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公开(公告)号:CN112048464A
公开(公告)日:2020-12-08
申请号:CN202010993617.3
申请日:2020-09-21
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种用于制备毛白杨叶片和/或根组织原生质体的组合物及其试剂和方法,属于植物原生质体制备技术领域。本发明提供的用于制备毛白杨叶片和/或根组织原生质体的组合物,包括纤维素酶和浸解酶,所述纤维素酶的酶活为250~350U/g,所述浸解酶的酶活为700~900U/g,所述纤维素酶和浸解酶的质量比为(14.5~15.5):(3.5~4.5)。本发明通过纤维素酶和浸解酶组合使用对毛白杨叶片和/或根组织进行酶解,既保持了原生质体的高活性,且获得的原生质体的数量多,酶的价格又相对廉价,降低了成本,可以满足后续试验研究的要求。
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公开(公告)号:CN109545278B
公开(公告)日:2020-07-28
申请号:CN201811549079.8
申请日:2018-12-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/00 , G16B30/00 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法,涉及分子遗传学技术领域,包括获得lncRNA与基因的群体SNP基因型数据;获得基因在所研究组织的群体表达量数据;获得目标性状群体表型数据;将群体SNP基因型数据与目标性状群体表型数据关联分析;将群体SNP基因型数据与群体表达量数据关联分析;计算群体SNP基因型数据与所述目标性状群体表型数据的相关性系数r;当同时满足3个限定条件时,表明lncRNA与基因有相互作用,共同影响植物目标性状的表型变异。采用该方法准确检测毛白杨lncRNA LNC‑0052611与基因Pto‑COMT25之间存在互作关系,且该互作关系影响了毛白杨胸径的表型变异。
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公开(公告)号:CN111386787A
公开(公告)日:2020-07-10
申请号:CN202010363701.7
申请日:2020-04-30
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种椴树种子快速萌发方法,属于林木遗传育种技术领域。本发明所述萌发方法包括以下步骤:1)将椴树种子在90~100℃下处理2~10s,在24~26℃的水中浸泡24~48h;2)将吸涨的种子在脱落酸受体抑制剂中进行第一暗培养;3)将第一暗培养的椴树种子进行第二暗培养;4)将第二暗培养的种子转移至基质中进行培养。本发明所述萌发方法可低成本、快速、高效完成椴树种子的萌发,将为椴树种质资源保存以及优良新品种选育提供强有力的技术支持。
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公开(公告)号:CN106997429B
公开(公告)日:2019-12-03
申请号:CN201611198893.0
申请日:2017-02-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B15/30
Abstract: 本发明涉及一种林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法,属于分子遗传技术领域。本发明提供的林木长片段非编码RNA靶基因的预测方法包括以下步骤:1)获得林木lncRNA序列;2)利用blast预测方法得到初步筛选后的lncRNA的靶基因;3)利用RNAplex预测方法得到二次筛选后的lncRNA的靶基因;4)对所述步骤3)中的lncRNA及二次筛选后的lncRNA的靶基因的组织特异性表达模式进行检测,计算两者的表达相关性,确定lncRNA及其靶基因之间的相互作用关系。本发明预测方法能够高效、稳定地检测lncRNA及其靶基因的作用区段,并且能够显著提高林木lncRNA靶基因预测的准确性。
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公开(公告)号:CN109754844A
公开(公告)日:2019-05-14
申请号:CN201910020480.0
申请日:2019-01-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B30/00
Abstract: 本发明提供了一种在全基因组水平上预测植物内源siRNAs的方法,属于生物信息学技术领域,所述方法利用MITE-Hunter在植物全基因组序列数据中检测MITEs元件,并以此为基础,预测24-nt siRNA,最后运用Pln24NT验证siRNA。本发明联合这两个生物信息学工具能够增加预测通量,进而在大数据量的基础上快速预测出siRNA,并且该方法是一种植物普遍适用的方法。
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公开(公告)号:CN109526677A
公开(公告)日:2019-03-29
申请号:CN201811454975.6
申请日:2018-11-30
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种扦插苗的壮根基质及扦插方法,涉及扦插育苗技术领域。本发明所述壮根基质包括以下重量份的原料:中壤质土1.5~3份,蛭石0.6~1.5份,珍珠岩0.6~1.5份,草炭1.5~2.8份,花多多15号0.05~0.2份。本发明在扦插时,先用细砂土进行萌苗生根,再将生根萌苗移栽至壮根基质上生长直至炼苗移栽大田,利用本发明的方法,不仅可以控制萌苗生根率达90.71~95.88%,还可以将移栽成活率提升到89.82~94.70%。
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公开(公告)号:CN109402285A
公开(公告)日:2019-03-01
申请号:CN201811332420.4
申请日:2018-11-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种基于全基因组DNA甲基化位点基因型的分型方法,涉及植物分子育种技术领域,包括提取相同组织样品的基因组DNA;建立重亚硫酸盐处理的DNA文库,再进行测序,根据测序结果鉴定每个样品的DNA甲基化位点,计算甲基化支持率,根据甲基化位点的DNA甲基化支持率进行基因型分型。本发明提供的方法能够实现DNA甲基化位点等位基因型分型,而且本发明提供的分型方法是在相同时间点采取群体内不同个体的同一组织,可以排除环境效应以及生长状态对DNA甲基化状态的影响。本发明提供的方法利用高通量测序技术方法,对DNA甲基化位点的基因型进行精准分型。
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公开(公告)号:CN109371166A
公开(公告)日:2019-02-22
申请号:CN201811582470.8
申请日:2018-12-24
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种高通量检测植物circRNA等位位点差异表达的方法,属于基因表达检测技术领域,所述方法包括以下步骤:1)提取植物样品总RNA,构建链特异性文库;2)用Illumina HiSeq对所述链特异性文库进行双端测序;3)从原始测序数据中筛选circRNAs数据;4)提取circRNAs数据中circRNAs成环处的反向剪接reads;5)对所述反向剪接reads进行单核苷酸变异检测;6)统计所述反向剪接reads中比对到所述SNP位点的不同基因型的reads数,以比对到不同基因型的reads数的比例为不同基因型的表达量比例。所述方法可以高通量、准确检测circRNA等位位点的差异表达。
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公开(公告)号:CN109197598A
公开(公告)日:2019-01-15
申请号:CN201811453977.3
申请日:2018-11-30
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明提供了一种毛白杨组培方法,涉及植物组织培养技术领域。本发明所述方法包括以下步骤:以毛白杨组织为外植体,将所述外植体接种于诱导增殖培养基上进行诱导增殖培养,得增殖芽;将所述增殖芽接种于诱导生根培养基上进行诱导生根培养,得毛白杨组培苗。本发明所述方法不包括传统意义的初代培养,而是直接将外植体材料在消毒后按照材料老化程度直接接种于添加激素的S1或S2进行培养,诱导不定芽产生增殖芽,从而进行生根培养,方案简单,组培效率高,外植体分化芽诱导率达90%,生根诱导率达88.5%。
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公开(公告)号:CN108509770A
公开(公告)日:2018-09-07
申请号:CN201710359550.6
申请日:2017-05-19
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明公开了一种确定林木基因组中假基因的方法,其包括以下步骤:获得待测林木的基础生物信息,所述基础生物信息包括蛋白质序列、基因组序列和功能基因的染色体位置;利用Pseudopipe法对所述待测林木进行假基因鉴定处理,以便获得原始假基因数据;对所述原始假基因数据进行重复项删除处理,以便获得候选假基因数据;以及根据功能基因和假基因在染色体上的物理位置信息,对所述候选假基因数据进行去除假阳性处理,以便确定所述待测林木基因组中的假基因。利用该方法能够有效地确定林木基因组中的假基因,并且该方法操作简单,易于掌握,需时短,无需额外的配套条件,成本低,且所得结果准确性好,可靠度高,适于推广。
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