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公开(公告)号:CN110957007A
公开(公告)日:2020-04-03
申请号:CN201911173160.5
申请日:2019-11-26
Applicant: 上海交通大学
IPC: G16B20/30 , G16B30/00 , C12Q1/6886 , G01N33/574 , G01N33/68
Abstract: 本发明提供了一种基于组织外泌体磷酸化蛋白组的多组学分析方法,包括以下步骤:S1、对组织样本的外泌体进行分离和磷酸化蛋白的特异性富集;S2、对富集后的磷酸化蛋白进行测序分析,获得主调控激酶;S3、对组织样本的转录组数据进行分析,获得主调控转录因子;S4、对组织样本的基因组变异数据进行分析,获得肿瘤相关基因;S5、将步骤S2、S3、S4获得的分析数据进行策略分析,获得癌症相关的主调控激酶网络和药物作用靶点。本发明适用于任何疾病外泌体样本磷酸化蛋白组测序数据和转录组数据、基因突变数据的联合分析技术,将为探索与疾病相关的标志物以及选择更加有效、准确的疾病治疗靶位奠定基础。
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公开(公告)号:CN104713933B
公开(公告)日:2017-07-11
申请号:CN201510140100.9
申请日:2015-03-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/447 , G01N27/42
Abstract: 本发明公开了一种定量测定乳品掺次程度的电泳滴定方法;分别以未掺次的纯乳品和掺入的蛋白质为标准品,进行MRBET滴定,获得纯乳品的标准曲线斜率a1、蛋白质的标准曲线斜率a2以及截距b;再对掺次乳品进行MRBET滴定,获得阻滞信号Rmix;测得掺次乳品的总蛋白浓度Cmix,单位为mg/mL;根据获得掺次乳品中掺入蛋白质和纯乳品的浓度比值,其中,Cpro,1为掺次乳品中纯乳品的蛋白质浓度,Cpro,2为掺次乳品中掺入的蛋白质的浓度。本发明的方法能够有效地检测各类掺次乳品的掺次程度、掺次比例;且检测速度快,测定样品的掺次比例只需半小时。
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公开(公告)号:CN106248668A
公开(公告)日:2016-12-21
申请号:CN201610847979.5
申请日:2016-09-23
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/79
Abstract: 一种基于移动反应界面电泳滴定的定量酶联免疫吸附检测方法,通过在相同条件下分别对抗原浓度不同且已知的标准样品进行ELISA‐MRB‐ET,从而建立移动反应界面的移动距离与抗原浓度的数学模型,并沿电泳通道标注抗原浓度标尺;在测试阶段通过对待测样品在相同条件下进行ELISA‐MRB‐ET,测得的移动反应界面的停留位置所应的浓度刻度即为样品中的抗原浓度;本发明设计合理,不需昂贵仪器即可定量检测,降低成本,并可实现高通量检测。
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公开(公告)号:CN108445069B
公开(公告)日:2024-01-30
申请号:CN201810554632.0
申请日:2018-06-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/447
Abstract: 一种带有微阵列固定化pH梯度柱的等电聚焦电泳芯片及方法,包括:由上而下依次设置的微阵列支架、微电泳槽、电极以及微阵列透光窗口,其中:微阵列支架的底部设有阵列排布的若干个微阵列微柱对,每个微阵列微柱对的末端设有微型pH梯度柱。微型pH梯度柱包括:位于微阵列支架底部的微型pH梯度胶和微型支持膜,pH梯度胶朝下便于微阵列pH梯度柱样本进样,微型pH梯度柱通过微阵列支架和自身重力与电极充分接触以组成电泳回路。有效避免了传统IPG聚焦电泳复杂的操作,提高了IEF分离分析上样速度,加速了聚焦速度,尤其是能够直接在线检测。同时,与毛细管/芯片聚焦电泳技术相比,本发明的pH梯度柱具有稳定性好、通量高、聚焦蛋白条带可显微切割回收等特殊优点。
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公开(公告)号:CN113063834B
公开(公告)日:2021-12-28
申请号:CN202110296012.3
申请日:2021-03-19
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/447
Abstract: 一种基于移动交换界面的可视化检测物质浓度的方法,主要包括:1)不同配体在固相物质表面(如纳米颗粒、细胞等)发生置换反应形成光学信号;2)预先将固相物质用凝胶(或自填充等方式)固定在电泳通道内,通过电泳的方式驱动待测物在通道内移动并置换固相物质表面的配体形成移动交换界面;3)记录界面移动情况建立界面迁移速率、界面宽度和物质浓度的标准曲线,计算出固相物质表面发生反应的物质浓度(或配体置换反应速率)。本方法操作流程简便,成本低,具有可视化且不需要依赖昂贵仪器的优点。
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公开(公告)号:CN113567206A
公开(公告)日:2021-10-29
申请号:CN202110819413.2
申请日:2021-07-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N1/28
Abstract: 本发明公开了一种基于金属有机骨架纳米材料的膜蛋白及膜相关蛋白提取方法;包括如下步骤:S1、制备ZIF‑67悬液,使ZIF‑67纳米材料充分分散于NH4HCO3溶液;S2、将ZIF‑67悬液与细胞裂解液混合孵育,利用ZIF‑67与膜蛋白的疏水相互作用吸附膜蛋白及膜相关蛋白;S3、使用SDS洗脱膜蛋白及膜相关蛋白,并对其进行质谱分析。本发明根据ZIF‑67纳米材料和膜蛋白疏水结构域之间的相互作用,可以选择性地捕获膜蛋白及膜相关蛋白。本发明适用于细胞、组织、微生物中膜蛋白及膜相关蛋白的分离提取,是一种简单且高效的膜蛋白及膜相关蛋白提取方法,有助于膜蛋白及膜相关蛋白的生物医药应用。
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公开(公告)号:CN107011483B
公开(公告)日:2020-01-07
申请号:CN201710225043.3
申请日:2017-04-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C08F220/56 , C08F220/06 , C08F222/38 , C08F2/44 , C08K3/16 , C07K1/26
Abstract: 本发明提供了一种用于电泳分离的交联结构复合凝胶及其制备方法,其如式I所示:该制备方法包括如下步骤:将丙烯酰胺与第一交联剂加入水中,混匀后依次加入单体、第二交联剂、缓冲液、变性剂、引发剂和催化剂,形成混合水溶液,进行反应,得到所述具有交联结构的复合凝胶。前述的具有交联结构的复合凝胶在电泳分离分子量小于30kDa蛋白质中的用途。本发明具有如下的有益效果:复合凝胶的分辨率和力学性能均有明显提高;制备方法简单,原料选择范围大;可适用于分子量小于30kDa多肽的分离。
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公开(公告)号:CN106248668B
公开(公告)日:2019-08-23
申请号:CN201610847979.5
申请日:2016-09-23
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/79
Abstract: 一种基于移动反应界面电泳滴定的定量酶联免疫吸附检测方法,通过在相同条件下分别对抗原浓度不同且已知的标准样品进行ELISA‐MRB‐ET,从而建立移动反应界面的移动距离与抗原浓度的数学模型,并沿电泳通道标注抗原浓度标尺;在测试阶段通过对待测样品在相同条件下进行ELISA‐MRB‐ET,测得的移动反应界面的停留位置所应的浓度刻度即为样品中的抗原浓度;本发明设计合理,不需昂贵仪器即可定量检测,降低成本,并可实现高通量检测。
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公开(公告)号:CN105675774B
公开(公告)日:2018-10-23
申请号:CN201610035433.X
申请日:2016-01-19
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N30/14
Abstract: 本发明公开了一种唾液外泌体的制备方法及其在分子诊断中的应用;包括以下步骤:从唾液样品中去除高丰度蛋白,滤去黏蛋白,分离提取外泌体,对所得外泌体进行表征,提取外泌体蛋白,对蛋白进行鉴定,并应用与肺癌生物标志物的发现。目前尚没有规范化的唾液外泌体制备技术,现有制备技术存在高丰度蛋白干扰和背景杂质干扰,导致外泌体回收率低、鉴定蛋白少等不足,难以反映真实的外泌体蛋白组学信息。本发明以成人健康志愿者和肺癌患者的唾液为样本,采用亲和层析色谱和膜分离结合技术,在去除了唾液的高丰度蛋白和黏蛋白后,通过离心提取唾液中的外泌体,并对其蛋白组进行分析,鉴定到了更多的外泌体蛋白。
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公开(公告)号:CN107011483A
公开(公告)日:2017-08-04
申请号:CN201710225043.3
申请日:2017-04-07
Applicant: 上海交通大学
IPC: C08F220/56 , C08F220/06 , C08F222/38 , C08F2/44 , C08K3/16 , C07K1/26
Abstract: 本发明提供了一种用于电泳分离的交联结构复合凝胶及其制备方法,其如式I所示:该制备方法包括如下步骤:将丙烯酰胺与第一交联剂加入水中,混匀后依次加入单体、第二交联剂、缓冲液、变性剂、引发剂和催化剂,形成混合水溶液,进行反应,得到所述具有交联结构的复合凝胶。前述的具有交联结构的复合凝胶在电泳分离分子量小于30kDa蛋白质中的用途。本发明具有如下的有益效果:复合凝胶的分辨率和力学性能均有明显提高;制备方法简单,原料选择范围大;可适用于分子量小于30kDa多肽的分离。
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