一种染色体结构变异的识别装置
    2.
    发明公开

    公开(公告)号:CN119132412A

    公开(公告)日:2024-12-13

    申请号:CN202411278973.1

    申请日:2024-09-12

    Abstract: 本发明实施例公开了一种染色体结构变异的识别装置。该装置包括:基因组位置获取模块,用于获取目标样本对于染色体结构变异的核型结果的基因组位置;条码信息得到模块,用于在基因组位置对应的染色体上进行滑窗,以得到每个窗口分别对应的条码的条码信息;候选结构体变异区域确定模块,用于根据全部窗口中的每两个目标窗口分别对应的条码信息,确定共享条码比例,以根据确定出的各共享条码比例,确定染色体上的候选结构体变异区域;染色体结构变异识别模块,用于根据各候选结构体变异区域分别对应的窗口位置及染色体上的核型条带的条带位置,得到染色体上的目标结构变异区域。本发明实施例的技术方案,可以提高染色体结构变异识别的灵敏性。

    检测α-珠蛋白基因型的方法和装置

    公开(公告)号:CN117976059A

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202410392065.9

    申请日:2024-04-02

    Abstract: 本申请涉及一种检测α‑珠蛋白基因型的方法和装置,方法包括:获取检测样本集中各样本的测序数据和参考基因组的比对数据;根据第一目标检测样本集的比对数据确定第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数,根据第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数确定待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型;根据第二目标检测样本集的比对数据确定待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点,根据待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点和待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型确定待分析样本的α‑珠蛋白第二预测基因型。本申请借助于融合断点的检测,可更精确的解读α‑珠蛋白的基因型。

    一种检测单亲二倍体和杂合性缺失的方法、装置、存储介质和设备

    公开(公告)号:CN114921536A

    公开(公告)日:2022-08-19

    申请号:CN202210749277.9

    申请日:2022-06-28

    Abstract: 本发明公开了一种检测单亲二倍体和杂合性缺失的方法、装置、存储介质和设备。所述方法包括以下步骤:(1)对待测样本的测序数据进行变异检测,得到样本的变异信息文件;(2)筛选样本的SNP位点;(3)进行假设检验,所述假设检验包括单亲二倍体检测和杂合性缺失检测;(4)采用环状二元分割算法进行区域合并;(5)判断是否为单亲二倍体和/或杂合性缺失。本发明建立了一种基于SNP位点检测UPD和AOH的方法,不受限于平台,既可以应用到芯片平台,也可以应用到全外显子测序和全基因组测序,实现了单亲样本检测UPD,能够很好地识别UPD和AOH,而且操作简单,快速方便,满足广泛推广应用的要求。

    一体化检测CNV、单亲二体、三倍体和ROH的方法及装置

    公开(公告)号:CN114049914B

    公开(公告)日:2022-04-15

    申请号:CN202210039954.8

    申请日:2022-01-14

    Abstract: 本发明公开了一体化检测CNV、单亲二体、三倍体和ROH的方法及装置。所述方法包括以下步骤:(1)获取样本基因组上覆盖深度信息及SNP基因型信息;(2)构建单亲二体及三倍体分析参考数据库、CNV分析参考数据库和ROH分析参考数据库;(3)进行单亲二体及三倍体分析、CNV分析和ROH分析。本发明的一体化检测CNV、单亲二体、三倍体和ROH的方法,能够基于全基因组测序数据,一体化检测出CNV、单亲二体、三倍体和ROH区域,简化了检测流程,提高了检测效率且降低了检测成本。

    检测α-珠蛋白基因型的方法和装置

    公开(公告)号:CN117976059B

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202410392065.9

    申请日:2024-04-02

    Abstract: 本申请涉及一种检测α‑珠蛋白基因型的方法和装置,方法包括:获取检测样本集中各样本的测序数据和参考基因组的比对数据;根据第一目标检测样本集的比对数据确定第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数,根据第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数确定待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型;根据第二目标检测样本集的比对数据确定待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点,根据待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点和待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型确定待分析样本的α‑珠蛋白第二预测基因型。本申请借助于融合断点的检测,可更精确的解读α‑珠蛋白的基因型。

    一种一体化文库构建的方法及其应用

    公开(公告)号:CN117683853A

    公开(公告)日:2024-03-12

    申请号:CN202311681283.6

    申请日:2023-12-08

    Abstract: 本发明公开了一种一体化文库构建的方法及其应用。所述方法包括:使用第一核酸内切酶和第二核酸内切酶对基因组DNA进行酶切得到酶切产物,将酶切产物与测序接头连接,得到连接产物,将筛选后的连接产物与多重PCR扩增得到的扩增子库混合,使用引物进行文库PCR反应,即得所述一体化核酸文库;所述第一核酸内切酶包括BfaI;所述第二核酸内切酶包括MboI;所述多重PCR扩增子库由一端含有BfaI酶切位点识别序列,另一端含有MboI酶切位点识别序列的DNA片段组成。本发明方法实现了在均匀覆盖全基因组CNV和SNP的同时,对漏检遗传病区域进行针对性的捕获富集,提供了一种更完善和准确的一体化高通量测序检测方法。

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