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公开(公告)号：CN113151560A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110497127.9
申请日：2021-05-07
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/113 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种筛选高气孔密度、高光合效率杨树的分子标记，所述分子标记为SNP分子标记组合，由SNP1和SNP2两个SNP位点组成，其中，所述SNP1位于杨树基因组ALMT12基因下游第1182位碱基，具有A/T多态性；所述SNP2位于杨树基因组WRKY32基因上游第94位碱基，具有A/C多态性，上述两个位点组成的分子标记组合，能够在杨树幼苗期精准高效地筛选高气孔密度以及高光合效率的树种，缩短杨树育种周期。本发明还公开了用于检测上述分子标记的引物组及其应用、标记的获得方法、预测杨树气孔密度和光合效率的方法及杨树遗传改良方法等，能够显著提高杨树优异种质资源的选育效率。
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公开(公告)号：CN113025741A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN202110255234.0
申请日：2021-03-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，所述聚合育种模块包括1个单体型分子标记和1个上位性分子标记，其中，所述单体型分子标记由标记1、标记2、标记3、标记4组合而成，均位于杨树ALG14基因内，所述上位性标记为SNP标记，位于杨树IRX15‑L基因上游第980位碱基处。本发明公开的改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述标记的引物组、试剂盒及其应用、改善杨树木材品质的方法，能够在分子水平对杨树的4种木材重要品质性状做出精准评价，提高单位时间内育种群体的木材品质。
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公开(公告)号：CN113005214A
公开(公告)日：2021-06-22
申请号：CN202110064846.1
申请日：2021-01-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了与毛白杨抗旱性状相关的分子标记及其单倍型组合，所述分子标记选自SNP1、SNP2和SNP3中的一个，分子标记组合由SNP1、SNP2和SNP3三个标记组合而成，所述分子标记组合按SNP 1～SNP3依次为A、T、C纯合基因型，即为AA‑TT‑CC基因型组合时，对应的毛白杨具有最强的抗旱能力，利用上述分子标记及其组合，能够在分子水平对毛白杨的抗旱性状做出精准评价，在杨树幼苗期精准、高效地筛选出抗旱种质。本发明还公开了利用上述分子标记鉴定或筛选抗旱能力强的毛白杨的方法及对毛白杨进行遗传改良的方法等，为毛白杨分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
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公开(公告)号：CN106755378B
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN201611143309.1
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6809
Abstract: 本发明提供了一种检测miRNA来源的方法，包括以下步骤：1)提供物种的待检测miRNA前体序列的信息；2)提供假基因数据库中所述物种的假基因信息；3)将所述待检测miRNA前体序列与所述物种假基因的核苷酸序列的物理位置比较是否重合，将与待检测miRNA前体序列具有重合度的假基因确定候选假基因；4)根据待检测miRNA前体序列与所述物种基因组的假基因序列在染色体所在的物理位置计算两类序列的重合度I；5)当所述重合度I符合1≧I>0.3条件时，确定待检测miRNA是由所述候选假基因所产生。本发明不仅填补了miRNA和假基因两者关系的研究空白，还可以批量发掘基因组中具有潜在生物功能的假基因，为基因调节网络的构建提供候选假基因。
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公开(公告)号：CN111863127A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010690681.4
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法，属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后；确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP；确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因；当同时满足确定条件时，表明待测转录因子调控了候选靶基因表达，可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系，构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106702007B
公开(公告)日：2020-04-17
申请号：CN201710118877.4
申请日：2017-03-02
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种高分辨率核酸结合/熔解荧光检测方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供的高分辨率核酸结合/熔解荧光检测方法，包括以下步骤：1)预测RNA‑RNA相互作用区域；2)所述RNA‑RNA相互作用区域内序列多态性分析；3)以所述步骤2)得到的相互作用区域内的含1～5个靶位点的序列为模板，合成相互作用区域内的寡核苷酸片段；4)利用Realtime‑PCR对升温与降温过程中相互作用的寡核苷酸片段结合产生的荧光强度数值进行检测；5)根据所述荧光强度数值绘制荧光变化曲线。本发明提供的检测方法检测效率高、灵活性好，且配套条件简单，实验成本低。
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公开(公告)号：CN106521002B
公开(公告)日：2019-09-03
申请号：CN201611198895.X
申请日：2016-12-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用及试剂盒，属于分子遗传技术领域。本发明提供了一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用，所述SNP位点为毛白杨PetC基因第2068位、第2347位和第2457位碱基。利用本发明的应用能够实现光合能力强和生长快的杨树的快速筛选，大大加速育种进程。
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公开(公告)号：CN109554496A
公开(公告)日：2019-04-02
申请号：CN201811542646.7
申请日：2018-12-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种检测胁迫处理前后植物中转座子活性变化的方法，属于遗传学技术领域，所述方法包括以下步骤：1)分别提取胁迫处理前与处里后样品的总RNA；2)利用所述总RNA分别构建胁迫处理前、后样品的cDNA文库；3)对所述cDNA文库进行测序；4)从测序原始数据中分别筛选siRNA，合并筛选到的siRNA从而获得总siRNA，对所述总siRNA进行cluster聚类；5)利用repeatmasker软件提取全基因组数据中的repeat，得出所述植物全基因组转座子位置信息；6)通过siRNA cluster表达量变化得到处理前后植株中转座子的活性变化。所述方法填补了植物转座子活性检测领域的技术空白。
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公开(公告)号：CN109338011A
公开(公告)日：2019-02-15
申请号：CN201811563126.4
申请日：2018-12-20
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种高通量筛选植物基因组等位不平衡表达的杂合变异位点的方法，属于遗传学研究领域，包括以下步骤：1)外源调控因素处理植物材料获得处理样品；2)提取处理样品和对照样品的总RNA，构建链特异性测序文库并进行高通量测序；3)过滤所述原始测序数据获得clean reads；4)将所述clean reads分别与参考基因组进行比对获得比对结果；5)删除比对结果中多余复制读段，将出现INDEL位点周围的序列进行重新比对获得最终比对结果数据；6)将所述最终比对结果数据进行等位位点变异筛选获得等位不平衡表达的杂合变异位点。所述方法解决了在等位水平上解析基因组对外界环境响应的分析难题。
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公开(公告)号：CN109214591A
公开(公告)日：2019-01-15
申请号：CN201811187160.6
申请日：2018-10-12
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种木本植物地上生物量预测方法及系统。所述方法首先获取BP神经网络的输入向量(木本植物的茎长、叶片数和根数)和输出向量(木本植物的茎叶鲜重和茎叶干重)；根据所述输入向量和输出向量构建地上生物量预测的BP神经网络模型；然后根据多个训练样本对BP神经网络模型进行循环往复训练，生成训练后的BP神经网络模型，即可直接采用训练后的BP神经网络模型预测木本植物的地上生物量(茎叶鲜重和茎叶干重)。所述训练后的BP神经网络模型选用木本植物表型特征(茎长、叶片数和根数)作为自变量，降低了样本数据获取的复杂度和获取时间，无需耗费大量人力物力；由于表型特征和地上生物量联系紧密，因此预测结果具有很高的准确率。
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