技术领域。所述方法的特征是，按下述公式I计算h(x)值：公式I：；其中，C1‑C6分别为sul1基因、tet(A)基因、QnrS1基因、AAC(6')‑Ib‑cr6基因、KPC‑1基因、TEM‑1基因分别在待预测的肺炎克雷伯菌菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行肺炎克雷伯菌对头孢曲松敏感性的预测的准确率约90%。
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公开(公告)号：CN119753187A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202510022446.2
申请日：2025-01-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京京东方知微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/325 , C12R1/32
Abstract: 本发明提供了一种鉴定分枝杆菌菌种的引物探针组合、试剂盒及其鉴定方法和应用，属于生物技术领域。本发明的引物探针组合至少包括1对引物和1条探针用于鉴定鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌，6对引物和6条探针分别用于鉴定脓肿分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、偶然分枝杆菌、海分枝杆菌/溃疡分枝杆菌、戈登分枝杆菌和瘰疬分枝杆菌，2对引物和2条探针用于鉴定结核分枝杆菌复合群，1对引物和1条探针用于鉴定内标。本发明可实现1个样本同步检测多个指标(最多9个指标)，同时鉴定结核分枝杆菌复合群和多种非结核分枝杆菌；且检测灵敏度高，结核分枝杆菌复合群最低检出限为50CFU/mL，非结核分枝杆菌最低检出限为500CFU/mL。
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公开(公告)号：CN115992267B
公开(公告)日：2023-11-03
申请号：CN202210832657.9
申请日：2022-07-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京金匙医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6869 , C12R1/01 , C12R1/185 , C12R1/22 , C12R1/32 , C12R1/38 , C12R1/44 , C12R1/46 , C12R1/445
Abstract: 本发明“一种高通量高精度检出多种病原微生物的引物组合”属于分子生物学领域。所述一种高通量高精度检出多种病原微生物的引物组合，其特征在于，包括：引物池1、引物池2、引物池3；所述引物池1由引物对1、引物对2、引物对3、引物对4、引物组5组成；所述引物池2由引物对6、引物对7、引物对8、引物对9组成；所述引物池3由引物对10、引物组11、引物对12、引物对13、引物对14、引物对15、引物对16组成。基于本发明的引物组合构建的引物池可同时检测高达20种以上的微生物，且对无论人源样本还是微生物样本或质粒样本都能达到较高的灵敏度和精确度。
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公开(公告)号：CN116536436A
公开(公告)日：2023-08-04
申请号：CN202310538072.0
申请日：2023-05-12
Applicant: 予果生物科技(北京)有限公司 , 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/689 , C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12R1/19 , C12R1/22 , C12R1/385 , C12R1/37 , C12R1/01 , C12R1/42 , C12R1/46 , C12R1/445 , C12R1/725
Abstract: 本发明属于生物检测技术领域，涉及一种用于血流感染多靶标检测的引物组及试剂盒，本发明提供的引物组提供了多个靶标，可高灵敏度地检测临床常见和高发微生物造成的侵袭性感染。本发明还提供了一种试剂盒，包含引物组和PCR缓冲液，两者组合能进一步提高检出限，并减少了后续测序检测微生物时样本DNA的损失，提高了样本DNA的得率。
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公开(公告)号：CN115466682A
公开(公告)日：2022-12-13
申请号：CN202211416787.0
申请日：2022-11-14
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 予果生物科技(北京)有限公司
IPC: C12N1/04
Abstract: 本发明属于微生物保存技术领域，涉及一种微生物保存液及其使用方法。本发明提供的微生物保存液，以质量份计，由以下有效成分构成：聚乙烯醇42‑75份、低密度脂蛋白2‑3份、四氢嘧啶6‑40份、硫乙醇酸钠0.5‑1.2份和甘油100份。本发明提供的微生物保存液为微生物保存提供载体，能有效保护微生物活性，提高菌体存活率和菌体活性。
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公开(公告)号：CN115064218B
公开(公告)日：2022-11-25
申请号：CN202210986706.4
申请日：2022-08-17
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本申请公开了一种构建病原微生物数据鉴定平台的方法及装置，所述方法包括：将病原微生物数据进行去重复、去缺失、删除无关信息、数值替换和数据类型转化处理；利用处理后的病原微生物数据构建数据集，所述数据集包括所述处理后的病原微生物数据和与所述处理后的病原微生物数据对应的数据鉴定标签；基于所述数据集，使用PreAI算法构建模型；根据所述模型构建平台。本申请通过对病原微生物数据中的重复、缺失、无关信息等内容进行去除，并且对部分数据进行了数值替换和数据类型转化，有效提高了后续对于模型训练的效率以及准确性，从而能够有效减少鉴定病原微生物数据所需要耗费的时间成本和人工成本。
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公开(公告)号：CN112538542B
公开(公告)日：2022-11-22
申请号：CN202011356499.1
申请日：2020-11-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本公开涉及一种用于龟分枝杆菌检测的试剂盒及系统，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括yjcH基因、mpr基因、rrl C2638T位点和rrl G2654A位点中的至少一种。通过识别上述分子标志物，本公开能够实现龟分枝杆菌的精确检测。
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公开(公告)号：CN115101126A
公开(公告)日：2022-09-23
申请号：CN202210164390.0
申请日：2022-02-22
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京阅微基因技术股份有限公司
Abstract: 本发明涉及生物信息学分析领域，具体公开一种基于CE平台的针对呼吸道病毒和/或细菌亚型的引物设计方法和流程，该方法能够有效对选定的病毒和/或细菌进行引物设计，可识别大多数亚型，相较于传统方法具有显著的特异性和准确性优势。
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公开(公告)号：CN113528295A
公开(公告)日：2021-10-22
申请号：CN202111058453.6
申请日：2021-09-10
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京博奥晶典生物技术有限公司
Abstract: 本发明“一种可多步时序反应的微流控芯片、微流控方法及其应用”属于微流控芯片技术领域。所述微流控芯片包括：反应腔、缓冲分流单元、以及可连通反应腔和缓冲分流单元的管路；所述反应腔沿流体流动方向从上游、中游至下游依次设置若干个；上游反应腔的出口可通过管路与中游反应腔的入口相连通；中游反应腔可通过管路与下游反应腔相连通；缓冲分流单元可暂时储存或缓冲流体并分流流体；缓冲分流单元的出口可经管路与中游反应腔相连通；中游反应腔上、缓冲分流单元内均设有定量分流机构。采用本发明的芯片、方法进行反应检测，能保持很高的检测灵敏度，能满足各类生物实验，尤其适用于大规模临床诊断，高效灵敏、操作便捷、应用范围极为广泛。
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