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公开(公告)号:CN116042655B
公开(公告)日:2023-09-08
申请号:CN202310210966.7
申请日:2023-03-07
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种栎树猝死病菌(Phytophthora ramorum)的特异性检测靶标Pr52094,同时建立了该靶标基于RPA‑LFD的快速检测方法。该检测靶标Pr52094的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。特异性检测靶标Pr52094的引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了栎树猝死病菌新检测靶标,且基于该靶标设计了引物及探针组合用于RPA‑LFD快速检测方法。该方法具有实现等温扩增、耗时短、特异性强、灵敏度高、操作方便、实用性好等优点,为栎树猝死病菌(P.ramorum)的检实际样品检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN111118038A
公开(公告)日:2020-05-08
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA-LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN111004859A
公开(公告)日:2020-04-14
申请号:CN201911393216.8
申请日:2019-12-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测靶标Phibe_s00001g00026.1及其检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00001g00026.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,CDS序列如SEQ ID NO:2所示,蛋白序列如SEQ ID NO:3所示。检测引物由其正向引物序列如SEQ ID NO:4所示,反向引物序列如SEQ ID NO:5所示组成。本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR特异性强,灵敏度高,证明Phibe_s00001g00026.1适合作为冬生疫霉的检测靶标,本发明建立的靶标和检测方法对于中国港口的进境水果、种苗上携带的冬生疫霉,实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN109825628B
公开(公告)日:2019-10-18
申请号:CN201910241240.3
申请日:2019-03-28
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于RPA‑侧流层析技术检测茄腐镰孢菌的引物及探针组合及其应用。所述应用具体为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有茄腐镰孢菌;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有茄腐镰孢菌。本发明所使用的引物及探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在质控区有阳性对照,增加了检测的灵敏性,为茄腐镰孢菌的检测提供了新的技术平台,同时在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对苗圃地或者发病植株中的茄腐镰孢菌进行检测。
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公开(公告)号:CN109988860A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910194831.X
申请日:2019-03-14
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测冬生疫霉的引物及探针组合物及其试剂盒和检测方法,该引物和探针序列为:RPA‑PSYPT‑F:5'‑TTCCACCCTTCCACCAGACTGCTGAGGAGG‑3',RPA‑PSYPT‑R:5’‑[Biotin]TGTTAGCTGCGTGTTCGTTGGTCACCCCAGA‑3’,SYPT‑P:5’‑[FAM]CTTCTGTGATTTATCCAGAAAATCCGTACGAT‑THE‑GAGCTGGACGGCAAGA[C3‑spacer]‑3’。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性。
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公开(公告)号:CN116042655A
公开(公告)日:2023-05-02
申请号:CN202310210966.7
申请日:2023-03-07
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种栎树猝死病菌(Phytophthora ramorum)的特异性检测靶标Pr52094,同时建立了该靶标基于RPA‑LFD的快速检测方法。该检测靶标Pr52094的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。特异性检测靶标Pr52094的引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了栎树猝死病菌新检测靶标,且基于该靶标设计了引物及探针组合用于RPA‑LFD快速检测方法。该方法具有实现等温扩增、耗时短、特异性强、灵敏度高、操作方便、实用性好等优点,为栎树猝死病菌(P.ramorum)的检实际样品检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN111118038B
公开(公告)日:2020-10-30
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA‑LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN109988860B
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN201910194831.X
申请日:2019-03-14
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测冬生疫霉的引物及探针组合物及其试剂盒和检测方法,该引物和探针序列为:RPA‑PSYPT‑F:5'‑TTCCACCCTTCCACCAGACTGCTGAGGAGG‑3',RPA‑PSYPT‑R:5’‑[Biotin]TGTTAGCTGCGTGTTCGTTGGTCACCCCAGA‑3’,SYPT‑P:5’‑[FAM]CTTCTGTGATTTATCCAGAAAATCCGTACGAT‑THE‑GAGCTGGACGGCAAGA[C3‑spacer]‑3’。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性。
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公开(公告)号:CN111004859B
公开(公告)日:2020-10-02
申请号:CN201911393216.8
申请日:2019-12-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测靶标Phibe_s00001g00026.1及其检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00001g00026.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,CDS序列如SEQ ID NO:2所示,蛋白序列如SEQ ID NO:3所示。检测引物由其正向引物序列如SEQ ID NO:4所示,反向引物序列如SEQ ID NO:5所示组成。本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR特异性强,灵敏度高,证明Phibe_s00001g00026.1适合作为冬生疫霉的检测靶标,本发明建立的靶标和检测方法对于中国港口的进境水果、种苗上携带的冬生疫霉,实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN109988823A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910404137.6
申请日:2019-05-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种重组酶介导等温扩增‑侧流层析技术检测橡树疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测橡树疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有橡树疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有橡树疫霉。本发明所使用的引物及探针组合用于RPA‑LFD特异性强,灵敏度高,为橡树疫霉的检测提供了新的技术平台。
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