一种不依赖于先证者的单体型构建方法

    公开(公告)号:CN114999570A

    公开(公告)日:2022-09-02

    申请号:CN202210935337.6

    申请日:2022-08-05

    Abstract: 本发明公开了一种不依赖于先证者的单体型构建方法。所述方法包括:对夫妻双方中致病变异携带者亲本一方的DNA样本进行长片段测序;对致病变异携带者亲本的测序数据进行全基因组分析,获得其致病变异的基因型信息;筛选在致病变异携带者亲本中的杂合型SNPs;集合所述杂合型SNPs进行全基因组组装与分型;根据致病变异所在的长片段组装信息,获得致病变异位点的分型结果;根据致病位点的分型结果标记致病变异携带者亲本的单体型,构建致病变异携带者亲本的致病/正常单体型。本发明仅对染色体致病变异携带者进行长片段测序,构建携带者的单体型,可有效应用于遗传筛查,结合胚胎的SNP连锁分析校正,可实现整条染色体的单体型准确分型。

    一种构建环状染色体的单体型的方法

    公开(公告)号:CN116875661A

    公开(公告)日:2023-10-13

    申请号:CN202310881174.2

    申请日:2023-07-18

    Abstract: 本发明公开了一种构建环状染色体的单体型的方法。所述方法包括:对环状染色体携带者的DNA样本进行长片段全基因组测序,测序后进行全基因组变异分析,筛选在环状染色体携带者中的杂合型SNPs,通过对环状染色体携带者的长片段测序数据进行全基因组组装,集合所述杂合型SNPs进行全基因组分型,检测和筛选环状染色体的长片段DNA分子,获得环状染色体的分型结果,标记环状染色体携带者的携带型单体型,构建环状染色体携带者的携带型和正常型单体型。本发明的方法有利于阻断环状染色体遗传给后代,不需要先证者即可构建环状染色体携带的单体型,扩大了植入前染色体结构变异遗传学检测的适用范围。

    RNA提取试剂盒及RNA提取方法

    公开(公告)号:CN113832145A

    公开(公告)日:2021-12-24

    申请号:CN202111318802.3

    申请日:2021-11-09

    Abstract: 本发明涉及一种RNA提取试剂盒及RNA提取方法。该RNA提取试剂盒包括变性裂解剂和蛋白分离剂,变性裂解剂包括异硫氰酸胍和β‑巯基乙醇,异硫氰酸胍的摩尔量和β‑巯基乙醇的体积之比为(1mol~6mol):(1mL~15mL);蛋白分离剂包括辛酸。将异硫氰酸胍、β‑巯基乙醇与辛酸结合使用,则能够在不含苯酚和氯仿的条件下,提高RNA得率,减少GC含量低的RNA的丢失。

    植入前胚胎的全基因组分型的方法及装置

    公开(公告)号:CN118841075A

    公开(公告)日:2024-10-25

    申请号:CN202411157426.8

    申请日:2024-08-22

    Abstract: 本申请涉及植入前胚胎的全基因组分型的方法及装置,该方法包括如下步骤:基于双方亲本的基因组长片段测序的信息构建双方亲本的单体型的集合;基于胚胎基因组SNP信息和所述双方亲本的单体型的集合构建胚胎单体型的集合;基于所述双方亲本的单体型的集合扩充所述胚胎单体型的集合;对扩充后的胚胎单体型的集合进行数据质控和数据转换;以及,以人群基因组为参考对转换后的数据进行基因型插补,将所得的插补结果与亲本双链基因型结合,组建全基因组胚胎基因型。该方法提高胚胎未检测基因型的识别,实现胚胎基因组更大的检测覆盖。

    模型训练方法、反复种植失败识别方法及装置

    公开(公告)号:CN117877582A

    公开(公告)日:2024-04-12

    申请号:CN202410082445.2

    申请日:2024-01-19

    Abstract: 本申请涉及一种模型训练方法、反复种植失败识别方法、装置、计算机设备、存储介质和计算机程序产品。通过获取样本数据,分别对第一测序数据样本和第二测序数据样本进行分析处理,得到对应的目标miRNA的表达量,基于第二测序数据样本中目标miRNA的表达量进行特征筛选,确定miRNA特征集合,根据第一测序数据样本和第二测序数据样本,确定与miRNA特征集合对应的第一表达量集合和第二表达量集合,采用第一表达量集合和第二表达量集合训练预测模型,直到预测模型收敛,得到目标预测模型。由于样本数据是正样本和负样本的测序数据,相较于传统的通过活检提取子宫内膜组织进行评估的方式,可以实现无创的样本提取,通过机器学习方法训练能够提高模型预测的准确性。

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