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公开(公告)号:CN107988385A
公开(公告)日:2018-05-04
申请号:CN201711262485.1
申请日:2017-12-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛PLAG1基因Indel标记的方法及其专用试剂盒:基于PCR技术,以肉牛(郏县红牛)的血液基因组DNA池为模板,利用特异引物对P1扩增牛PLAG1基因的Indel位点,然后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果将不同个体分为缺失型、正常型以及杂合型,本发明提供的方法建立在肉牛PLAG1基因Indel位点与生长性状之间的关联性基础上,方法不仅简单,快速,便于推广应用,而且有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作。
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公开(公告)号:CN102251038B
公开(公告)日:2016-08-03
申请号:CN201110201229.8
申请日:2011-07-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛TMEM18(transmembrane protein 18)基因单核苷酸多态性的方法,其基因多态性包括:在黄牛TMEM18基因第3843位为A或G的碱基多态性;在黄牛TMEM18基因第3873位为G或A的碱基多态性。上述黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性为:以包含TMEM18基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F和2F为引物,PCR扩增黄牛TMEM18基因;分别用限制性内切酶XspI和MluI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛TMEM18基因第3843位和第3873位的单核苷酸多态性;该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,以便于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN103290123B
公开(公告)日:2014-09-10
申请号:CN201310204434.9
申请日:2013-05-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF2基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒,以包含IGF2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛IGF2基因;通过DNA测序和限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(PCR-RFLP)进行基因多态性的检测与快速分型,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记。本发明提供的检测方法可用于黄牛生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明检测方法简单、成本低,检测结果直接、可靠,适用于对黄牛IGF2基因突变位点的大规模的筛查和诊断。
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公开(公告)号:CN103243156A
公开(公告)日:2013-08-14
申请号:CN201310003907.9
申请日:2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种验证黄牛CIDEC基因SNPs位点遗传效应的方法,以包含CIDEC基因的黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因不同单倍型;用限制性内切酶KpnI和XhoI分别消化PCR扩增产物和pGL3-Basic空载体后,再使用DNA连接酶将不同单倍型连接到pGL3-Basic载体上,构建pGL3-Basic-CIDEC-H1、H2、H3、H4、H8、H9表达载体,将构建成功的表达载体转染至3T3-L1细胞中,使用双荧光报告系统试剂盒检测不同单倍型的转录活性。综合不同单倍型的转录活性,以及SNP位点改变顺式作用元件的信息来验证关联分析结果。本发明提供的检测方法为验证CIDEC基因的单核苷酸多态性遗传效应奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN101705288B
公开(公告)日:2011-12-28
申请号:CN200910219002.9
申请日:2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊MFG-E8基因单核苷酸的多态性及其检测方法,以包含MFG-E8基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P(包括P1,R1,newP)为引物,PCR扩增奶山羊MFG-E8基因;用限制性内切酶EcoRV消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定奶山羊MFG-E8基因第12892nt的单核苷酸多态性;由于MFG-E8基因功能涉及乳腺发育,乳脂和总固形物等奶成分,本发明提供的检测方法为MFG-E8基因的SNP与奶成分关系的建立奠定了基础,以便用于中国奶山羊奶用性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。
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公开(公告)号:CN101629209B
公开(公告)日:2011-12-28
申请号:CN200910023595.1
申请日:2009-08-14
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68 , G01N27/447
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛Six6基因单核苷酸多态性的方法,以包含Six6基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛Six6基因;用限制性内切酶HhaI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛Six6基因第2015位的单核苷酸多态性;由于Six6基因功能涉及日增重、体高、体重、体斜长、坐骨端宽等生长性状,本发明提供的检测方法为Six6基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN102031307A
公开(公告)日:2011-04-27
申请号:CN201010550620.4
申请日:2010-11-19
Applicant: 西北农林科技大学 , 汉中天成生物工程有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种利用蜕皮检测大鲵群虹彩病毒带毒情况的试剂盒和检测的方法。试剂盒包括A液,蜕皮样本裂解液,1管,含有PBS;1%triton-100;B液,1管,200μg/ml蛋白酶K;C液,1管,模板抽提液,1管,含有酚/氯仿/异戊醇,比例为25∶24∶1;D液,1管,3mol/l乙酸钠等;本发明利用大鲵的新鲜蜕皮作为检测病料样品,解决了必须杀死大鲵个体才能获取检测样品的不足;根据大鲵蜕皮的特点我们优化了从蜕皮中提取病毒基因组DNA的方法,设计了简单而有效地提取大鲵蜕皮样品中的虹彩病毒基因的试剂盒,以及针对虹彩病毒2个保守基因的2对PCR引物和聚合酶链式反应条件;设立了阳性和阴性对照品。利用本发明的试剂盒并进行标准步骤的检测,更加可靠地掌握大鲵群虹彩病毒带毒情况,有利于在实际生产中应用。
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公开(公告)号:CN101705288A
公开(公告)日:2010-05-12
申请号:CN200910219002.9
申请日:2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊MFG-E8基因单核苷酸的多态性及其检测方法,以包含MFG-E8基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P(包括P1,R1,newP)为引物,PCR扩增奶山羊MFG-E8基因;用限制性内切酶EcoRV消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定奶山羊MFG-E8基因第12892nt的单核苷酸多态性;由于MFG-E8基因功能涉及乳腺发育,乳脂和总固形物等奶成分,本发明提供的检测方法为MFG-E8基因的SNP与奶成分关系的建立奠定了基础,以便用于中国奶山羊奶用性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。
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公开(公告)号:CN112831576B
公开(公告)日:2023-07-07
申请号:CN202110343708.7
申请日:2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 刘贤 , 柴亚楠 , 李克丽 , 牛梦晓 , 乔小玉 , 郑中华 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛DYNC1I2基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及专用试剂盒,以牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术,用两对引物P1、P2分别对牛DYNC1I2基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增,根据2*2‑ΔΔCt确定个体DYNC1I2基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据DYNC1I2基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果,本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于牛生长性状的标记辅助选择,加速良种选育进程。
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公开(公告)号:CN110079610B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910379625.6
申请日:2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊血样全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参,利用2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数,通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状,本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记,可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择,从而快速建立优良的茶卡羊种群,该方法具有简单、快速,便于推广应用的特点。
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