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公开(公告)号：CN118441089A
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202410666316.8
申请日：2024-05-27
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种Pto‑RAD50基因单倍型在评价植物光合效率中的应用，属于植物分子育种技术领域。本发明所述Pto‑RAD50基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；所述Pto‑RAD50基因单倍型根据SNP1、SNP2和InDel的核苷酸确定，所述SNP1为SEQ ID NO：1的第172位的核苷酸，所述核苷酸为C或A；所述SNP2为SEQ ID NO：1的第442位的核苷酸，所述核苷酸为A或G；所述InDel为SEQ ID NO：1的第422位后的核苷酸为ATTATTTTAATA或缺失ATTATTTTAATA。通过测定上述三个位点的基因型组合能够准确地判断杨树的光合效率，在杨树生长早期准确、高效筛选高光合效率的优株，有效缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN117095748B
公开(公告)日：2024-04-23
申请号：CN202311097229.7
申请日：2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种构建植物miRNA遗传调控通路的方法，涉及分子遗传学领域。本发明了一种构建植物miRNA遗传调控通路的方法，可准确、快速、高效地鉴定miRNA上游调控转录因子与下游调控靶基因，是对先前仅开展miRNA下游靶基因研究的有效补充，对解析植物复杂性状的遗传调控通路提供了重要的技术参考。采用本发明提供的方法，得出毛白杨miR393a的上游转录因子与下游靶基因，构建了miR393a影响木材组织相关性状的遗传调控通路。
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公开(公告)号：CN117095748A
公开(公告)日：2023-11-21
申请号：CN202311097229.7
申请日：2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种构建植物miRNA遗传调控通路的方法，涉及分子遗传学领域。本发明了一种构建植物miRNA遗传调控通路的方法，可准确、快速、高效地鉴定miRNA上游调控转录因子与下游调控靶基因，是对先前仅开展miRNA下游靶基因研究的有效补充，对解析植物复杂性状的遗传调控通路提供了重要的技术参考。采用本发明提供的方法，得出毛白杨miR393a的上游转录因子与下游靶基因，构建了miR393a影响木材组织相关性状的遗传调控通路。
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公开(公告)号：CN112048464B
公开(公告)日：2022-07-01
申请号：CN202010993617.3
申请日：2020-09-21
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种用于制备毛白杨叶片和/或根组织原生质体的组合物及其试剂和方法，属于植物原生质体制备技术领域。本发明提供的用于制备毛白杨叶片和/或根组织原生质体的组合物，包括纤维素酶和浸解酶，所述纤维素酶的酶活为250～350U/g，所述浸解酶的酶活为700～900U/g，所述纤维素酶和浸解酶的质量比为(14.5～15.5):(3.5～4.5)。本发明通过纤维素酶和浸解酶组合使用对毛白杨叶片和/或根组织进行酶解，既保持了原生质体的高活性，且获得的原生质体的数量多，酶的价格又相对廉价，降低了成本，可以满足后续试验研究的要求。
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公开(公告)号：CN113234848B
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202110578666.5
申请日：2021-05-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与杨树气孔形态、光合效率相关的分子标记，所述分子标记为SNP标记，其位于杨树基因组ZCWCC3基因下游第3140位碱基处，具有C/T多态性，其中，分子标记的基因型为CC的杨树个体，具有较大的气孔宽度、气孔长宽比及较高的光合效率；分子标记的基因型为TT的杨树个体，具有较小的气孔宽度、气孔长宽比及较低的光合效率。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，且具有环境适应性，适用于区域育种和气候适应育种。本发明还提供了用于扩增所述分子标记的引物对、分子标记的应用、杨树遗传改良方法和预测杨树气孔形态、光合效率的系统，为杨树的分子标记辅助选择育种提供了重要基础。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114427116A
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202111635093.1
申请日：2021-12-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B20/30
Abstract: 本发明提供了一种在全基因组水平上预测植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方法，属于生物信息技术领域。本发明的方法基于植物转录因子的DAP‑seq测序数据，在全基因组中检测调控的启动子的Motif元件和位置，并以此为基础，预测转录因子下游调控的靶基因。本发明联合测序数据和生物信息学工具，大大增加了预测的精确度和通量，进而可在大数据量的基础上快速预测出靶基因，提高预测效率。并且本发明的方法普遍适用于植物学领域。
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公开(公告)号：CN114317801A
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202111635137.0
申请日：2021-12-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及植物分子育种技术领域，特别是涉及SNP位点的基因型组合在评价毛白杨树干皮孔表型中的应用、引物组、试剂盒及其应用。本发明通过确定两个SNP位点的基因型组合能够准确地评价杨树树干皮孔特征，在杨树生长的早期高效、准确地筛选树皮光滑美观的毛白杨新品种，缩短园林绿化毛白杨选育周期。
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公开(公告)号：CN109371166B
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN201811582470.8
申请日：2018-12-24
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种高通量检测植物circRNA等位位点差异表达的方法，属于基因表达检测技术领域，所述方法包括以下步骤：1)提取植物样品总RNA，构建链特异性文库；2)用Illumina HiSeq对所述链特异性文库进行双端测序；3)从原始测序数据中筛选circRNAs数据；4)提取circRNAs数据中circRNAs成环处的反向剪接reads；5)对所述反向剪接reads进行单核苷酸变异检测；6)统计所述反向剪接reads中比对到所述SNP位点的不同基因型的reads数，以比对到不同基因型的reads数的比例为不同基因型的表达量比例。所述方法可以高通量、准确检测circRNA等位位点的差异表达。
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公开(公告)号：CN108467898B
公开(公告)日：2021-07-27
申请号：CN201710099761.0
申请日：2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto‑MIR475b基因的第1929位、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位以及Pto‑EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto‑MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位基因型为GG和Pto‑EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN111781343A
公开(公告)日：2020-10-16
申请号：CN202010690993.5
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/53 , C12Q1/6827
Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。
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