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公开(公告)号:CN110111849B
公开(公告)日:2021-03-26
申请号:CN201910379241.4
申请日:2019-05-08
Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学检测技术领域,根据匹配原则查询筛选平台集成的数据库系统中是否有与目标蛋白匹配的蛋白结构,如果有则作为受体模板,如果没有则进行同源构建,通过分子动力学模拟和分子对接筛选得到初选的核酸适配体,最为核酸适配体候选物,具有高效、快捷、准确率高的特点。该筛选方法可与“湿法”实验结合,减少“湿法”实验次数,节省实验成本,提高筛选成功率。通过计算机辅助模拟分析得到适配过程中蛋白质与核酸分子间化学反应机理等信息,并将数据在终端进行展示,并在揭示相应生物材料与核酸分子间可能的相互作用机理方面提供数据支撑,因此具有重要的研究意义和使用价值。
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公开(公告)号:CN110246538B
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN201910514445.4
申请日:2019-06-14
Applicant: 北京市计算中心
IPC: G16B15/00 , G16B20/00 , G16B30/00 , G16B50/30 , C12N15/115
Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析,其次在小分子化合物库中进行筛选,如符合匹配原则,则作为目标小分子靶标,与核酸分子进行分子对接,如不符合匹配原则,则可进行分子结构构建,将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标,与核酸分子进行分子对接,如果对接成功,则核酸分子为初选核酸适配体,解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱,核酸分子抓靶困难、耗材多,小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小,二者的分离难度大的问题。
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公开(公告)号:CN115170371A
公开(公告)日:2022-10-11
申请号:CN202210927355.X
申请日:2022-08-03
Applicant: 北京市计算中心有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于jupyter‑lab开发局域网的人工智能教育培训一体机系统,其特征在于,包括:课程端和管理端,还包括jupyter‑lab管理平台实现模块,基于后端功能实现jupyter‑lab管理平台;用户端通过电脑端的浏览器中访问教育培训一体机系统的IP、端口号、用户端账号密码即可与教育培训一体机系统信号连接、以实现上机操作。能够为用户省去安装软件、搭建环境的繁琐步骤,节约时间成本;能够为用户省去下载数据集和模型的过程,能够保证在教学时,学员的使用的环境、代码、数据都是相同的,提高教学质量,具有重要的研究意义和使用价值。
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公开(公告)号:CN111552522A
公开(公告)日:2020-08-18
申请号:CN202010342049.0
申请日:2020-04-27
Applicant: 北京市计算中心
IPC: G06F9/445
Abstract: 本发明提供了一种从移动存储中启动生物信息分析系统的方法,包括:步骤一:文件配置,步骤二:烧录;步骤三:运行;步骤四,结束。本发明还提供了一种从移动存储中启动生物信息分析系统的装置,包括:物理机模块、移动存储模块和配置模块,物理机模块和移动存储模块可通信连接,配置模块和移动存储模块可通信连接,总之,本发明是一种灵活度更高、操作更简单方便的从移动存储中启动生物信息分析系统的方法、装置及可读存储介质,仅需配置一次即可实现多次使用,能够让用户在有限的时间片段里,尽可能更多、更快、更方便地启动生物信息分析系统,来满足用户的使用需求,具有重要的研究意义和使用价值。
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公开(公告)号:CN110246538A
公开(公告)日:2019-09-17
申请号:CN201910514445.4
申请日:2019-06-14
Applicant: 北京市计算中心
IPC: G16B15/00 , G16B20/00 , G16B30/00 , G16B50/30 , C12N15/115
Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析,其次在小分子化合物库中进行筛选,如符合匹配原则,则作为目标小分子靶标,与核酸分子进行分子对接,如不符合匹配原则,则可进行分子结构构建,将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标,与核酸分子进行分子对接,如果对接成功,则核酸分子为初选核酸适配体,解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱,核酸分子抓靶困难、耗材多,小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小,二者的分离难度大的问题。
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公开(公告)号:CN110111849A
公开(公告)日:2019-08-09
申请号:CN201910379241.4
申请日:2019-05-08
Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学检测技术领域,根据匹配原则查询筛选平台集成的数据库系统中是否有与目标蛋白匹配的蛋白结构,如果有则作为受体模板,如果没有则进行同源构建,通过分子动力学模拟和分子对接筛选得到初选的核酸适配体,最为核酸适配体候选物,具有高效、快捷、准确率高的特点。该筛选方法可与“湿法”实验结合,减少“湿法”实验次数,节省实验成本,提高筛选成功率。通过计算机辅助模拟分析得到适配过程中蛋白质与核酸分子间化学反应机理等信息,并将数据在终端进行展示,并在揭示相应生物材料与核酸分子间可能的相互作用机理方面提供数据支撑,因此具有重要的研究意义和使用价值。
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公开(公告)号:CN217606369U
公开(公告)日:2022-10-18
申请号:CN202222034001.0
申请日:2022-08-03
Applicant: 北京市计算中心有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于jupyter‑lab开发局域网的人工智能教育培训一体机系统,其特征在于,包括:课程端和管理端,还包括jupyter‑lab管理平台实现模块,基于后端功能实现jupyter‑lab管理平台;用户端通过电脑端的浏览器中访问教育培训一体机系统的IP、端口号、用户端账号密码即可与教育培训一体机系统信号连接、以实现上机操作。能够为用户省去安装软件、搭建环境的繁琐步骤,节约时间成本;能够为用户省去下载数据集和模型的过程,能够保证在教学时,学员的使用的环境、代码、数据都是相同的,提高教学质量,具有重要的研究意义和使用价值。
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