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公开(公告)号：CN118421822A
公开(公告)日：2024-08-02
申请号：CN202410527511.2
申请日：2024-04-29
Applicant: 中国水稻研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及水稻育种技术领域，公开了一种高效选育抗病虫水稻新品种的方法，包括：采用Hi‑TOM引物组I对待测水稻群体DNA提取物中的Pi2、Pigm、Xa23和Bph30进行第一轮PCR；采用Hi‑TOM引物组II和Hi‑TOM引物组III对第一轮PCR产物进行第二轮PCR，对第二轮PCR产物进行测序；采用Hi‑TOM工具分析测序结果，确定待测水稻群体中每株水稻内Pi2‑T/G、Pigm‑G/A、Xa23‑G/A和Bph30‑G/A基因的存在情况，筛选出潜在的抗病虫水稻品种。采用本发明的方法，能够较为准确地筛选出潜在的抗病虫水稻品种，大大缩小后续复筛的范围，并有效加快抗病虫水稻的选育。
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公开(公告)号：CN118109622A
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202311846433.4
申请日：2023-12-29
Applicant: 中国水稻研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及水稻育种技术领域，公开了一种快速选育特早熟水稻新品种的方法，包括以下步骤：采用HI‑TOM引物组I对待测水稻群体DNA提取物中的DTH7、DTH8和GHD7进行第一轮PCR；采用HI‑TOM引物组II和HI‑TOM引物组III对第一轮PCR产物进行第二轮PCR，测序；采用Hi‑TOM分析测序结果，确定待测水稻群体中每株水稻内DTH7‑8bp deletion9929、DTH8‑1bp deletion323和GHD7‑G/T157基因的存在情况，筛选出可能的特早熟水稻品种。采用本发明的方法，能够较为准确地筛选出可能的特早熟水稻品种，大大缩小后续复筛的范围，并有效加快特早熟水稻的选育。
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公开(公告)号：CN112967754B
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202110227797.9
申请日：2021-03-01
Applicant: 中国水稻研究所
IPC: G16B20/20 , G16B20/30 , G06F18/23 , G06F18/2431
Abstract: 本发明公开了一种估测生物分化时间的方法。其中，通过个体、群体与外类群的分子标记构建进化树，并且利用外类群作为进化树的根，确定群体内部的聚类以及分布；通过个体群体内部之间的分子标记差异，不同个体群体与外类群之间的分子标记差异的比值，结合个体、群体与外类群的分化时间，确定个体、群体的分化时间。不依赖于特定基因序列，可以利用全基因组按照某种要求得到的片段，计算分化时间；不依赖于位点的杂合状态，对于位点不同状态的核苷酸多态性，计算分化时间；不依赖于核苷酸多态性的继承，可以计算结点的分化时间；既可以计算群体，也可以计算个体的分化时间。
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公开(公告)号：CN110910959B
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN201911068002.3
申请日：2019-11-04
Applicant: 中国水稻研究所
Abstract: 本发明提供了一种群体遗传进化图谱及其构建方法。该构建方法包括选择重组冷点区域；利用重组冷点区域的SNP位点构建系统进化树；对系统进化树进行聚类分析，确定物种之间的演化关系，从而获得群体遗传进化图谱。通过选取重组冷点区域(如着丝粒区域)的SNP位点进行系统进化树的构建，一方面由于重组发生率低，在亲本与子代之间稳定遗传，因而遗传进化关系明确，使得构建的系统进化树更准确，另一方面所选用的序列中SNP位点的数量相比全基因组序列的少，又较单倍型分析法中的SNP位点多和全面。因而，能够实现快速准确地构建系统进化树。
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公开(公告)号：CN113396818B
公开(公告)日：2022-05-27
申请号：CN202110696444.3
申请日：2021-06-23
Applicant: 中国水稻研究所
Abstract: 本发明公开了一种利用多倍体杂种优势的植物育种方法。该方法包括以下步骤：S1，利用技术手段突变MiMe关键基因，筛选基因座位均为杂合的株系，创制出杂合MiMe材料；S2，杂合MiMe材料与其它品系杂交，后代中再分离新的杂合MiMe株系，实现转移MiMe策略目的；S3，杂合MiMe材料自交分离，筛选遗传背景重组的纯合MiMe材料；S4，通过扳分蘖、茎节培养、花药培养等无性繁殖的方式，扩繁具有多倍体杂种优势的纯合MiMe，大量繁种，并通过Fix诱导保存纯合MiMe；以及S5，纯合MiMe材料自交加倍，产生具有杂种优势的多倍体育种材料。应用本发明的技术方案，将多倍体育种与杂种优势结合，解决多倍体杂种优势利用必须依赖于多倍体诱导和每代杂交制种的问题，提供一种简洁高效的多倍体杂种优势的植物育种方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113396818A
公开(公告)日：2021-09-17
申请号：CN202110696444.3
申请日：2021-06-23
Applicant: 中国水稻研究所
Abstract: 本发明公开了一种利用多倍体杂种优势的植物育种方法。该方法包括以下步骤：S1，利用技术手段突变MiMe关键基因，筛选基因座位均为杂合的株系，创制出杂合MiMe材料；S2，杂合MiMe材料与其它品系杂交，后代中再分离新的杂合MiMe株系，实现转移MiMe策略目的；S3，杂合MiMe材料自交分离，筛选遗传背景重组的纯合MiMe材料；S4，通过扳分蘖、茎节培养、花药培养等无性繁殖的方式，扩繁具有多倍体杂种优势的纯合MiMe，大量繁种，并通过Fix诱导保存纯合MiMe；以及S5，纯合MiMe材料自交加倍，产生具有杂种优势的多倍体育种材料。应用本发明的技术方案，将多倍体育种与杂种优势结合，解决多倍体杂种优势利用必须依赖于多倍体诱导和每代杂交制种的问题，提供一种简洁高效的多倍体杂种优势的植物育种方法。
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公开(公告)号：CN112967754A
公开(公告)日：2021-06-15
申请号：CN202110227797.9
申请日：2021-03-01
Applicant: 中国水稻研究所
Abstract: 本发明公开了一种估测生物分化时间的方法。其中，通过个体、群体与外类群的分子标记构建进化树，并且利用外类群作为进化树的根，确定群体内部的聚类以及分布；通过个体群体内部之间的分子标记差异，不同个体群体与外类群之间的分子标记差异的比值，结合个体、群体与外类群的分化时间，确定个体、群体的分化时间。不依赖于特定基因序列，可以利用全基因组按照某种要求得到的片段，计算分化时间；不依赖于位点的杂合状态，对于位点不同状态的核苷酸多态性，计算分化时间；不依赖于核苷酸多态性的继承，可以计算结点的分化时间；既可以计算群体，也可以计算个体的分化时间。
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公开(公告)号：CN108265049B
公开(公告)日：2021-02-02
申请号：CN201711268729.7
申请日：2017-12-05
Applicant: 中国水稻研究所
IPC: C12N15/10 , C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供了一种全基因组互作文库及其构建方法。该构建方法包括：步骤S1，利用引物序列将DNA‑蛋白交联复合物经酶切产生的末端进行连接，形成环状复合物；步骤S2，将环状复合物进行解交联，得到环状DNA；以及步骤S3，将环状DNA进行片段化文库构建，得到全基因组互作文库。该方法用一段外源的已知DNA序列对酶切产物片段末端进行连接，使DNA‑蛋白交联复合物形成环状复合物，然后再经过接交联将环状复合物中的蛋白去除，从而获得环状DNA，利用该环状DNA中所携带的外源已知DNA序列进行片段化文库构建，即可获得用于全基因组互作研究的全基因组互作文库，提供了一种简便的、操作性广的研究全基因组互作的方法。
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公开(公告)号：CN108728479A
公开(公告)日：2018-11-02
申请号：CN201810355193.0
申请日：2018-04-19
Applicant: 中国水稻研究所
Abstract: 本发明公开了一种获得丧失遗传干涉的水稻突变体的方法及其应用。其中，该方法包括以下步骤：采用基因工程手段使ZEP1蛋白的前350个氨基酸不表达或者蛋白活性/功能丧失。应用本发明的技术方案，改造水稻ZEP1基因，改造后的植株雄性不育，雌性可育，改造后的水稻植株可用于杂交育种，由于经过改造的水稻细胞核不育，当其用于育种时，不需要配套的保持系，又因为改造之后的水稻的遗传干涉丧失，也可以用作育种的中间材料，加快染色体片段的交换，提高育种效率。
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公开(公告)号：CN108265049A
公开(公告)日：2018-07-10
申请号：CN201711268729.7
申请日：2017-12-05
Applicant: 中国水稻研究所
IPC: C12N15/10 , C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供了一种全基因组互作文库及其构建方法。该构建方法包括：步骤S1，利用引物序列将DNA-蛋白交联复合物经酶切产生的末端进行连接，形成环状复合物；步骤S2，将环状复合物进行解交联，得到环状DNA；以及步骤S3，将环状DNA进行片段化文库构建，得到全基因组互作文库。该方法用一段外源的已知DNA序列对酶切产物片段末端进行连接，使DNA-蛋白交联复合物形成环状复合物，然后再经过接交联将环状复合物中的蛋白去除，从而获得环状DNA，利用该环状DNA中所携带的外源已知DNA序列进行片段化文库构建，即可获得用于全基因组互作研究的全基因组互作文库，提供了一种简便的、操作性广的研究全基因组互作的方法。
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