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公开(公告)号:CN119753187A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202510022446.2
申请日:2025-01-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京京东方知微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/325 , C12R1/32
Abstract: 本发明提供了一种鉴定分枝杆菌菌种的引物探针组合、试剂盒及其鉴定方法和应用,属于生物技术领域。本发明的引物探针组合至少包括1对引物和1条探针用于鉴定鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌,6对引物和6条探针分别用于鉴定脓肿分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、偶然分枝杆菌、海分枝杆菌/溃疡分枝杆菌、戈登分枝杆菌和瘰疬分枝杆菌,2对引物和2条探针用于鉴定结核分枝杆菌复合群,1对引物和1条探针用于鉴定内标。本发明可实现1个样本同步检测多个指标(最多9个指标),同时鉴定结核分枝杆菌复合群和多种非结核分枝杆菌;且检测灵敏度高,结核分枝杆菌复合群最低检出限为50CFU/mL,非结核分枝杆菌最低检出限为500CFU/mL。
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公开(公告)号:CN119360138B
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202411918367.1
申请日:2024-12-24
Applicant: 捷仪科技(北京)有限公司 , 中国医学科学院北京协和医院
IPC: G06V10/764 , G01B11/08 , G06N5/01 , G06V10/26 , G06V10/80 , G06V10/82 , G06N3/0455 , G06N3/08 , G06V20/70
Abstract: 本申请公开一种药敏纸片的抑菌圈测量方法、系统及相关装置。涉及生物医学工程领域,包括:获取培养皿的图像并对培养皿的图像进行图像增强处理,获得目标培养皿图像;从目标培养皿图像中获取药敏纸片上记录的药物信息,获取培养实验信息;将药物信息和培养实验信息输入预设决策树模型,获得预设决策树模型输出的目标抑菌圈类别,预设决策树模型中的节点按照预设标准中影响抑菌圈的影响因素进行划分;将目标培养皿图像和目标抑菌圈类别输入预设多模态分割模型中,获取目标抑菌圈图像范围;将目标培养皿图像中的目标抑菌圈图像范围进行换算,获得培养皿中抑菌圈的物理尺寸。本方法选择更符合当前药敏纸片的抑菌圈范围,提高抑菌圈测量的准确性。
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公开(公告)号:CN117551801A
公开(公告)日:2024-02-13
申请号:CN202311247272.7
申请日:2023-09-25
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/53 , C12R1/72
Abstract: 本公开涉及用于近平滑念珠菌氟康唑耐药性检测的新分子标记及其应用、检测方法及系统,其中,所述分子标记包括ERG11基因,所述ERG11基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示,通过检测该ERG11基因的拷贝数判定近平滑念珠菌是否具有氟康唑耐药性,能够至少部分地实现近平滑念珠菌氟康唑耐药性的快速且高特异性的检测。
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公开(公告)号:CN117144067A
公开(公告)日:2023-12-01
申请号:CN202311421114.9
申请日:2023-10-31
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京卡尤迪生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请提供了用于多重化核酸检测的组合物和方法,特别是用于分析物检测的系统、方法、组合物和试剂盒。所述系统、方法、组合物和试剂盒可以允许多种分析物的多重分析。本申请提供的组合物包含用于实施所述方法的各种探针、酶、标记物部分、淬灭剂部分或引物。此外,本申请提供了用于分析物检测的分析方法以及用于实施该方法的装置和/或系统。
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公开(公告)号:CN116952684A
公开(公告)日:2023-10-27
申请号:CN202310961352.2
申请日:2023-08-01
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京京东方知微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种样本处理装置及样本处理方法,其中,样本处理装置包括样本处理容器,样本处理容器具有用于盛放样本和样本处理液的容纳空间,容纳空间内设置有碰撞体,碰撞体能够在容纳空间内运动,且碰撞体在运动的过程中能够与样本处理容器的内壁碰撞,以加速样本的前处理过程。和现有技术相比,本发明所公开的样本处理装置,由于设置了碰撞体,因此,在样本处理液对样本进行前处理时增加了机械力的作用,从而有效缩短了样本前处理时间,提高了样本前处理效率。
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公开(公告)号:CN118212987B
公开(公告)日:2024-08-20
申请号:CN202410628294.6
申请日:2024-05-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备,涉及基因技术领域,该方法包括:获取待测样本的测序数据;对测序数据进行预处理,获得目标测序数据;将目标测序数据与物种数据库进行比对,获得目标物种序列数据集,对目标物种序列数据集进行序列组装,获得组装结果;对组装结果进行基因预测,获得基因预测结果;对各个基因预测结果进行去冗余处理,得到各个非冗余基因序列;将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对,获得每个非冗余基因序列对应的注释结果;基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法,能够准确地确定出耐药基因序列。
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公开(公告)号:CN115744090A
公开(公告)日:2023-03-07
申请号:CN202211551494.3
申请日:2022-12-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京卡尤迪生物科技股份有限公司
Abstract: 本公开涉及一种送料组件以及具有所述送料组件的核酸采样系统。所述送料组件包括所述送料架上设置有用于物料通过的第一运料通道和第二运料通道,且设置有单个物料出口,第一运料通道和第二运料通道均与所述物料出口连通。所述送料组件还包括切换件,所述切换件能够相对于所述送料架在第一位置和第二位置之间运动,其中当所述切换件处于第一位置,所述切换件不阻挡第一运料通道的物料行进到所述物料出口且阻挡第二运料通道的物料行进到所述物料出口,且当所述切换件处于第二位置,所述切换件阻挡第一运料通道的物料行进到所述物料出口且不阻挡第二运料通道的物料行进到所述物料出口。
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公开(公告)号:CN119753219A
公开(公告)日:2025-04-04
申请号:CN202510021958.7
申请日:2025-01-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京京东方知微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/685 , C12R1/66 , C12R1/68 , C12R1/67
Abstract: 本发明提供了一种曲霉菌分种检测的引物探针组合、试剂盒及其检测方法和应用,属于生物技术领域。本发明的曲霉菌分种检测的引物探针组合包括针对烟曲霉、黄曲霉、土曲霉和黑曲霉的特异性引物和探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.12所示,还包括内参的特异性引物和探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.15所示。本发明具有高灵敏度、高特异性以及多靶标检测的优势;相比于普通PCR需要用凝胶电泳验证的繁琐步骤,具有操作简便、快速的优点。
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公开(公告)号:CN118212987A
公开(公告)日:2024-06-18
申请号:CN202410628294.6
申请日:2024-05-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备,涉及基因技术领域,该方法包括:获取待测样本的测序数据;对测序数据进行预处理,获得目标测序数据;将目标测序数据与物种数据库进行比对,获得目标物种序列数据集,对目标物种序列数据集进行序列组装,获得组装结果;对组装结果进行基因预测,获得基因预测结果;对各个基因预测结果进行去冗余处理,得到各个非冗余基因序列;将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对,获得每个非冗余基因序列对应的注释结果;基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法,能够准确地确定出耐药基因序列。
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公开(公告)号:CN117911430A
公开(公告)日:2024-04-19
申请号:CN202410308761.7
申请日:2024-03-19
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京小蝇科技有限责任公司
IPC: G06T7/10 , G06T7/00 , G06N3/0455 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开了一种基于transformer的交互式微生物图像分割方法和装置,所述方法包括:响应于提示指令,获取待分割的原始图像,所述原始图像上具有与所述提示指令对应的提示标记;将所述原始图像和所述提示标记输入预先训练的图像分割模型,以得到所述图像分割模型输出的分割结果;其中,所述图像分割模型的网络结构包括:编码器,所述编码器用于将输入的所述原始图像进行多个维度的特征提取,并结合所述提示标记的类型,将图像特征与提示标记特征进行融合,以得到融合特征;所述提示标记的类型包括稀疏型和密集型;解码器,所述解码器用于将所述融合特征进行解码,以得到目标区域的分割掩码。提高微生物图像的分割结果准确性和操作灵活性。
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