公开(公告)号：CN101661536A

公开(公告)日：2010-03-03

申请号：CN200910308485.X

申请日：2009-10-20

Applicant: 东北农业大学

Inventor： 朱延明 ,  李勇 ,  束永俊 ,  柏锡 ,  才华 ,  纪巍 ,  季佐军

IPC: G06F19/00 ,  G06F17/30 ,  C12Q1/68

CPC classification number: Y02A90/24 ,  Y02A90/26

Abstract: 一种基于EST数据库和UniGene数据库的基因挖掘方法，它涉及应用生物信息学领域。它克服了现有的基因挖掘方法中无法正确挖掘与性状相关的诱导基因的问题。本发明的方法利用EST数据库中的EST序列将UniGene数据库中的表达基因UniGene转录组的EST表达量数字化，构建超几何分布检验，并结合FDR方法调整表达基因UniGene转录组的差异表达的超几何分布检验值P-value，筛选异常状态响应基因，最后利用RT-PCR技术验证所述响应基因为与性状相关的诱导基因。本方法可以用于人类疾病发生、动植物生长发育调控、动植物疾病调控过程以及动植物逆境胁迫等性状相关诱导基因的挖掘。