一种黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性检测方法

    公开(公告)号:CN102251038B

    公开(公告)日:2016-08-03

    申请号:CN201110201229.8

    申请日:2011-07-18

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛TMEM18(transmembrane protein 18)基因单核苷酸多态性的方法,其基因多态性包括:在黄牛TMEM18基因第3843位为A或G的碱基多态性;在黄牛TMEM18基因第3873位为G或A的碱基多态性。上述黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性为:以包含TMEM18基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F和2F为引物,PCR扩增黄牛TMEM18基因;分别用限制性内切酶XspI和MluI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛TMEM18基因第3843位和第3873位的单核苷酸多态性;该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,以便于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种黄牛IGF2基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN103290123B

    公开(公告)日:2014-09-10

    申请号:CN201310204434.9

    申请日:2013-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF2基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒,以包含IGF2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛IGF2基因;通过DNA测序和限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(PCR-RFLP)进行基因多态性的检测与快速分型,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记。本发明提供的检测方法可用于黄牛生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明检测方法简单、成本低,检测结果直接、可靠,适用于对黄牛IGF2基因突变位点的大规模的筛查和诊断。

    一种验证CIDEC基因5端调控区单核苷酸多态性位点遗传效应的方法与应用

    公开(公告)号:CN103243156A

    公开(公告)日:2013-08-14

    申请号:CN201310003907.9

    申请日:2013-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法,以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型;用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后,再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上,构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体,将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中,使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性,以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    奶山羊MFG-E8基因的单核苷酸多态性及其检测方法

    公开(公告)号:CN101705288B

    公开(公告)日:2011-12-28

    申请号:CN200910219002.9

    申请日:2009-11-17

    Abstract: 本发明公开了一种奶山羊MFG-E8基因单核苷酸的多态性及其检测方法,以包含MFG-E8基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P(包括P1,R1,newP)为引物,PCR扩增奶山羊MFG-E8基因;用限制性内切酶EcoRV消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定奶山羊MFG-E8基因第12892nt的单核苷酸多态性;由于MFG-E8基因功能涉及乳腺发育,乳脂和总固形物等奶成分,本发明提供的检测方法为MFG-E8基因的SNP与奶成分关系的建立奠定了基础,以便用于中国奶山羊奶用性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。

    一种检测黄牛Six6基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN101629209B

    公开(公告)日:2011-12-28

    申请号:CN200910023595.1

    申请日:2009-08-14

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Six6基因单核苷酸多态性的方法,以包含Six6基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛Six6基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛Six6基因第2015位的单核苷酸多态性;由于Six6基因功能涉及日增重、体高、体重、体斜长、坐骨端宽等生长性状,本发明提供的检测方法为Six6基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种利用蜕皮检测大鲵群虹彩病毒带毒情况的试剂盒和方法

    公开(公告)号:CN102031307A

    公开(公告)日:2011-04-27

    申请号:CN201010550620.4

    申请日:2010-11-19

    Abstract: 本发明公开了一种利用蜕皮检测大鲵群虹彩病毒带毒情况的试剂盒和检测的方法。试剂盒包括A液,蜕皮样本裂解液,1管,含有PBS;1%triton-100;B液,1管,200μg/ml蛋白酶K;C液,1管,模板抽提液,1管,含有酚/氯仿/异戊醇,比例为25∶24∶1;D液,1管,3mol/l乙酸钠等;本发明利用大鲵的新鲜蜕皮作为检测病料样品,解决了必须杀死大鲵个体才能获取检测样品的不足;根据大鲵蜕皮的特点我们优化了从蜕皮中提取病毒基因组DNA的方法,设计了简单而有效地提取大鲵蜕皮样品中的虹彩病毒基因的试剂盒,以及针对虹彩病毒2个保守基因的2对PCR引物和聚合酶链式反应条件;设立了阳性和阴性对照品。利用本发明的试剂盒并进行标准步骤的检测,更加可靠地掌握大鲵群虹彩病毒带毒情况,有利于在实际生产中应用。

    奶山羊MFG-E8基因的单核苷酸多态性及其检测方法

    公开(公告)号:CN101705288A

    公开(公告)日:2010-05-12

    申请号:CN200910219002.9

    申请日:2009-11-17

    Abstract: 本发明公开了一种奶山羊MFG-E8基因单核苷酸的多态性及其检测方法,以包含MFG-E8基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P(包括P1,R1,newP)为引物,PCR扩增奶山羊MFG-E8基因;用限制性内切酶EcoRV消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定奶山羊MFG-E8基因第12892nt的单核苷酸多态性;由于MFG-E8基因功能涉及乳腺发育,乳脂和总固形物等奶成分,本发明提供的检测方法为MFG-E8基因的SNP与奶成分关系的建立奠定了基础,以便用于中国奶山羊奶用性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。

    一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN110079610B

    公开(公告)日:2022-08-19

    申请号:CN201910379625.6

    申请日:2019-05-08

    Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊血样全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状,本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,从而快速建立优良的茶卡羊种群,该方法具有简单、快速,便于推广应用的特点。

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