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公开(公告)号：CN117286223A
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202210703566.5
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一锅法滚环转录和CRISPR/Cas介导的核酸检测方法及试剂盒；所述核酸检测方法，包括S1、从待检测样本中提取总核酸；S2、配置反应体系，反应体系包括单链DNA探针、RNA荧光探针、DNA连接酶或其变体、RNA聚合酶或其变体、向导RNA或其衍生物、CRISPR相关Cas蛋白或其变体、PROTRACTOR反应缓冲液；S3、将提取的总核酸加入反应体系中，进行恒温反应，并产生荧光信号；其中单链DNA探针与目标核酸分子的一条链特异性的互补，并在DNA连接酶或其变体作用下形成单链环状DNA探针；S4、读取和记录PROTRACTOR产生荧光信号，通过荧光信号来判断待检测样本中目标核酸分子的有无。
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公开(公告)号：CN106854674B
公开(公告)日：2021-03-09
申请号：CN201510901558.1
申请日：2015-12-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开一种生物医学技术领域的基于毛细管微阵列的核酸高通量快速检测方法；所述方法为利用毛细管组装、浇铸、机械加工等方式加工出微阵列，内含若干亲水性垂直微管道，阵列的外表面采用化学方法进行超疏水性修饰；将若干组核酸扩增引物分别加入若干微管道中并干燥固定，将微阵列置于反应管中；然后利用特殊加样装置通过虹吸方式将核酸扩增反应组分一次性引入各微管道中，放入温控装置中进行扩增反应；通过在反应中连续测量或反应后一次测量微管道内的荧光信号分别实现实时检测和终点检测；扩增产物也可回收用于后续其它用途。本发明可在一次反应中快速方便地实现对多个核酸靶标的检测。本发明将在核酸多重检测、现场检测等领域有广泛的应用。
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公开(公告)号：CN103525810A
公开(公告)日：2014-01-22
申请号：CN201310430113.0
申请日：2013-09-18
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种转植酸酶基因玉米外源基因插入位点旁侧序列及检测方法，所述旁侧序列为3’端旁侧序列，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述检测方法包括以下步骤：提取玉米基因组DNA模板；依据SEQ ID No.1中1～3655bp位序列设计正向引物，依据SEQ ID No.1中3656～5299bp位序列设计反向引物；配制PCR反应体系；进行PCR扩增反应；将扩增产物在琼脂糖胶上电泳，若能够扩增出206bp产物，则样品为转植酸酶基因玉米BVLA430101。本发明能够高效、灵敏、准确地鉴定植酸酶基因玉米BVLA430101，以及以转植酸酶基因玉米BVLA430101为亲本的玉米品系。
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公开(公告)号：CN114958978A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210704969.1
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/682 , C12Q1/6876 , C12Q1/70 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种一锅法单链DNA环化扩增和CRISPR/Cas介导的核酸分子检测方法，本发明包括：单链DNA探针环化、滚环扩增、单链DNA的双探针CRISPR/Cas剪切识别及其单管一锅法检测反应。本发明主要针对环化、扩增、剪切识别不能同步进行的难题，采用一种同时衔接环化、扩增和剪切识别三步反应的OPERATOR技术，在体外单一反应管体系中对核酸分子精确、灵敏、快速检测。本发明相比传统的核酸分子检测方法，具有如下优点：适用于单链DNA、双链DNA和RNA分子的灵敏快速检测。特别是，检测RNA时不需要逆转录；直接进行一锅法检测，不需要分步反应，在核酸分子检测领域具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号：CN112795665A
公开(公告)日：2021-05-14
申请号：CN202110239002.6
申请日：2021-03-04
Applicant: 上海交通大学苏北研究院
Inventor： 杨立桃
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种牛源性成分的LAMP检测方法，包括以下步骤：a)设计合成引物；所述引物由上游内部引物FIP、下游内部引物BIP、上游外部引物F3和下游外部引物B3组成，所述引物的碱基序列如SEQ ID No：1～4；b)制备牛属北美野牛、奶牛、牦牛、水牛的DNA稀释液；c)配制LAMP反应体系并设定反应条件；d)进行LAMP方法特异性检测；e)进行LAMP方法灵敏度检测。本发明建立的方法具有快速、高效、灵敏、准确等优点，在动物源性成分食品监管和检验检疫工作中有实际应用价值，尤其适用于基层实验室和现场检测的推广和应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112481390A
公开(公告)日：2021-03-12
申请号：CN202011424383.7
申请日：2020-12-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物学,涉及转基因生物检测领域,公开了一种转基因溶菌酶羊品系特异性微滴式数字PCR引物及基于该引物的检测方法。所述引物包括正向引物GM‑LYZ‑5‑F和反向引物GM‑LYZ‑5‑R，所述正向引物GM‑LYZ‑5‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述反向引物GM‑LYZ‑5‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明相比传统的qPCR技术具有灵敏度高,特异性强,精确度好,以及不依赖标准曲线绝对定量的优势,特别在对低拷贝数和痕量样本具有重要意义；本方法对于转基因羊的常规监管和检测提供技术依据,对于科研单位和高校的转基因羊研究同样适用,有广泛的潜在应用前景。
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公开(公告)号：CN103131628A
公开(公告)日：2013-06-05
申请号：CN201310044150.8
申请日：2013-02-04
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种植物基因组DNA快速提取装置及其检测方法。所述DNA快速提取装置由若干底部装有海绵的注射器，提取柱子以及若干离心管组成；提取柱子的上端部可与注射器的注射口密封连接，提取柱子的下端部可与离心管连接，所述提取柱子的下端部连接有装载封盖，所述装载封盖装载二氧化硅膜并卡嵌在所述提取柱子的下端部内侧，所述装载封盖的中心设有通孔。与现有技术相比，本发明运用气压法代替了离心机等大型仪器，用二氧化硅膜来结合核酸分子，提供了一种简单有效的植物基因组DNA快速提取装置，提取流程简单方便，没有贵重仪器的依赖性，检测时间短，检测方法具有很高的灵敏度，解决了转基因产品现场快速检测的难题。
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公开(公告)号：CN101948926A
公开(公告)日：2011-01-19
申请号：CN201010299121.2
申请日：2010-10-02
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68 , G01N27/447
Abstract: 一种生物基因检测技术领域的基于毛细管凝胶电泳检测的微滴聚合酶链式反应分析方法，通过多重模板的合成、通用微滴PCR扩增以及毛细管凝胶电泳分析得以实现。本发明可做为生物学研究中高通量DNA分子分析的一种手段，对多个DNA分子同时进行检测，提高了分析的通量，极大的减少了宝贵的样品和试剂的消耗。
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公开(公告)号：CN109797204A
公开(公告)日：2019-05-24
申请号：CN201910133177.1
申请日：2019-02-22
Applicant: 上海交通大学苏北研究院
Inventor： 杨立桃
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开一种新的基于圆盘状毛细管微阵列的可视化多重核酸检测方法，所述方法为利用PDMS基座制作、毛细管组装、亲疏水处理等方式加工出微阵列，内含亲水性圆盘状微管道，阵列的外表面采用化学方法进行超疏水性修饰，可将若干组核酸扩增引物分别加入不同毛细管中并干燥固定，然后利用圆盘状毛细管微阵列的中心圆孔通过虹吸方式将核酸扩增反应组分一次性引入各微管道中，放入温控装置中进行扩增反应，通过观察毛细管通道内的荧光信号实现检测，本发明可在一次反应中快速方便地实现对多个核酸靶标的检测，同时该毛细管微阵列可进一步扩展实现更多通量的检测。
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公开(公告)号：CN100378230C
公开(公告)日：2008-04-02
申请号：CN200510110990.5
申请日：2005-12-01
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种H5、H7、H9亚型禽流感病毒的实时荧光定量PCR检测方法，属于生物工程技术领域。本发明包括如下步骤：标准分子的构建；病毒特异性定量PCR引物和探针设计；病毒样本RNA的提取；对提取的样本RNA进行反转录聚合酶链式反应得到样本cDNA；M基因定量PCR检测方法的优化和建立；禽流感病毒亚型特异性定量PCR检测方法的优化和建立。本发明检测灵敏度达到20个拷贝的病毒分子，对于单个样本检测时间为2个小时，操作简便，并且可以同时进行大批量的样本分析，较传统的利用鸡胚进行病毒分离培养的方法在灵敏度和检测时间方面有了极大的提高，对于禽流感病毒的监控、鉴定具有很大的帮助和很高的应用前景。
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