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公开(公告)号:CN104293775A
公开(公告)日:2015-01-21
申请号:CN201310298867.5
申请日:2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种筛选抗逆杨树的分子标记、筛选方法、试剂盒及应用。其中,该分子标记为采用MSAP法检测的分子标记,分子标记包括MS1,MS2,MS3,MS4,MS5,MS6,MS7,MS8,MS9,MS10。应用本发明确定的筛选抗逆杨树的分子标记,可以在杨树生长的早期进行筛选出逆境胁迫适应性强、生活力高的植株,极大地缩短林木育种选择周期,对发展杨树速生丰产纸浆林、确保我国林业持续稳定地提供高得率工业纸浆原料具有重要的战略意义。
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公开(公告)号:CN108517367B
公开(公告)日:2021-10-26
申请号:CN201710230163.2
申请日:2017-04-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法,其包括以下步骤:分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA;分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA,进行cDNA文库构建及测序;基于测序结果进行lncRNA预测和注释;基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量,进行组织特异性表达分析,以便确定具有组织特异性的lncRNA;将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测,以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif;以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能,对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。
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公开(公告)号:CN108517368B
公开(公告)日:2021-09-24
申请号:CN201710266801.6
申请日:2017-04-21
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了利用上位性解析毛白杨LncRNA Pto‑CRTG及其靶基因Pto‑CAD5互作关系的方法及系统。利用根据本发明实施例的方法和系统,能够利用上位性解析毛白杨LncRNA及其靶基因的互作关系。在lncRNA Pto‑CRTG和其Cis靶基因Pto‑CAD5中发现的功能性SNP位点为这两个基因在林木分子标记育种中的应用提供了重要的参考价值。
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公开(公告)号:CN108517368A
公开(公告)日:2018-09-11
申请号:CN201710266801.6
申请日:2017-04-21
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了利用上位性解析毛白杨LncRNA Pto-CRTG及其靶基因Pto-CAD5互作关系的方法及系统。利用根据本发明实施例的方法和系统,能够利用上位性解析毛白杨LncRNA及其靶基因的互作关系。在lncRNA Pto-CRTG和其Cis靶基因Pto-CAD5中发现的功能性SNP位点为这两个基因在林木分子标记育种中的应用提供了重要的参考价值。
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公开(公告)号:CN108517367A
公开(公告)日:2018-09-11
申请号:CN201710230163.2
申请日:2017-04-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法,其包括以下步骤:分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA;分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA,进行cDNA文库构建及测序;基于测序结果进行lncRNA预测和注释;基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量,进行组织特异性表达分析,以便确定具有组织特异性的lncRNA;将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测,以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif;以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能,对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。
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公开(公告)号:CN104293775B
公开(公告)日:2016-12-28
申请号:CN201310298867.5
申请日:2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种筛选抗逆杨树的分子标记、筛选方法、试剂盒及应用。其中,该分子标记为采用MSAP法检测的分子标记,分子标记包括MS1,MS2,MS3,MS4,MS5,MS6,MS7,MS8,MS9,MS10。应用本发明确定的筛选抗逆杨树的分子标记,可以在杨树生长的早期进行筛选出逆境胁迫适应性强、生活力高的植株,极大地缩短林木育种选择周期,对发展杨树速生丰产纸浆林、确保我国林业持续稳定地提供高得率工业纸浆原料具有重要的战略意义。
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