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公开(公告)号:CN110066885A
公开(公告)日:2019-07-30
申请号:CN201910361142.3
申请日:2019-04-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种基于重组酶介导等温扩增-侧流层析技术(RPA-LFD)检测栗黑水疫霉(Phytophthora cambivora)的引物及探针组合及其应用。采用所述引物及探针组合检测栗黑水疫霉(P.cambivora)的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测。本发明所使用的引物及探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在质控区有阳性对照,增加了检测的灵敏性,为栗黑水疫霉(P.cambivora)的检测提供了新的技术平台,同时适用于栗黑水疫霉病菌寄主苗木、插枝等植物材料及其土壤和介质中的栗黑水疫霉(P.cambivora)进行检测。
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公开(公告)号:CN109988864A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910410222.3
申请日:2019-05-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA‑LFD技术检测雪松疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测雪松疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有雪松疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有雪松疫霉。本发明所提供的引物及探针组合RPA扩增效果好,条带特异性强、灵敏度高,为雪松疫霉的检测提供了新的技术手段。
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公开(公告)号:CN109988860A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910194831.X
申请日:2019-03-14
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测冬生疫霉的引物及探针组合物及其试剂盒和检测方法,该引物和探针序列为:RPA‑PSYPT‑F:5'‑TTCCACCCTTCCACCAGACTGCTGAGGAGG‑3',RPA‑PSYPT‑R:5’‑[Biotin]TGTTAGCTGCGTGTTCGTTGGTCACCCCAGA‑3’,SYPT‑P:5’‑[FAM]CTTCTGTGATTTATCCAGAAAATCCGTACGAT‑THE‑GAGCTGGACGGCAAGA[C3‑spacer]‑3’。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性。
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公开(公告)号:CN104372104A
公开(公告)日:2015-02-25
申请号:CN201410742299.8
申请日:2014-12-08
Applicant: 南京林业大学
CPC classification number: C12Q1/6844 , C12Q1/6895 , C12Q2531/119
Abstract: 本发明公开了一种樟疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3、正向环引物LF和反向环引物LB组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时还为樟疫霉菌的检测提供了新的技术平台,可用于樟疫霉菌的高灵敏度快速检测,同时在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对田间土壤中的樟疫霉菌进行检测。本发明对樟疫霉菌引起的疫病防治和对减少农药盲目使用,降低生产成本,减少农药的环境污染也具有重要意义。
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公开(公告)号:CN104313176A
公开(公告)日:2015-01-28
申请号:CN201410643035.7
申请日:2014-11-13
Applicant: 南京林业大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q2531/119
Abstract: 本发明公开了一种棕榈疫霉菌的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法。该LAMP检测引物组合物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3、正向环引物LF和反向环引物LB组成;各引物序列具体如下:FIP:5′-CTCACTTCAACAGCCCCGCC-GAAGTGTGCTGCGTCGTG-3′;BIP:5′-TCGGCTAAAGTGACGGCTTTGA-CAACCTGCAACCACCGAA-3′;F3:5′-GCGGAAGGGACTACACCT-3′;B3:5′-AACAACAACACCGAGGCC-3′;LF:5′-ACAGAGCAAGAAGCGAATTAGAG-3′;LB:5′-GCTGCGAGTGGTTTGTGACT-3′。
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公开(公告)号:CN116463338A
公开(公告)日:2023-07-21
申请号:CN202310252981.8
申请日:2023-03-16
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6895 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种栗疫霉黑水病菌(Phytophthora cambivora)的特异性检测新靶标g2339其检测引物、检测试剂盒和检测方法,该检测靶标g2339的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,CDS序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,还公开了特异性检测靶标g2339的引物组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ IDNO:4所示。本发明发现g2339适合栗疫霉黑水病菌(Phytophthora cambivora)的检测靶标。对于港口的进境植物上携带的P.cambivora实现即检即防,对保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN116120412A
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202310162180.2
申请日:2023-02-24
Applicant: 南京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种来源于樟疫霉的效应子蛋白SCR83830及其编码基因和应用。效应子蛋白SCR83830的氨基酸序列为SEQ ID No.1,编码该氨基酸的核苷酸序列为SEQ ID No.2。该基因控制表达的蛋白质能够参与疫霉侵染本氏烟草的过程,诱导死亡前体蛋白Bax诱导的植物细胞死亡。利用其诱导植物细胞死亡的功能可使植物细胞在致死因素存在时失去生理活性,可在农林复合经营体中降低有害植物的数量,为经营提供有利的理论基础和实际的经济效益,也为更加全面的了解樟疫霉的基因功能提供了实践应用价值。
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公开(公告)号:CN115746113B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202210818238.X
申请日:2022-07-13
Applicant: 南京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种来源于樟疫霉的效应子蛋白SCR85664及其编码基因和应用。效应子蛋白SCR85664的氨基酸序列为SEQIDNo.1,编码改氨基酸的核苷酸序列为SEQIDNo.2,实验证明,该基因控制表达的蛋白质能够参与疫霉侵染本氏烟草的过程,抑制凋亡前体蛋白Bax诱导的植物植物细胞死亡。本发明有助于充实植物病原卵菌与寄主互作的分子机制,同时也有助于建立植物樟疫霉的综合防治技术策略。
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公开(公告)号:CN116083449A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310283320.1
申请日:2023-03-22
Abstract: 本发明公开了一种旋柄腐霉(Phytopythiumhelicoides)的检测新靶标Phe_g13067及其检测引物,该检测靶标Phe_g13067的DNA序列如SEQ IDNO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,还公开了特异性检测靶标Phe_g13067的PCR检测技术的特异性引物组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示。同时,本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR,其特异性强,灵敏度高,证明Phe_g13067适合旋柄腐霉(Phytopythiumhelicoides)的检测靶标。本发明发掘的新靶标和基于该靶标建立的检测方法对于港口的进境植物上携带的Pp.helicoides实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN116042655A
公开(公告)日:2023-05-02
申请号:CN202310210966.7
申请日:2023-03-07
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种栎树猝死病菌(Phytophthora ramorum)的特异性检测靶标Pr52094,同时建立了该靶标基于RPA‑LFD的快速检测方法。该检测靶标Pr52094的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。特异性检测靶标Pr52094的引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了栎树猝死病菌新检测靶标,且基于该靶标设计了引物及探针组合用于RPA‑LFD快速检测方法。该方法具有实现等温扩增、耗时短、特异性强、灵敏度高、操作方便、实用性好等优点,为栎树猝死病菌(P.ramorum)的检实际样品检测提供了新的技术平台。
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