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公开(公告)号:CN111004859B
公开(公告)日:2020-10-02
申请号:CN201911393216.8
申请日:2019-12-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测靶标Phibe_s00001g00026.1及其检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00001g00026.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,CDS序列如SEQ ID NO:2所示,蛋白序列如SEQ ID NO:3所示。检测引物由其正向引物序列如SEQ ID NO:4所示,反向引物序列如SEQ ID NO:5所示组成。本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR特异性强,灵敏度高,证明Phibe_s00001g00026.1适合作为冬生疫霉的检测靶标,本发明建立的靶标和检测方法对于中国港口的进境水果、种苗上携带的冬生疫霉,实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN110699482A
公开(公告)日:2020-01-17
申请号:CN201911176376.7
申请日:2019-11-26
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种橡树疫霉(P.ramorum)的特异性检测靶标Pr40993及其应用,该检测靶标Pr40993的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Pr40993的引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA-LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为橡树疫霉(P.ramorum)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN111118038B
公开(公告)日:2020-10-30
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA‑LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN110093446A
公开(公告)日:2019-08-06
申请号:CN201910467152.5
申请日:2019-05-31
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA-LFD技术检测樟疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测樟疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有樟疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有樟疫霉。本发明所提供的引物及探针组合RPA扩增效果好,条带特异性强、灵敏度高,为樟疫霉的检测提供了新的技术手段。
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公开(公告)号:CN110093446B
公开(公告)日:2022-09-30
申请号:CN201910467152.5
申请日:2019-05-31
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA‑LFD技术检测樟疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测樟疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有樟疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有樟疫霉。本发明所提供的引物及探针组合RPA扩增效果好,条带特异性强、灵敏度高,为樟疫霉的检测提供了新的技术手段。
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公开(公告)号:CN111118038A
公开(公告)日:2020-05-08
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA-LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN111004859A
公开(公告)日:2020-04-14
申请号:CN201911393216.8
申请日:2019-12-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测靶标Phibe_s00001g00026.1及其检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00001g00026.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,CDS序列如SEQ ID NO:2所示,蛋白序列如SEQ ID NO:3所示。检测引物由其正向引物序列如SEQ ID NO:4所示,反向引物序列如SEQ ID NO:5所示组成。本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR特异性强,灵敏度高,证明Phibe_s00001g00026.1适合作为冬生疫霉的检测靶标,本发明建立的靶标和检测方法对于中国港口的进境水果、种苗上携带的冬生疫霉,实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN110066885A
公开(公告)日:2019-07-30
申请号:CN201910361142.3
申请日:2019-04-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种基于重组酶介导等温扩增-侧流层析技术(RPA-LFD)检测栗黑水疫霉(Phytophthora cambivora)的引物及探针组合及其应用。采用所述引物及探针组合检测栗黑水疫霉(P.cambivora)的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测。本发明所使用的引物及探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在质控区有阳性对照,增加了检测的灵敏性,为栗黑水疫霉(P.cambivora)的检测提供了新的技术平台,同时适用于栗黑水疫霉病菌寄主苗木、插枝等植物材料及其土壤和介质中的栗黑水疫霉(P.cambivora)进行检测。
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