一种评估无参物种酵母双杂交文库质量的方法

    公开(公告)号:CN111394800A

    公开(公告)日:2020-07-10

    申请号:CN202010175583.7

    申请日:2020-03-13

    Abstract: 本发明公开了一种新的评估由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的方法,该方法能够体现文库中插入基因数量、基因丰度等关键性指标,解决了传统的由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量评估方法的片面性,适合一般的实验室进行准确的文库评估。该方法通过文库15轮循环数的PCR扩增、产物回收之后的浓度测定和电泳情况初步判断,之后将回收产物进行高通量测序、de novo组装后详细分析,获得文库的插入基因数量、基因丰度等关键性指标,完成由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的准确评估。同时,还能获得无参考基因组物种基因的序列信息,为下一步互作蛋白编码基因的克隆提供基础。

    一种评估无参物种酵母双杂交文库质量的方法

    公开(公告)号:CN111394800B

    公开(公告)日:2022-04-08

    申请号:CN202010175583.7

    申请日:2020-03-13

    Abstract: 本发明公开了一种新的评估由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的方法,该方法能够体现文库中插入基因数量、基因丰度等关键性指标,解决了传统的由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量评估方法的片面性,适合一般的实验室进行准确的文库评估。该方法通过文库15轮循环数的PCR扩增、产物回收之后的浓度测定和电泳情况初步判断,之后将回收产物进行高通量测序、de novo组装后详细分析,获得文库的插入基因数量、基因丰度等关键性指标,完成由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的准确评估。同时,还能获得无参考基因组物种基因的序列信息,为下一步互作蛋白编码基因的克隆提供基础。

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