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公开(公告)号:CN116121378A
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202211371491.1
申请日:2022-11-03
Applicant: 山东第一医科大学附属肿瘤医院(山东省肿瘤防治研究院、山东省肿瘤医院) , 南京世和基因生物技术股份有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16H50/30 , G16B40/20 , G16B30/00
Abstract: 本发明提供了肺癌脑转移标志物检测方法、检测装置以及计算机可读取介质,属于分子生物医学技术领域。本发明通过对疑似肺癌脑转移患者脑脊液样本进行高通量测序,根据患者临床随访结果,对比脑转移和非脑转移患者脑脊液ctDNA 5’端断点处6mer序列(Motif end 6mer),采用Elastic‑net logistic regression方法对训练集进行建模,并在验证集中进行模型性能评价,建立了肺癌脑转移风险预测模型,适用于肺癌脑转移高风险患者的筛查。
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公开(公告)号:CN114231622B
公开(公告)日:2024-09-10
申请号:CN202110090468.4
申请日:2021-01-22
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 山东第一医科大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及用于局限晚期小细胞肺癌放疗毒副作用的检测方法、试剂盒和预测模型。具体而言,本发明基于二代基因测序(NGS)技术检测局部晚期小细胞肺癌患者的单核苷酸多态性(SNP)和肿瘤体细胞突变结合患者临床信息通过统计学方法和机器学习的方法构建了放射性炎症的预测模型。
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公开(公告)号:CN115966257A
公开(公告)日:2023-04-14
申请号:CN202211397769.2
申请日:2022-11-09
Applicant: 山东第一医科大学附属肿瘤医院(山东省肿瘤防治研究院、山东省肿瘤医院) , 南京世和基因生物技术股份有限公司
Abstract: 本发明涉及用于局晚期直肠癌术后复发风险监测相关的标志物,属于医学分子生物学技术领域。通过对于局晚期直肠癌患者确诊活检组织,手术组织和切缘组织样本进行NGS测序,并在术后定期随访,分析发现了可以预测患者术后复发风险的标志物:KRAS基因,FBXW7基因,切缘组织突变状态以及新辅助治疗前后肿瘤组织样本分子进化模式。其中切缘组织突变状态和新辅助治疗前后肿瘤组织样本分子进化模式是本专利新发现的标志物,两者均能够有效地区分出高复发风险患者,提示临床及时调整治疗方案,从而使得患者能够得到更长期的生存获益。
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公开(公告)号:CN114231622A
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN202110090468.4
申请日:2021-01-22
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 山东第一医科大学附属肿瘤医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及用于局限晚期小细胞肺癌放疗毒副作用的检测方法、试剂盒和预测模型。具体而言,本发明基于二代基因测序(NGS)技术检测局部晚期小细胞肺癌患者的单核苷酸多态性(SNP)和肿瘤体细胞突变结合患者临床信息通过统计学方法和机器学习的方法构建了放射性炎症的预测模型。
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公开(公告)号:CN119395167A
公开(公告)日:2025-02-07
申请号:CN202411376026.6
申请日:2024-09-29
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明涉及一种血浆蛋白质组学前处理方法,涉及蛋白质组学检测领域。本发明的技术方案对血清白蛋白的去除效率达到50%以上,同时对其他蛋白的检出影响较小,性能与去除试剂盒相当甚至更优。
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公开(公告)号:CN119331977A
公开(公告)日:2025-01-21
申请号:CN202411892918.1
申请日:2024-12-20
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及一种用于实体瘤ctDNA高灵敏度检测的检测方法和系统。该方法针对高发的20种实体瘤,涵盖了高频主克隆突变基因、与常见靶向治疗相关的关键基因以及与预后相关的基因。所述探针库和试剂盒设计用于通过高通量测序技术对人样本中的这些基因进行高效、准确的检测,从而获取全面的基因变异信息。本发明的方法能够显著提高实体瘤ctDNA检测的灵敏度和准确性,为肿瘤的早期诊断、疗效监测和预后评估提供了一种强有力的工具。
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公开(公告)号:CN118366547B
公开(公告)日:2024-08-23
申请号:CN202410791117.X
申请日:2024-06-19
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司
Abstract: 本发明涉及一种基因标志物在多癌种早筛中的应用、早筛模型构建方法以及检测装置。本发明对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序,使用高通量测序结果分析各癌种cfDNA片段六种差异特征,包括基因组范围片段长度覆盖分布,染色体各长短臂上片段长度分布,1MB窗口片段拷贝数变化,核小体覆盖模式,片段甲基化模式和突变频谱,利用卷积神经网络进行训练建模,实现在低测序深度下对多个癌肿的高特异性高敏感性的精准早期检测,再利用广义线性模型,梯度提升,随机森林,深度学习,和极端梯度提升五种算法分别进行训练建模,广义线性模型进行二次集合训练构建多特征算法整合,实现对多癌种的组织溯源检测的目的。
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公开(公告)号:CN117904289A
公开(公告)日:2024-04-19
申请号:CN202311673758.7
申请日:2023-12-06
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 广州呼吸健康研究院(广州呼吸疾病研究所)
IPC: C12Q1/6886 , G16B40/20 , G06F18/24 , G06N3/048 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种单碱基突变的肺癌早筛标志物、试剂盒、检测装置和计算机系统,属于肿瘤基因检测技术领域。本发明提供了一种对血检样本cfDNA进行WGS低深度测序,通过对高通量测序结果进行肺癌,非肺癌(肺良性结节和健康人)差异DNA突变特征(Mutation Signature,MS)分析,构建模型,实现肺癌早筛早诊的目的。
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公开(公告)号:CN117737235A
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202211648033.8
申请日:2022-12-21
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种同时检测异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)或者异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)中多亚型基因位点突变的方法及其试剂,所述方法基于ARMS荧光定量PCR方法,在相同的反应体系中,分别使用针对所述IDH1或IDH2基因突变位点的突变型模板的ARMS引物及它们共用的上游或下游引物对待测样本进行检测。本发明的方法操作简便,可在短时间内通过多重检测,检出样本中是含有IDH突变位点。
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公开(公告)号:CN117737234A
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202211638427.5
申请日:2022-12-19
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于二代测序(Next generation sequencing,NGS)领域,具体涉及基于高通量测序技术检测IGH克隆型重排的二代测序探针组及其方法。尤其适用于检测淋系血液肿瘤患者体内优势克隆型及其具体序列信息。
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