公开(公告)号：CN110246538A

公开(公告)日：2019-09-17

申请号：CN201910514445.4

申请日：2019-06-14

Applicant: 北京市计算中心

Inventor： 刘书霞 ,  赵新颖 ,  裴智勇 ,  杨杰 ,  刘满姣 ,  袁寒玉

IPC: G16B15/00 ,  G16B20/00 ,  G16B30/00 ,  G16B50/30 ,  C12N15/115

Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析，其次在小分子化合物库中进行筛选，如符合匹配原则，则作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如不符合匹配原则，则可进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如果对接成功，则核酸分子为初选核酸适配体，解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱，核酸分子抓靶困难、耗材多，小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小，二者的分离难度大的问题。

公开(公告)号：CN110246538B

公开(公告)日：2021-05-07

申请号：CN201910514445.4

申请日：2019-06-14

Applicant: 北京市计算中心

Inventor： 刘书霞 ,  赵新颖 ,  裴智勇 ,  杨杰 ,  刘满姣 ,  袁寒玉

IPC: G16B15/00 ,  G16B20/00 ,  G16B30/00 ,  G16B50/30 ,  C12N15/115

Abstract: 本发明提供了一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，涉及分子生物学技术领域。首先对小分子靶标进行结构分析，其次在小分子化合物库中进行筛选，如符合匹配原则，则作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如不符合匹配原则，则可进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标，与核酸分子进行分子对接，如果对接成功，则核酸分子为初选核酸适配体，解决了小分子靶标与核酸分子的结合位点少、亲和力弱，核酸分子抓靶困难、耗材多，小分子靶标结合核酸形成的复合物与核酸自身的大小、质量、电荷性质等方面差异较小，二者的分离难度大的问题。