公开(公告)号：CN113502338A

公开(公告)日：2021-10-15

申请号：CN202111000339.8

申请日：2021-08-27

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 杨立桃 ,  徐文婷 ,  张大兵

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种转基因阮蛋白羊品系特异性数字PCR检测试剂盒及检测方法；包括：受检样本的前处理及DNA的提取；针对特异性序列设计数字PCR引物和探针；优化的实验扩增体系；将待测DNA稀释后加入反应体系中，通过微滴生成仪生成油包水微滴，经PCR进行扩增，通过微滴分析仪识别所有微滴的荧光信号并给出计数结果。本发明相比传统的qPCR技术具有灵敏度显著提升，特异性强，精确度好，以及不依赖标准曲线，可以对样本进行绝对定量，缩小假阴性的优势，特别在对低拷贝数和痕量样本具有重要意义；本方法对于转基因羊的常规监管和检测提供技术依据，对于科研单位和高校的转基因羊研究同样适用，有广泛的潜在应用前景。

公开(公告)号：CN107858444A

公开(公告)日：2018-03-30

申请号：CN201711031096.8

申请日：2017-10-24

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张大兵 ,  石建新 ,  李荣 ,  杨立桃

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2561/113 ,  C12Q2545/114

Abstract: 本发明提供了一种转基因水稻G6H1品系特异性定量PCR检测方法，包括以下步骤：A1、设计合成引物和荧光探针；所述引物的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示，所述荧光探针的序列如SEQ ID No.3所示；A2、制备G6H1品系的DNA模板稀释液；A3、配制定量PCR反应体系；A4、进行定量PCR检测。本发明的方法具有高效、灵敏、准确等优点，适合于转基因抗虫耐除草剂水稻G6H1及其制品的定量检测。

公开(公告)号：CN103525810B

公开(公告)日：2016-06-01

申请号：CN201310430113.0

申请日：2013-09-18

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张大兵 ,  杨立桃 ,  石建新 ,  郭金超 ,  饶军

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种转植酸酶基因玉米外源基因插入位点旁侧序列及检测方法，所述旁侧序列为3’端旁侧序列，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述检测方法包括以下步骤：提取玉米基因组DNA模板；依据SEQ ID No.1中1～3655bp位序列设计正向引物，依据SEQ ID No.1中3656～5299bp位序列设计反向引物；配制PCR反应体系；进行PCR扩增反应；将扩增产物在琼脂糖胶上电泳，若能够扩增出206bp产物，则样品为转植酸酶基因玉米BVLA430101。本发明能够高效、灵敏、准确地鉴定植酸酶基因玉米BVLA430101，以及以转植酸酶基因玉米BVLA430101为亲本的玉米品系。

公开(公告)号：CN103525910B

公开(公告)日：2015-01-14

申请号：CN201310429846.2

申请日：2013-09-18

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张大兵 ,  杨立桃 ,  石建新 ,  郭金超 ,  饶军

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种转植酸酶基因玉米BVLA430101品系特异性定量PCR检测方法，包括以下步骤：合成引物及与引物配合使用的荧光探针，上游引物的核苷酸序列如SEQID NO:1所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示，荧光探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；步骤2，从转植酸酶基因玉米BVLA430101中提取出DNA并制备其稀释液；步骤3，配制PCR反应体系；步骤4，将DNA稀释液加入到PCR反应体系中，采用定量PCR仪对所述DNA稀释液进行PCR扩增反应并检测。本发明的方法具有高效、灵敏、准确等优点，适合转植酸酶基因玉米BVLA430101及其加工产品的定量检测。

公开(公告)号：CN103667450A

公开(公告)日：2014-03-26

申请号：CN201310557335.9

申请日：2013-11-11

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 杨立桃 ,  陶生策 ,  张大兵 ,  邵宁 ,  蒋诗萌

IPC: C12Q1/68 ,  C40B40/06

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2537/143 ,  C12Q2565/501

Abstract: 本发明公开了一种适用于转基因产品高通量检测的DNA芯片；所述DNA芯片的载体上固定可检测97个转基因靶标的特异性DNA探针，所述DNA探针的核酸序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.97所示。本发明的97种寡核苷酸探针是针对目前最为普遍存在的、涉及8种作物品种的转基因插入序列以及内源基因而设计的，具有高度特异性；利用高密度DNA芯片技术，可同步检测样品中多个转基因成分的靶标序列，具有高效，高准确性，高灵敏度的特点。本发明将在转基因产品检测和标识管理领域有广泛的应用。

公开(公告)号：CN1740322A

公开(公告)日：2006-03-01

申请号：CN200510027952.3

申请日：2005-07-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 张大兵 ,  杨立桃 ,  潘爱虎 ,  梁婉琪 ,  尹长松 ,  许诵辞 ,  章可为 ,  武爱波

IPC: C12N15/29 ,  C12N15/53 ,  C12N15/82 ,  C12Q1/68

Abstract: 一种玉米品系MON863的外源插入载体的旁邻基因序列，本发明的MON863玉米外源插入载体的旁邻基因序列，包括：编码玉米NADH脱氢酶亚单位1和2的部分的核苷酸序列，而且所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.1中从核苷酸第1－253位的核苷酸序列完全相同或SEQ ID NO.2中从核苷酸第138－411位的核苷酸序列完全相同；编码烟草花椰病毒的35S启动子的部分序列，其来源于外源插入载体PV－ZMIR13，而且所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.1中从核苷酸第254－456位的核苷酸序列完全相同；编码小麦tahsp 17 3’终止子的部分序列，其来源于外源插入载体PV－ZMIR13，而且所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.2中从核苷酸第1－137位的核苷酸序列完全相同。本发明可以进一步用于建立转基因品系特异性PCR检测方法。