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公开(公告)号：CN113234848B
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202110578666.5
申请日：2021-05-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与杨树气孔形态、光合效率相关的分子标记，所述分子标记为SNP标记，其位于杨树基因组ZCWCC3基因下游第3140位碱基处，具有C/T多态性，其中，分子标记的基因型为CC的杨树个体，具有较大的气孔宽度、气孔长宽比及较高的光合效率；分子标记的基因型为TT的杨树个体，具有较小的气孔宽度、气孔长宽比及较低的光合效率。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，且具有环境适应性，适用于区域育种和气候适应育种。本发明还提供了用于扩增所述分子标记的引物对、分子标记的应用、杨树遗传改良方法和预测杨树气孔形态、光合效率的系统，为杨树的分子标记辅助选择育种提供了重要基础。
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公开(公告)号：CN108467898B
公开(公告)日：2021-07-27
申请号：CN201710099761.0
申请日：2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto‑MIR475b基因的第1929位、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位以及Pto‑EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto‑MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位基因型为GG和Pto‑EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN111781343A
公开(公告)日：2020-10-16
申请号：CN202010690993.5
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/53 , C12Q1/6827
Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。
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公开(公告)号：CN109633092A
公开(公告)日：2019-04-16
申请号：CN201811591475.7
申请日：2018-12-25
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/00
CPC classification number: G01N33/0098
Abstract: 本发明提供了一种检测杨树干旱胁迫临界值的方法，属于杨树抗旱研究技术领域，所述方法包括以下步骤：1)将杨树苗移栽至土壤中进行管理，所述管理包括每2～4天浇水一次，浇至土壤透水；2)选取距杨树苗枝条顶端第3～5片功能叶中的1片进行叶片的生理特性参数测定；3)每36～60h重复步骤2)所述的操作；4)利用统计学方法分析步骤2)和步骤3)获得的生理特性参数，当叶片的叶水势、净光合速率、气孔导度、超氧化物歧化酶活性、过氧化物酶活性、过氧化氢酶活性显著降低，并且相对电导率、丙二醛含量、脯氨酸含量显著提高时，记录的土壤含水量即为杨树干旱胁迫临界值。本发明所述方法能够科学准确地检测杨树干旱胁迫的临界值。
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公开(公告)号：CN108467900A
公开(公告)日：2018-08-31
申请号：CN201710100726.6
申请日：2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状。利用本发明的方法能够预测出杨树的生长性状，选育出速生杨树，缩短育种周期。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106636389A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201611163560.4
申请日：2016-12-15
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2537/165 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明提供了一种木质素合成途径中上位性效应检测方法，包括以下步骤：1)根据已知木质素合成通路，选取参与合成木质素单体的基因作为目的基因；2)对待测样品目的基因进行InDel位点基因型分型，获得待测样品的基因型数据；3)根据待测样品的基因型数据和待测样品的木质素含量，用epiSNP软件计算目的基因的上位性效应位点；4)对上位性效应位点间的上位性效应的显著性进行检测验证。本发明所述方法利用InDel位点基因型分型，采用简单的PCR就可以精准、简便的测定木质素合成通路中的上位性效应，实验技术成熟，操作简便，检测通量高。
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公开(公告)号：CN104293896A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298870.7
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2525/101 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN104293895A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298854.8
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法及试剂盒。该方法包括以下步骤：S1，收集毛白杨种质资源；S2，提取步骤S1中毛白杨的基因组DNA；S3，PCR扩增在毛白杨全基因组区域开发的多态性微卫星DNA标记；S4，利用UPGMA-聚类分析逐次随机取样及STRUCTURE模型重检测联合分析法构建8%～30%不等规模的候选核心种质群体；S5，通过比较候选核心种质群体与原群体在分子遗传多样性及数量性状变异水平上的差异，确定15%的核心种质群体。一方面可以较好的反映该物种表型性状多样性，避免遗漏珍贵的种质资源，另一方面，能够为后期开展分子标记定向选择育种提供较好的种质资源材料。
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公开(公告)号：CN113151560B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202110497127.9
申请日：2021-05-07
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/113 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种筛选高气孔密度、高光合效率杨树的分子标记，所述分子标记为SNP分子标记组合，由SNP1和SNP2两个SNP位点组成，其中，所述SNP1位于杨树基因组ALMT12基因下游第1182位碱基，具有A/T多态性；所述SNP2位于杨树基因组WRKY32基因上游第94位碱基，具有A/C多态性，上述两个位点组成的分子标记组合，能够在杨树幼苗期精准高效地筛选高气孔密度以及高光合效率的树种，缩短杨树育种周期。本发明还公开了用于检测上述分子标记的引物组及其应用、标记的获得方法、预测杨树气孔密度和光合效率的方法及杨树遗传改良方法等，能够显著提高杨树优异种质资源的选育效率。
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公开(公告)号：CN113234848A
公开(公告)日：2021-08-10
申请号：CN202110578666.5
申请日：2021-05-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与杨树气孔形态、光合效率相关的分子标记，所述分子标记为SNP标记，其位于杨树基因组ZCWCC3基因下游第3140位碱基处，具有C/T多态性，其中，分子标记的基因型为CC的杨树个体，具有较大的气孔宽度、气孔长宽比及较高的光合效率；分子标记的基因型为TT的杨树个体，具有较小的气孔宽度、气孔长宽比及较低的光合效率。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，且具有环境适应性，适用于区域育种和气候适应育种。本发明还提供了用于扩增所述分子标记的引物对、分子标记的应用、杨树遗传改良方法和预测杨树气孔形态、光合效率的系统，为杨树的分子标记辅助选择育种提供了重要基础。
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